30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3062 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3062  MCP methyltransferase, CheR-type  100 
 
 		 471 aa  980    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.464007  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2952  MCP methyltransferase, CheR-type  43.38 
 
 		 489 aa  389  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.34483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2564  regulatory protein  43.08 
 
 		 470 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.364065 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2815  regulatory protein  42.48 
 
 		 463 aa  386  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2974  regulatory protein  43.3 
 
 		 470 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2693  regulatory protein  42.27 
 
 		 468 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1287  regulatory protein  42.86 
 
 		 468 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.764548  normal  0.0404969 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2735  regulatory protein  45.51 
 
 		 467 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3726  methyltransferase type 12  41.23 
 
 		 497 aa  378  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0228434  normal  0.0246269 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1118  hypothetical protein  25.26 
 
 		 469 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.280374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2510  regulatory protein  30.56 
 
 		 284 aa  100  8e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0545339  normal  0.669571 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2194  Methyltransferase type 12  28.03 
 
 		 290 aa  93.2  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0370393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2999  MCP methyltransferase, CheR-type  25.65 
 
 		 323 aa  89.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.241337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3680  hypothetical protein  25.74 
 
 		 355 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3355  hypothetical protein  26.1 
 
 		 355 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4620  hypothetical protein  26.59 
 
 		 345 aa  81.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.258427  normal  0.684641 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6349  Methyltransferase type 12  26.52 
 
 		 366 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4849  hypothetical protein  25.36 
 
 		 345 aa  79.7  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.41076 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5177  methyltransferase type 12  24.06 
 
 		 366 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.230491 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1598  hypothetical protein  25.42 
 
 		 348 aa  75.9  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142557  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2841  hypothetical protein  25 
 
 		 347 aa  69.3  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.846065 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5210  hypothetical protein  23.37 
 
 		 331 aa  62.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0612186 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  23.93 
 
 		 262 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3362  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  26.19 
 
 		 251 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  26.02 
 
 		 251 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  31.43 
 
 		 275 aa  44.3  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3384  hypothetical protein  26.83 
 
 		 251 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3058  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  26.83 
 
 		 251 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000550662  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  26.83 
 
 		 251 aa  44.3  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  30.56 
 
 		 399 aa  43.1  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>