More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0503 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0503  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  100 
 
 
136 aa  273  5e-73  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0445749  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2172  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  88.97 
 
 
136 aa  246  8e-65  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.100722 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05011  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  71.43 
 
 
133 aa  199  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15581  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  71.85 
 
 
135 aa  198  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0971  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  67.16 
 
 
135 aa  184  3e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18391  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  65.67 
 
 
135 aa  179  1e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.827686 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16291  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  58.96 
 
 
134 aa  173  7e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16181  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  58.96 
 
 
134 aa  173  9e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16411  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  58.21 
 
 
134 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.662603  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1532  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  57.46 
 
 
134 aa  166  9e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3386  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  54.55 
 
 
137 aa  149  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5017  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  55.3 
 
 
138 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1938  ATP synthase F1 subuint epsilon  52.55 
 
 
137 aa  139  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.787383  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2297  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  52.21 
 
 
137 aa  135  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5089  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.97 
 
 
138 aa  133  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2316  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  59.81 
 
 
137 aa  130  6e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.711596  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3710  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.97 
 
 
136 aa  126  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.737709  normal  0.337608 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3656  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  46.97 
 
 
136 aa  126  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4790  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  35.34 
 
 
132 aa  85.9  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0874  ATP synthase F1, epsilon subunit  41.41 
 
 
135 aa  83.6  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0273  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.59 
 
 
134 aa  82.8  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.16135  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2609  ATP synthase F1, epsilon subunit  35.96 
 
 
135 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.182872  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2581  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.33 
 
 
134 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3735  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.59 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3149  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.95 
 
 
132 aa  73.2  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2189  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.33 
 
 
134 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2832  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.86 
 
 
134 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0984  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.31 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111243  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17790  ATP synthase F1, epsilon subunit  34.69 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2196  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  39.56 
 
 
134 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0216  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.57 
 
 
141 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3949  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.29 
 
 
138 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0062  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.33 
 
 
140 aa  68.2  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3367  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.36 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3414  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.67 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3405  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.6 
 
 
138 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3169  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.34 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00353797  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2082  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.07 
 
 
139 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.929878  normal  0.384385 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4264  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.34 
 
 
138 aa  67  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0027  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  38.95 
 
 
138 aa  67  0.00000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.155859  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4494  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  33.88 
 
 
132 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.023133 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3130  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.82 
 
 
138 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2136  ATP synthase F1, epsilon subunit  32.65 
 
 
137 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.06 
 
 
141 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3302  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.48 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2211  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.65 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.06 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.722454 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0950  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.82 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.594443  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3289  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.06 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4034  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.69 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000113371 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2948  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.06 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0123  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.06 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0098  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.06 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712946  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0107  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.06 
 
 
141 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5102  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.24 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3824  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.87 
 
 
133 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0084  ATP synthase F1, epsilon subunit  33.33 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.78895  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4190  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  37.21 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5395  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.24 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.03867e-36 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5154  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.24 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000334813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5525  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.24 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000524846  hitchhiker  0.00000000227919 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5546  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  28.24 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000710132  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4331  hypothetical protein  32.79 
 
 
142 aa  63.9  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.132194  normal  0.706309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1672  ATP synthase epsilon subunit  35.58 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.485979 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3457  ATP synthase F1, epsilon subunit  30.3 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1423  ATP synthase F1, epsilon subunit  29.67 
 
 
137 aa  63.5  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5429  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.87 
 
 
133 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.886017  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4986  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.87 
 
 
133 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.761733  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5004  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.87 
 
 
133 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000172013  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5481  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.87 
 
 
133 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5425  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.87 
 
 
133 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0122155  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0864  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.69 
 
 
137 aa  63.5  0.0000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0100749  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0607  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  30.53 
 
 
138 aa  63.5  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.444989  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0114  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  29.1 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.693828  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0434  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.58 
 
 
135 aa  63.5  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.639575  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2806  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.62 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.668633 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.82 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.952205  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3202  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.62 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.447549  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03615  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.43 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.901981  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4236  ATP synthase F1, epsilon subunit  36.43 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3026  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.06 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03559  hypothetical protein  36.43 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.772502  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2958  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.3 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5167  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.43 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0939649 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0177  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.3 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.313145  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4263  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.43 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  0.317947 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3354  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.3 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4461  ATP synthase F1, epsilon subunit  31.58 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000884862 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4099  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.43 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.420004 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3307  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.06 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.236426  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6135  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  34.34 
 
 
121 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3947  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.43 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0072  ATP synthase F1, epsilon subunit  38.38 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0836713  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2138  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  27.82 
 
 
134 aa  62.4  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0782971  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1586  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.3 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4246  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  36.43 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.014203  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4041  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.3 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3016  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.3 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3967  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  31.3 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3893  F0F1 ATP synthase subunit epsilon  32.06 
 
 
141 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159746  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>