More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2468 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2468  50S ribosomal protein L7/L12  100 
 
 		 129 aa  233  8e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27801  hypothetical protein  77.86 
 
 		 179 aa  174  5e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2153  50S ribosomal protein L7/L12  93.02 
 
 		 128 aa  155  2e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.66919  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0203  50S ribosomal protein L7/L12  82.44 
 
 		 131 aa  155  2e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1568  50S ribosomal protein L7/L12  83.97 
 
 		 131 aa  154  3e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02771  50S ribosomal protein L7/L12  83.21 
 
 		 131 aa  153  7e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0831676  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1037  50S ribosomal protein L7/L12  67.94 
 
 		 129 aa  150  8e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.144376  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02191  50S ribosomal protein L7/L12  81.82 
 
 		 132 aa  149  1e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.605695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02191  50S ribosomal protein L7/L12  82.44 
 
 		 131 aa  148  2e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02211  50S ribosomal protein L7/L12  82.44 
 
 		 131 aa  148  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.833107  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02301  50S ribosomal protein L7/L12  83.21 
 
 		 131 aa  147  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0631  50S ribosomal protein L7/L12  72.87 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.141708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2555  50S ribosomal protein L7/L12  69.77 
 
 		 128 aa  131  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.113587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1761  50S ribosomal protein L7/L12  61.36 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1737  50S ribosomal protein L7/L12  61.36 
 
 		 132 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4010  50S ribosomal protein L7/L12  66.41 
 
 		 131 aa  122  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0094315  hitchhiker  0.00000000352658 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0262  50S ribosomal protein L12P  63.16 
 
 		 133 aa  121  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.314795  normal  0.113093 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1017  50S ribosomal protein L7/L12  64.89 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221809 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2330  ribosomal protein L7/L12  60.47 
 
 		 125 aa  110  8.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0223  50S ribosomal protein L7/L12  52.27 
 
 		 122 aa  107  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3767  50S ribosomal protein L7/L12  52.27 
 
 		 122 aa  107  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000892884  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02420  LSU ribosomal protein L12P  62.79 
 
 		 126 aa  107  7.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.346451  normal  0.371005 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0277  ribosomal protein L7/L12  55.91 
 
 		 126 aa  105  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000125688  hitchhiker  0.000433063 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2729  50S ribosomal protein L7/L12  51.16 
 
 		 121 aa  103  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000345895  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08450  LSU ribosomal protein L12P  58.91 
 
 		 124 aa  103  9e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0838646  normal  0.398642 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1664  50S ribosomal protein L7/L12  55.81 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.63361  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0858  50S ribosomal protein L7/L12  56.45 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150638  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0701  50S ribosomal protein L7/L12  51.22 
 
 		 128 aa  101  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.48275  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0176  50S ribosomal protein L7/L12  49.61 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000503001  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0173  50S ribosomal protein L7/L12  54.26 
 
 		 125 aa  100  6e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1171  ribosomal protein L7/L12  59.69 
 
 		 126 aa  100  9e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000534348  unclonable  0.0000000277278 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0204  ribosomal protein L7/L12  53.49 
 
 		 121 aa  99.8  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.454723  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1528  ribosomal protein L7/L12  54.69 
 
 		 129 aa  99.4  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020563  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0299  50S ribosomal protein L7/L12  57.26 
 
 		 128 aa  98.2  3e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00870762  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0140  ribosomal protein L7/L12  47.29 
 
 		 121 aa  98.2  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000121885  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03862  50S ribosomal protein L7/L12  54.26 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000247439  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4009  ribosomal protein L7/L12  54.26 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000814927  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4219  50S ribosomal protein L7/L12  54.26 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000137425  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4039  50S ribosomal protein L7/L12  54.26 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00670642  hitchhiker  0.000881188 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4434  50S ribosomal protein L7/L12  54.26 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00187873  hitchhiker  0.00000582659 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3886  ribosomal protein L7/L12  54.26 
 
 		 121 aa  98.2  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.449029  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5451  50S ribosomal protein L7/L12  54.26 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000730473  hitchhiker  0.0030051 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4527  50S ribosomal protein L7/L12  54.26 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000174413  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0209  ribosomal protein L7/L12  54.26 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000161356  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1317  50S ribosomal protein L7/L12  55.04 
 
 		 124 aa  97.8  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000128375  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4474  50S ribosomal protein L7/L12  54.26 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000613838  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03815  hypothetical protein  54.26 
 
 		 121 aa  97.8  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000273173  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4326  ribosomal protein L7/L12  54.4 
 
 		 129 aa  97.4  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.488636 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0195  50S ribosomal protein L7/L12  51.15 
 
