22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2999 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2999  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 		 323 aa  655    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.241337 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3062  MCP methyltransferase, CheR-type  25.96 
 
 		 471 aa  94.4  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464007  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3680  hypothetical protein  27.86 
 
 		 355 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3355  hypothetical protein  28.12 
 
 		 355 aa  93.6  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6349  Methyltransferase type 12  26.21 
 
 		 366 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5177  methyltransferase type 12  27.02 
 
 		 366 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1118  hypothetical protein  26.45 
 
 		 469 aa  78.6  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.280374  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2735  regulatory protein  26.18 
 
 		 467 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2693  regulatory protein  31.7 
 
 		 468 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1287  regulatory protein  30.62 
 
 		 468 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.764548  normal  0.0404969 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2952  MCP methyltransferase, CheR-type  27.57 
 
 		 489 aa  69.7  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2194  Methyltransferase type 12  23.81 
 
 		 290 aa  68.2  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0370393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3726  methyltransferase type 12  26.16 
 
 		 497 aa  68.2  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0228434  normal  0.0246269 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2974  regulatory protein  26.64 
 
 		 470 aa  65.5  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2510  regulatory protein  31.22 
 
 		 284 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0545339  normal  0.669571 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2564  regulatory protein  27.16 
 
 		 470 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.364065 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2815  regulatory protein  25.62 
 
 		 463 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1598  hypothetical protein  22.53 
 
 		 348 aa  57.4  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142557  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2841  hypothetical protein  26.27 
 
 		 347 aa  53.1  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4620  hypothetical protein  25.56 
 
 		 345 aa  53.1  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.258427  normal  0.684641 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4849  hypothetical protein  24.89 
 
 		 345 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.41076 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0066  hypothetical protein  28.09 
 
 		 332 aa  45.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>