43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2502 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2502  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  882    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.109419  hitchhiker  0.000366743 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1764  hypothetical protein  42.96 
 
 		 441 aa  345  1e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2739  type III effector Hrp-dependent outers  45.91 
 
 		 439 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.176872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3021  type III effector Hrp-dependent outers  42.92 
 
 		 438 aa  332  8e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3476  hypothetical protein  42.96 
 
 		 441 aa  331  2e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.380975  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2604  type III effector Hrp-dependent outers  41.84 
 
 		 439 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1991  type III effector Hrp-dependent outers  43.09 
 
 		 440 aa  323  3e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.28954  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3502  type III effector Hrp-dependent outers  42.31 
 
 		 439 aa  321  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.780183  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2035  type III effector Hrp-dependent outers  44.04 
 
 		 449 aa  319  7e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0275418  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1666  hypothetical protein  42.44 
 
 		 445 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.483704  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1363  hypothetical protein  42.44 
 
 		 445 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25801  hypothetical protein  41.85 
 
 		 480 aa  296  3e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1689  hypothetical protein  38.55 
 
 		 449 aa  291  2e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17891  hypothetical protein  37.67 
 
 		 449 aa  290  4e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17841  hypothetical protein  37.94 
 
 		 450 aa  289  6e-77  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0048  hypothetical protein  41.24 
 
 		 444 aa  288  2e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18061  hypothetical protein  37.8 
 
 		 449 aa  284  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0158  hypothetical protein  40.89 
 
 		 448 aa  280  4e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.161718  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17181  hypothetical protein  37.2 
 
 		 457 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0804428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1171  hypothetical protein  34.35 
 
 		 450 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20461  hypothetical protein  34.14 
 
 		 450 aa  261  3e-68  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0188  hypothetical protein  40.23 
 
 		 448 aa  249  9e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.46953  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00873  conserved hypothetical protein  28.95 
 
 		 488 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.410589 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00600  hypothetical protein  30.46 
 
 		 455 aa  154  2.9999999999999998e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.172586  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0504  hypothetical protein  28.17 
 
 		 491 aa  148  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.257323 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1455  type III effector Hrp-dependent outers  31.45 
 
 		 457 aa  140  4.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.177504 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0272  hypothetical protein  27.73 
 
 		 502 aa  133  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0654  hypothetical protein  29.08 
 
 		 411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.603947  normal  0.367778 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0128  hypothetical protein  24.57 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0691  type III effector Hrp-dependent outers  24.55 
 
 		 422 aa  61.6  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.224944  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0648  type III effector Hrp-dependent outers  25.45 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1535  type III effector Hrp-dependent outers  23.66 
 
 		 425 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6294  type III effector Hrp-dependent outers  23.66 
 
 		 425 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830951  normal  0.498392 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5964  type III effector Hrp-dependent outers  23.08 
 
 		 427 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3378  hypothetical protein  25.35 
 
 		 262 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6953  hypothetical protein  24.07 
 
 		 425 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.658716  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0452  type III effector Hrp-dependent outers  27.45 
 
 		 455 aa  51.6  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.869243  normal  0.195749 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2151  hypothetical protein  42.65 
 
 		 356 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2623  type III effector Hrp-dependent outers  24.59 
 
 		 399 aa  49.7  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.687659  hitchhiker  0.00259914 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4427  hypothetical protein  27.2 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6106  hypothetical protein  26.61 
 
 		 432 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3707  type III effector Hrp-dependent outers  23.45 
 
 		 439 aa  43.9  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.0000100596  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2454  type III effector Hrp-dependent outers  27.22 
 
 		 440 aa  43.9  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>