More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0692 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0692  cysteinyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 499 aa  1019    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1967  cysteinyl-tRNA synthetase  72.29 
 
 		 493 aa  680    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.5206 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08671  cysteinyl-tRNA synthetase  74.4 
 
 		 511 aa  750    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12151  cysteinyl-tRNA synthetase  67.27 
 
 		 516 aa  713    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.532713 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15891  cysteinyl-tRNA synthetase  57.31 
 
 		 500 aa  606  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.854558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0749  cysteinyl-tRNA synthetase  56.51 
 
 		 500 aa  595  1e-169  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.11479  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13051  cysteinyl-tRNA synthetase  54.11 
 
 		 492 aa  570  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13161  cysteinyl-tRNA synthetase  54.93 
 
 		 489 aa  569  1e-161  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0372399  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1237  cysteinyl-tRNA synthetase  55.42 
 
 		 489 aa  569  1e-161  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13301  cysteinyl-tRNA synthetase  55.44 
 
 		 489 aa  565  1e-160  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2722  cysteinyl-tRNA synthetase  57 
 
 		 486 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.688362 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0458  cysteinyl-tRNA synthetase  56.49 
 
 		 484 aa  561  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0471  cysteinyl-tRNA synthetase  56.69 
 
 		 484 aa  560  1e-158  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.361627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5208  cysteinyl-tRNA synthetase  56.63 
 
 		 494 aa  548  1e-155  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1662  cysteinyl-tRNA synthetase  57.92 
 
 		 478 aa  551  1e-155  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.69895  normal  0.620733 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4002  cysteinyl-tRNA synthetase  54.47 
 
 		 489 aa  544  1e-153  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.993734 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3718  cysteinyl-tRNA synthetase  55.31 
 
 		 486 aa  536  1e-151  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0710  cysteinyl-tRNA synthetase  55.47 
 
 		 486 aa  530  1e-149  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0031  cysteinyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 		 493 aa  431  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.173028  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1634  cysteinyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 		 493 aa  426  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0430499 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2121  cysteinyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 		 485 aa  424  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00371034  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0107  cysteinyl-tRNA synthetase  48.7 
 
 		 459 aa  419  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2051  cysteinyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 		 461 aa  416  9.999999999999999e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0707347  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2253  cysteinyl-tRNA synthetase  44.65 
 
 		 465 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000105277  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0415  cysteinyl-tRNA synthetase  47.54 
 
 		 490 aa  416  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.148475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0404  cysteinyl-tRNA synthetase  46.83 
 
 		 487 aa  413  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.751484  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1554  cysteinyl-tRNA synthetase  46.6 
 
 		 485 aa  412  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1012  cysteinyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 		 468 aa  409  1e-113  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0482  cysteinyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 		 485 aa  409  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00357659 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0936  cysteinyl-tRNA synthetase  47.09 
 
 		 460 aa  409  1e-113  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0057  cysteinyl-tRNA synthetase  45.88 
 
 		 485 aa  409  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 481 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1122  cysteinyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 		 462 aa  405  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.189583  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2065  cysteinyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 468 aa  404  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00052706  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1667  cysteinyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 		 479 aa  403  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.67425  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1810  cysteinyl-tRNA synthetase  48.5 
 
 		 485 aa  400  9.999999999999999e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0706644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 		 466 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3365  cysteinyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 		 481 aa  396  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0509  cysteinyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 		 465 aa  395  1e-109  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1952  cysteinyl-tRNA synthetase  42.91 
 
 		 485 aa  397  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00515246  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0923  cysteinyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 456 aa  395  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1349  cysteinyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 		 470 aa  397  1e-109  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2865  cysteinyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 		 462 aa  396  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.95925 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3800  cysteinyl-tRNA synthetase  44.84 
 
 		 480 aa  393  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3883  cysteinyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 480 aa  395  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4174  cysteinyl-tRNA synthetase  45.49 
 
 		 494 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.801152  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0403  cysteinyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 		 474 aa  393  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00611212  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2249  cysteine--tRNA ligase  44.96 
 
 		 485 aa  390  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000746597  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1941  cysteinyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 		 465 aa  391  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2893  cysteinyl-tRNA synthetase  45.74 
 
 		 463 aa  389  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.751187  normal  0.0110862 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0500  cysteinyl-tRNA synthetase  45.78 
 
 		 455 aa  389  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.996276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1623  cysteinyl-tRNA synthetase  48.39 
 
 		 458 aa  389  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2737  cysteinyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 		 466 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2424  cysteinyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 466 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0846  cysteinyl-tRNA synthetase  43.26 
 
 		 466 aa  386  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000447814  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2507  cysteinyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 461 aa  388  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1844  cysteinyl-tRNA synthetase  47.4 
 
 		 463 aa  387  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00960  cysteinyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 		 484 aa  382  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000845689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2159  cysteinyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 465 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2510  cysteinyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 465 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0390951  hitchhiker  0.00182498 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1940  cysteinyl-tRNA synthetase  43.6 
 
 		 462 aa  383  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  44.6 
 
 		 473 aa  382  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.969575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003837  cysteinyl-tRNA synthetase  45.4 
 
 		 460 aa  385  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000455216  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3742  cysteinyl-tRNA synthetase  45.55 
 
 		 460 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.156882  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1656  cysteinyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 465 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000728192  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1645  cysteinyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 472 aa  383  1e-105  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0256229  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1361  cysteinyl-tRNA synthetase  45.73 
 
 		 488 aa  383  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0858  cysteinyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 		 473 aa  383  1e-105  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2681  cysteinyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 465 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124724  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0193  cysteinyl-tRNA synthetase  42.05 
 
 		 486 aa  383  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0980  cysteinyl-tRNA synthetase  44.93 
 
 		 465 aa  385  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3156  cysteinyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 465 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.719949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1432  cysteinyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 465 aa  385  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.224035  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2097  cysteinyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 465 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.466573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41360  cysteinyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 		 460 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.490011 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2043  cysteinyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 448 aa  384  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2596  cysteinyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 465 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0629177  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2545  cysteinyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 		 465 aa  385  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37953  predicted protein  43.54 
 
 		 497 aa  381  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.150647  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0089  cysteinyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 465 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0086  cysteinyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 465 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00483591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0085  cysteinyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 465 aa  380  1e-104  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1102  cysteinyl-tRNA synthetase  44.82 
 
 		 463 aa  380  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0100  cysteinyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 465 aa  380  1e-104  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.67266e-60 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1902  cysteinyl-tRNA synthetase  47 
 
 		 454 aa  380  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.478316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3090  cysteinyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 		 459 aa  379  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0089  cysteinyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 465 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000157643  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2571  cysteinyl-tRNA synthetase  45.16 
 
 		 461 aa  381  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897166  hitchhiker  0.0000307026 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3116  cysteinyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 459 aa  379  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000569576  decreased coverage  0.000000405781 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1263  cysteinyl-tRNA synthetase  44.12 
 
 		 505 aa  380  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.227331  normal  0.0688568 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1003  cysteinyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 488 aa  381  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0084  cysteinyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 465 aa  380  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01842  cysteinyl-tRNA synthetase  44.8 
 
 		 460 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5999  cysteinyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 		 465 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1670  cysteinyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 		 457 aa  379  1e-104  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0188  cysteinyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 478 aa  381  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.272447  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0090  cysteinyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 		 466 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000484516  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3508  cysteinyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 460 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2078  cysteinyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 		 465 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0265  cysteinyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 500 aa  381  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000351954  normal  0.0179812 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>