45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2510 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2510  regulatory protein  100 
 
 		 284 aa  571  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0545339  normal  0.669571 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2693  regulatory protein  31.94 
 
 		 468 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1287  regulatory protein  31.92 
 
 		 468 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.764548  normal  0.0404969 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2815  regulatory protein  30.04 
 
 		 463 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2735  regulatory protein  30.53 
 
 		 467 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2952  MCP methyltransferase, CheR-type  30.38 
 
 		 489 aa  113  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3726  methyltransferase type 12  32.76 
 
 		 497 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0228434  normal  0.0246269 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2974  regulatory protein  29.39 
 
 		 470 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3062  MCP methyltransferase, CheR-type  30.57 
 
 		 471 aa  105  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464007  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2564  regulatory protein  28.57 
 
 		 470 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.364065 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2194  Methyltransferase type 12  29.24 
 
 		 290 aa  94  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0370393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1118  hypothetical protein  30.98 
 
 		 469 aa  86.7  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.280374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3355  hypothetical protein  29.6 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3680  hypothetical protein  29.6 
 
 		 355 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6349  Methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5210  hypothetical protein  30.09 
 
 		 331 aa  62.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2999  MCP methyltransferase, CheR-type  30 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.241337 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1598  hypothetical protein  27.51 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142557  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5177  methyltransferase type 12  26.99 
 
 		 366 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4620  hypothetical protein  25.33 
 
 		 345 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.258427  normal  0.684641 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4849  hypothetical protein  25.45 
 
 		 345 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.41076 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2883  alpha/beta hydrolase fold  24.69 
 
 		 594 aa  53.1  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.752135  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1253  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 599 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1278  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 599 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256171 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0893  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 589 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1375  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 589 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0199502  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1173  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 		 578 aa  50.8  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000196015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1353  alpha/beta hydrolase fold  26.14 
 
 		 589 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830773  normal  0.156007 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2841  hypothetical protein  26.11 
 
 		 347 aa  50.8  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0066  hypothetical protein  27.65 
 
 		 332 aa  48.5  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4520  Alpha/beta hydrolase  25.31 
 
 		 589 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233451  normal  0.770857 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1762  hypothetical protein  23.85 
 
 		 585 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000563252 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2248  hypothetical protein  23.75 
 
 		 585 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.555359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1493  hypothetical protein  23.75 
 
 		 585 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01365  predicted hydrolase  23.75 
 
 		 585 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.693109  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01377  hypothetical protein  23.75 
 
 		 585 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.748745  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2235  conserved hypothetical protein  23.75 
 
 		 585 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5537  hypothetical protein  24.07 
 
 		 585 aa  47  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2013  hypothetical protein  23.14 
 
 		 585 aa  47  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.329786 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2878  Methyltransferase type 12  25.94 
 
 		 594 aa  45.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.404864  normal  0.280117 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3151  hypothetical protein  30.52 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4659  alpha/beta hydrolase fold protein  24.69 
 
 		 590 aa  43.9  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1591  hypothetical protein  22.92 
 
 		 585 aa  43.9  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1128  hypothetical protein  30.18 
 
 		 312 aa  42.7  0.007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2286  hypothetical protein  32.92 
 
 		 317 aa  42.7  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651352  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>