22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4849 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4849  hypothetical protein  100 
 
 		 345 aa  699    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.41076 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4620  hypothetical protein  90.09 
 
 		 345 aa  618  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.258427  normal  0.684641 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2841  hypothetical protein  55.49 
 
 		 347 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1598  hypothetical protein  53.08 
 
 		 348 aa  384  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142557  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5177  methyltransferase type 12  45.99 
 
 		 366 aa  227  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6349  Methyltransferase type 12  42.16 
 
 		 366 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3355  hypothetical protein  38.21 
 
 		 355 aa  186  5e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3680  hypothetical protein  38.21 
 
 		 355 aa  185  9e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3726  methyltransferase type 12  30.94 
 
 		 497 aa  86.3  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0228434  normal  0.0246269 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3062  MCP methyltransferase, CheR-type  25.36 
 
 		 471 aa  79.7  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464007  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2194  Methyltransferase type 12  26.4 
 
 		 290 aa  78.2  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0370393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2952  MCP methyltransferase, CheR-type  28.83 
 
 		 489 aa  70.1  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2815  regulatory protein  27.51 
 
 		 463 aa  67  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1287  regulatory protein  27.95 
 
 		 468 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.764548  normal  0.0404969 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2735  regulatory protein  28.63 
 
 		 467 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2693  regulatory protein  27.84 
 
 		 468 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1118  hypothetical protein  25.3 
 
 		 469 aa  57  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.280374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2564  regulatory protein  25.63 
 
 		 470 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.364065 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2974  regulatory protein  26.87 
 
 		 470 aa  56.6  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2510  regulatory protein  25.45 
 
 		 284 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0545339  normal  0.669571 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5210  hypothetical protein  29.17 
 
 		 331 aa  44.7  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10240  methyltransferase family protein  32.58 
 
 		 278 aa  43.1  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>