23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1287 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A2815  regulatory protein  69.05 
 
 		 463 aa  676    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2564  regulatory protein  64.79 
 
 		 470 aa  644    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.364065 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2974  regulatory protein  65.3 
 
 		 470 aa  649    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1287  regulatory protein  100 
 
 		 468 aa  972    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.764548  normal  0.0404969 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2952  MCP methyltransferase, CheR-type  70.13 
 
 		 489 aa  677    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2693  regulatory protein  95.3 
 
 		 468 aa  929    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2735  regulatory protein  63.83 
 
 		 467 aa  614  9.999999999999999e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3726  methyltransferase type 12  57.95 
 
 		 497 aa  558  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0228434  normal  0.0246269 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3062  MCP methyltransferase, CheR-type  42.86 
 
 		 471 aa  379  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464007  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2510  regulatory protein  31.85 
 
 		 284 aa  118  1.9999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0545339  normal  0.669571 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1118  hypothetical protein  27.53 
 
 		 469 aa  96.7  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.280374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5177  methyltransferase type 12  30.5 
 
 		 366 aa  94.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3355  hypothetical protein  28.47 
 
 		 355 aa  87  7e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2194  Methyltransferase type 12  21.8 
 
 		 290 aa  86.7  9e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0370393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3680  hypothetical protein  28.11 
 
 		 355 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6349  Methyltransferase type 12  28.62 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5210  hypothetical protein  27.9 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4620  hypothetical protein  27.2 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.258427  normal  0.684641 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4849  hypothetical protein  27.95 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.41076 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2841  hypothetical protein  26.4 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2999  MCP methyltransferase, CheR-type  29.46 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.241337 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1598  hypothetical protein  24.38 
 
 		 348 aa  63.2  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142557  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  28.8 
 
 		 399 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>