23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1598 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1598  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  723    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142557  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2841  hypothetical protein  63.01 
 
 		 347 aa  457  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4849  hypothetical protein  53.08 
 
 		 345 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.41076 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4620  hypothetical protein  53.96 
 
 		 345 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.258427  normal  0.684641 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5177  methyltransferase type 12  39.79 
 
 		 366 aa  212  9e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6349  Methyltransferase type 12  41.67 
 
 		 366 aa  206  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3680  hypothetical protein  39.68 
 
 		 355 aa  185  8e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3355  hypothetical protein  39.68 
 
 		 355 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3726  methyltransferase type 12  26.96 
 
 		 497 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0228434  normal  0.0246269 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3062  MCP methyltransferase, CheR-type  25.42 
 
 		 471 aa  75.9  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464007  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2952  MCP methyltransferase, CheR-type  23.75 
 
 		 489 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2194  Methyltransferase type 12  26.07 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0370393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1287  regulatory protein  24.38 
 
 		 468 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.764548  normal  0.0404969 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2564  regulatory protein  23.98 
 
 		 470 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.364065 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2735  regulatory protein  25.1 
 
 		 467 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2974  regulatory protein  23.58 
 
 		 470 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2815  regulatory protein  25.33 
 
 		 463 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2510  regulatory protein  27.51 
 
 		 284 aa  60.5  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0545339  normal  0.669571 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2693  regulatory protein  24.38 
 
 		 468 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1118  hypothetical protein  25.45 
 
 		 469 aa  58.9  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.280374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2999  MCP methyltransferase, CheR-type  20.82 
 
 		 323 aa  52.8  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.241337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5210  hypothetical protein  30.77 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1815  methyltransferase type 11  28.78 
 
 		 275 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>