22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3680 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3680  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  709    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3355  hypothetical protein  97.18 
 
 		 355 aa  694    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6349  Methyltransferase type 12  61.18 
 
 		 366 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5177  methyltransferase type 12  62.73 
 
 		 366 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4620  hypothetical protein  38.93 
 
 		 345 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.258427  normal  0.684641 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1598  hypothetical protein  39.68 
 
 		 348 aa  185  8e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142557  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4849  hypothetical protein  38.21 
 
 		 345 aa  185  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.41076 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2841  hypothetical protein  40.74 
 
 		 347 aa  178  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2999  MCP methyltransferase, CheR-type  28.02 
 
 		 323 aa  93.6  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.241337 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2194  Methyltransferase type 12  30.48 
 
 		 290 aa  92.8  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0370393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2693  regulatory protein  29.57 
 
 		 468 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3726  methyltransferase type 12  29.64 
 
 		 497 aa  86.3  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0228434  normal  0.0246269 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1287  regulatory protein  28.11 
 
 		 468 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.764548  normal  0.0404969 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3062  MCP methyltransferase, CheR-type  25.74 
 
 		 471 aa  84.3  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464007  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2952  MCP methyltransferase, CheR-type  28.76 
 
 		 489 aa  80.9  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2815  regulatory protein  28.57 
 
 		 463 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2735  regulatory protein  27.91 
 
 		 467 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2974  regulatory protein  27.44 
 
 		 470 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2510  regulatory protein  29.6 
 
 		 284 aa  69.7  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0545339  normal  0.669571 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1118  hypothetical protein  27.16 
 
 		 469 aa  67.8  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.280374  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2564  regulatory protein  26.37 
 
 		 470 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.364065 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5210  hypothetical protein  32.18 
 
 		 331 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>