100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4105 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4105  BLUF domain-containing protein  100 
 
 		 156 aa  322  9e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1625  hypothetical protein  34.29 
 
 		 169 aa  88.2  4e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0491426  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2753  BLUF domain-containing protein  37.23 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3406  BLUF  33.33 
 
 		 225 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0323377  normal  0.220156 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1670  BLUF domain-containing protein  32.37 
 
 		 148 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4153  BLUF domain protein  30.15 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.928162  normal  0.124619 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0764  BLUF domain-containing protein  35.11 
 
 		 138 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1233  BLUF domain protein  31.3 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0171481  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1075  hypothetical protein  28.46 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1829  BLUF domain-containing protein  27.69 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0371971 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3094  BLUF domain-containing protein  41.3 
 
 		 157 aa  74.7  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0238281 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3629  expression activator-related protein  34.19 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3670  BLUF  26.57 
 
 		 147 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4118  BLUF domain protein  28.46 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0114  BLUF domain-containing protein  32.32 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3989  hypothetical protein  26.15 
 
 		 147 aa  67.8  0.00000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.693018  normal  0.0712703 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4786  BLUF domain protein  32.32 
 
 		 150 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3364  BLUF domain protein  32.32 
 
 		 150 aa  67  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1302  BLUF  29.01 
 
 		 140 aa  67  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0809  BLUF domain protein  28.46 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.31456  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0913  BLUF domain-containing protein  26.92 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.434617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0880  BLUF domain-containing protein  28.46 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0920849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0527  BLUF domain protein  30.93 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3630  BLUF domain-containing protein  27.48 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4060  blue-light receptor BLUF domain-containing protein  33.72 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0870  sensors of blue-light using FAD  25.38 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.355285 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2921  BLUF domain-containing protein  34.07 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2545  BLUF domain-containing protein  29.41 
 
 		 150 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1261  BLUF blue-light receptor  34.07 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0523  BLUF domain protein  32.46 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2544  BLUF domain-containing protein  32.61 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00348968  normal  0.0337221 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0367  hypothetical protein  35.48 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2025  BLUF domain-containing protein  26.62 
 
 		 169 aa  60.5  0.000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.283548  normal  0.388774 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1911  BLUF domain protein  33.78 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00175  hypothetical protein ycgF  31.18 
 
 		 390 aa  59.7  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0408  hypothetical protein  36.56 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0397  BLUF domain-containing protein  35.06 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.160765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2569  BLUF domain-containing protein  33.33 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0866661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0406  BLUF domain-containing protein  32.61 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4761  BLUF domain protein  33.77 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1741  BLUF domain protein  34.38 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114564 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4411  BLUF domain-containing protein  30.53 
 
 		 309 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.611644  normal  0.129702 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0494  BLUF  31.63 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.303595  normal  0.0369715 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1828  BLUF domain-containing protein  31.31 
 
 		 296 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366569  normal  0.9646 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0797  BLUF domain-containing protein  30.53 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.162381  normal  0.119166 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4104  hypothetical protein  30.77 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.973455 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3848  BLUF domain protein  30.59 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0531  BLUF domain-containing protein  27.78 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0811942  normal  0.285805 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2030  BLUF  32.41 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.138441 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0367  BLUF domain-containing protein  31.46 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7029  BLUF domain protein  27.66 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4662  BLUF domain-containing protein  34.44 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2027  BLUF domain-containing protein  31.03 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1430  BLUF domain protein  29.46 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4031  BLUF domain-containing protein  31.25 
 
 		 148 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.154116 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2780  BLUF  28.09 
 
 		 164 aa  55.1  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.648384 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2562  BLUF  30.77 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.631295  normal  0.747633 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4513  BLUF domain protein  29.91 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.336016 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0667  sensors of blue-light using FAD  26.88 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.462757 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0567  BLUF domain-containing protein  23.33 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237581 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1378  BLUF domain-containing protein  28.26 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0517  BLUF  32.43 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.870314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4401  BLUF domain protein  30.21 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.272942 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4395  BLUF domain-containing protein  29.03 
 
 		 133 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.977421  normal  0.849262 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1867  hypothetical protein  30.19 
 
 		 196 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000117301  normal  0.0395598 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0912  BLUF domain protein  30 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.548422 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3321  BLUF  30.77 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.674737  normal  0.172306 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0888  BLUF domain protein  30 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0990729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2032  diguanylate phosphodiesterase  32.95 
 
 		 406 aa  53.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1270  BLUF domain-containing protein  25.48 
 
 		 216 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.173296  normal  0.770292 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0949  BLUF domain-containing protein  30 
 
 		 155 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0428449 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3075  BLUF domain-containing protein  25.53 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.269213  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2309  BLUF domain protein  33.33 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00710063  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4017  BLUF domain-containing protein  30.68 
 
 		 373 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.402107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4183  BLUF domain-containing protein  31.11 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3097  BLUF domain-containing protein  27.84 
 
 		 133 aa  52.4  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0735979 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3045  BLUF domain-containing protein  27.73 
 
 		 448 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0285  BLUF  31.87 
 
 		 141 aa  51.2  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.947427  normal  0.358648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3663  BLUF domain protein  30.34 
 
 		 142 aa  51.2  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2811  BLUF domain-containing protein  28.26 
 
 		 189 aa  50.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0216  BLUF domain-containing protein  25.27 
 
 		 450 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0370  BLUF domain protein  29.21 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.943321 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0996  BLUF domain protein  23.33 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282429  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1565  AppA, antirepressor of ppsR, sensor of blue light  25.27 
 
 		 450 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.935845  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4576  BLUF domain-containing protein  29.73 
 
 		 162 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18468  hitchhiker  0.00682829 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2641  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.96 
 
 		 1118 aa  49.7  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.604832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2579  BLUF domain-containing protein  29.58 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4041  BLUF domain-containing protein  23.66 
 
 		 137 aa  48.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2200  hypothetical protein  29.67 
 
 		 97 aa  47  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.537433 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1986  BLUF/cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  25 
 
 		 403 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.758889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01146  hypothetical protein  25 
 
 		 403 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2484  diguanylate phosphodiesterase  25 
 
 		 403 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01138  predicted FAD-binding phosphodiesterase  25 
 
 		 403 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1259  BLUF/cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  25 
 
 		 403 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577088  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1303  BLUF/cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  25 
 
 		 403 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3039  BLUF domain protein  24.73 
 
 		 135 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.923464 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2463  diguanylate phosphodiesterase  25 
 
 		 403 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.537462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1330  hypothetical protein  24.69 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24136  hitchhiker  0.00281182 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5542  BLUF domain-containing protein  30.43 
 
 		 155 aa  42  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.283955  normal  0.0880043 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2264  hypothetical protein  24 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.349132  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>