22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3355 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3680  hypothetical protein  97.18 
 
 		 355 aa  694    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3355  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  713    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6349  Methyltransferase type 12  60.25 
 
 		 366 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5177  methyltransferase type 12  61.49 
 
 		 366 aa  381  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4620  hypothetical protein  38.93 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.258427  normal  0.684641 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4849  hypothetical protein  38.21 
 
 		 345 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.41076 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1598  hypothetical protein  39.68 
 
 		 348 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142557  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2841  hypothetical protein  41 
 
 		 347 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2999  MCP methyltransferase, CheR-type  28.02 
 
 		 323 aa  92.8  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.241337 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2194  Methyltransferase type 12  30.48 
 
 		 290 aa  92.8  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0370393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2693  regulatory protein  29.57 
 
 		 468 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1287  regulatory protein  28.47 
 
 		 468 aa  87  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.764548  normal  0.0404969 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3726  methyltransferase type 12  29.74 
 
 		 497 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0228434  normal  0.0246269 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3062  MCP methyltransferase, CheR-type  26.1 
 
 		 471 aa  84.3  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464007  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2952  MCP methyltransferase, CheR-type  28.76 
 
 		 489 aa  80.9  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2815  regulatory protein  28.57 
 
 		 463 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2735  regulatory protein  27.91 
 
 		 467 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2974  regulatory protein  27.62 
 
 		 470 aa  70.9  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2510  regulatory protein  29.6 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0545339  normal  0.669571 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1118  hypothetical protein  26.56 
 
 		 469 aa  68.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.280374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2564  regulatory protein  26.38 
 
 		 470 aa  67  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.364065 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5210  hypothetical protein  32.18 
 
 		 331 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>