25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_1128 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013421  Pecwa_1128  hypothetical protein  100 
 
 		 312 aa  645    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3151  hypothetical protein  86.17 
 
 		 312 aa  557  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0995  hypothetical protein  55.33 
 
 		 316 aa  317  1e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190067  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2286  hypothetical protein  50.16 
 
 		 317 aa  296  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.651352  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2381  hypothetical protein  40.85 
 
 		 310 aa  249  6e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2528  hypothetical protein  40 
 
 		 310 aa  236  4e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0849  hypothetical protein  41.47 
 
 		 285 aa  190  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0453046 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4745  hypothetical protein  43.8 
 
 		 123 aa  99.8  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 254 aa  55.8  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  31.93 
 
 		 254 aa  53.9  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3321  methyltransferase type 12  30.82 
 
 		 204 aa  52.4  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.619193  normal  0.25285 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0920  O-methyltransferase family protein  28.93 
 
 		 343 aa  47.8  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3838  hypothetical protein  26.76 
 
 		 285 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3067  methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7094  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.83 
 
 		 244 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000661752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1309  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.14 
 
 		 423 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5006  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.67 
 
 		 413 aa  43.9  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110355  normal  0.20351 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1574  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  25.98 
 
 		 420 aa  43.1  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00420728  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2084  Methyltransferase type 12  31.97 
 
 		 251 aa  43.1  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2510  regulatory protein  30.18 
 
 		 284 aa  43.1  0.006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0545339  normal  0.669571 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2375  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  27.59 
 
 		 494 aa  43.1  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.241919 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  29.63 
 
 		 253 aa  43.1  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  29.63 
 
 		 253 aa  43.1  0.006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7150  cyclopropane fatty-acyl-phospholipid synthase  25.56 
 
 		 419 aa  42.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.133822  normal  0.013333 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0826  methyltransferase type 11  27.22 
 
 		 224 aa  42.4  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.457177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>