27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3726 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3726  methyltransferase type 12  100 
 
 		 497 aa  1024    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0228434  normal  0.0246269 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2952  MCP methyltransferase, CheR-type  63.52 
 
 		 489 aa  613  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2815  regulatory protein  62.99 
 
 		 463 aa  610  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2564  regulatory protein  59.87 
 
 		 470 aa  579  1e-164  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.364065 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2974  regulatory protein  59.44 
 
 		 470 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2735  regulatory protein  60.48 
 
 		 467 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1287  regulatory protein  57.95 
 
 		 468 aa  558  1e-158  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.764548  normal  0.0404969 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2693  regulatory protein  58.3 
 
 		 468 aa  558  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3062  MCP methyltransferase, CheR-type  41.23 
 
 		 471 aa  378  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464007  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2510  regulatory protein  33.33 
 
 		 284 aa  111  3e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0545339  normal  0.669571 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2194  Methyltransferase type 12  26.42 
 
 		 290 aa  109  9.000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0370393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1118  hypothetical protein  28.29 
 
 		 469 aa  107  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.280374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4620  hypothetical protein  29.62 
 
 		 345 aa  86.7  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.258427  normal  0.684641 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5177  methyltransferase type 12  28.87 
 
 		 366 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4849  hypothetical protein  30.94 
 
 		 345 aa  86.3  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.41076 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3680  hypothetical protein  29.64 
 
 		 355 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3355  hypothetical protein  29.74 
 
 		 355 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1598  hypothetical protein  26.96 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142557  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5210  hypothetical protein  26.71 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2841  hypothetical protein  25.76 
 
 		 347 aa  76.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6349  Methyltransferase type 12  28.29 
 
 		 366 aa  72.8  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2999  MCP methyltransferase, CheR-type  24.73 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.241337 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  28.21 
 
 		 399 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0692  Methyltransferase type 12  25.64 
 
 		 400 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2078  methyltransferase type 12  25 
 
 		 218 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.300981  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  24.79 
 
 		 400 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2676  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 231 aa  43.1  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>