29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2735 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2735  regulatory protein  100 
 
 		 467 aa  966    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2815  regulatory protein  69.55 
 
 		 463 aa  681    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2564  regulatory protein  77.73 
 
 		 470 aa  761    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.364065 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2952  MCP methyltransferase, CheR-type  70.63 
 
 		 489 aa  684    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2974  regulatory protein  77.52 
 
 		 470 aa  756    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2693  regulatory protein  63.36 
 
 		 468 aa  625  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1287  regulatory protein  63.83 
 
 		 468 aa  624  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.764548  normal  0.0404969 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3726  methyltransferase type 12  60.48 
 
 		 497 aa  590  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0228434  normal  0.0246269 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3062  MCP methyltransferase, CheR-type  45.51 
 
 		 471 aa  390  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464007  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2510  regulatory protein  30.4 
 
 		 284 aa  114  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0545339  normal  0.669571 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2194  Methyltransferase type 12  27.87 
 
 		 290 aa  97.8  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0370393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1118  hypothetical protein  26.72 
 
 		 469 aa  92.4  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.280374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3680  hypothetical protein  28.29 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3355  hypothetical protein  28.29 
 
 		 355 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5177  methyltransferase type 12  29.01 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6349  Methyltransferase type 12  28.63 
 
 		 366 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5210  hypothetical protein  23.99 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2999  MCP methyltransferase, CheR-type  26.94 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.241337 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4849  hypothetical protein  29.64 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.41076 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4620  hypothetical protein  27.82 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.258427  normal  0.684641 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2841  hypothetical protein  25.4 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1598  hypothetical protein  25 
 
 		 348 aa  64.3  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142557  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1038  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  24.55 
 
 		 244 aa  47.8  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3020  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  23.35 
 
 		 249 aa  44.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  26.13 
 
 		 399 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  22.53 
 
 		 240 aa  43.9  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2383  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  22.53 
 
 		 240 aa  43.5  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2527  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  22.53 
 
 		 240 aa  43.1  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1427  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  22.53 
 
 		 240 aa  43.1  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000505917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>