23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5177 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_5177  methyltransferase type 12  100 
 
 
366 aa  719    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6349  Methyltransferase type 12  76.23 
 
 
366 aa  551  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3680  hypothetical protein  62.73 
 
 
355 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3355  hypothetical protein  63.43 
 
 
355 aa  396  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4849  hypothetical protein  45.99 
 
 
345 aa  230  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.41076 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4620  hypothetical protein  44.56 
 
 
345 aa  229  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.258427  normal  0.684641 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1598  hypothetical protein  40.91 
 
 
348 aa  216  5.9999999999999996e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142557  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2841  hypothetical protein  42.42 
 
 
347 aa  212  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1287  regulatory protein  30.5 
 
 
468 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.764548  normal  0.0404969 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2693  regulatory protein  28.93 
 
 
468 aa  93.6  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2952  MCP methyltransferase, CheR-type  29.03 
 
 
489 aa  87.8  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34483  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3726  methyltransferase type 12  28.67 
 
 
497 aa  87  4e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0228434  normal  0.0246269 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2999  MCP methyltransferase, CheR-type  26.92 
 
 
323 aa  87  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.241337 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3062  MCP methyltransferase, CheR-type  24.44 
 
 
471 aa  83.2  0.000000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464007  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2815  regulatory protein  27.59 
 
 
463 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1118  hypothetical protein  29.17 
 
 
469 aa  77  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.280374  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2194  Methyltransferase type 12  24.52 
 
 
290 aa  75.5  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0370393  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2735  regulatory protein  29.18 
 
 
467 aa  74.3  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2974  regulatory protein  25.83 
 
 
470 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2564  regulatory protein  25.83 
 
 
470 aa  71.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.364065 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2510  regulatory protein  27.73 
 
 
284 aa  68.6  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0545339  normal  0.669571 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5210  hypothetical protein  26.02 
 
 
331 aa  57.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1181  Methyltransferase type 11  30.16 
 
 
397 aa  43.9  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.694662  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>