 		 125 aa  97.1  8e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00370258  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0181  50S ribosomal protein L7/L12  54.33 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.563708  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0196  50S ribosomal protein L7/L12  55.04 
 
 		 121 aa  96.3  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000850088  normal  0.220465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0276  50S ribosomal protein L7/L12  56.59 
 
 		 121 aa  96.7  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00026  normal  0.0846349 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2163  50S ribosomal protein L12P  53.49 
 
 		 128 aa  96.3  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.243742  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0257  50S ribosomal protein L7/L12  54.84 
 
 		 127 aa  96.3  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000857279  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2721  ribosomal protein L7/L12  56 
 
 		 123 aa  95.5  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_862  ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000472874  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0503  50S ribosomal protein L7/L12  55.73 
 
 		 129 aa  95.1  3e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000266288  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0180  50S ribosomal protein L7/L12  54.26 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.595684  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0448  50S ribosomal protein L7/L12  55.04 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00560406  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0990  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00236758  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0352  ribosomal protein L7/L12  55.65 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.40803  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23950  LSU ribosomal protein L12P  57.6 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0881  50S ribosomal protein L7/L12  53.23 
 
 		 123 aa  93.6  7e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.619082  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1926  ribosomal protein L7/L12  53.12 
 
 		 128 aa  93.6  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.252163  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3867  50S ribosomal protein L7/L12  52.76 
 
 		 126 aa  93.6  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0270847 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3335  50S ribosomal protein L7/L12  52.71 
 
 		 124 aa  93.6  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4558  50S ribosomal protein L7/L12  55.04 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.347891  hitchhiker  0.0000000000101149 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4362  50S ribosomal protein L7/L12  55.04 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.993642  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2723  50S ribosomal protein L12P  52.34 
 
 		 129 aa  93.2  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000110024  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3934  ribosomal protein L7/L12  54.4 
 
 		 128 aa  93.2  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.189008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4484  50S ribosomal protein L7/L12  55.04 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000110879 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0501  ribosomal protein L7/L12  44.19 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4394  50S ribosomal protein L7/L12  55.04 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000226611  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0409  50S ribosomal protein L7/L12  52.76 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329533  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4481  50S ribosomal protein L7/L12  55.04 
 
 		 121 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102709 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1429  ribosomal protein L7/L12  54.84 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0030  50S ribosomal protein L7/L12  59.84 
 
 		 123 aa  92.8  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0666406  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1144  ribosomal protein L7/L12  55.91 
 
 		 127 aa  92  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000177036  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3732  50S ribosomal protein L7/L12  55.04 
 
 		 122 aa  91.7  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0214  ribosomal protein L7/L12  52.76 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0315  ribosomal protein L7/L12  50.39 
 
 		 125 aa  91.7  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00406821  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0298  50S ribosomal protein L12P  55.56 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4532  50S ribosomal protein L7/L12  57.69 
 
 		 126 aa  91.7  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3247  50S ribosomal protein L7/L12  58.14 
 
 		 126 aa  91.3  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1700  50S ribosomal protein L7/L12  56.56 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.357459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1953  50S ribosomal protein L7/L12  52.94 
 
 		 127 aa  90.9  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0817116  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3868  50S ribosomal protein L7/L12  52.31 
 
 		 124 aa  91.3  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3593  50S ribosomal protein L7/L12  52.31 
 
 		 123 aa  90.9  5e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.100169  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2332  50S ribosomal protein L7/L12  49.61 
 
 		 126 aa  90.9  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00721046  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06160  50S ribosomal protein L7/L12  47.29 
 
 		 122 aa  90.5  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0509  50S ribosomal protein L7/L12  56.92 
 
 		 125 aa  90.5  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0362  50S ribosomal protein L7/L12  48.84 
 
 		 120 aa  90.5  7e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00344046  hitchhiker  0.0000691271 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37027  predicted protein  52.34 
 
 		 149 aa  90.5  8e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00417433  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1591  50S ribosomal protein L7/L12  49.61 
 
 		 124 aa  90.1  8e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0442  ribosomal protein L7/L12  47.2 
 
 		 130 aa  90.5  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0386  50S ribosomal protein L7/L12  49.61 
 
 		 126 aa  90.1  9e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0361  50S ribosomal protein L7/L12  49.61 
 
 		 126 aa  90.1  9e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1346  50S ribosomal protein L7/L12  54.92 
 
 		 126 aa  90.1  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0781137  normal  0.0992596 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2469  50S ribosomal protein L12P  53.91 
 
 		 126 aa  89.7  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.130995  hitchhiker  0.00690979 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5100  50S ribosomal protein L7/L12  56.35 
 
 		 130 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.125465 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>