29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2264 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2264  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  279  9e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.349132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0996  BLUF domain protein  39.26 
 
 		 134 aa  83.6  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282429  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4041  BLUF domain-containing protein  39.83 
 
 		 137 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3097  BLUF domain-containing protein  42.31 
 
 		 133 aa  70.5  0.000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0735979 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4395  BLUF domain-containing protein  33.6 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.977421  normal  0.849262 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2200  hypothetical protein  38.37 
 
 		 97 aa  67  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.537433 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0531  BLUF domain-containing protein  34.13 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0811942  normal  0.285805 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0667  sensors of blue-light using FAD  33.33 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.462757 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1075  hypothetical protein  35.14 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2032  diguanylate phosphodiesterase  31.34 
 
 		 406 aa  46.2  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4118  BLUF domain protein  36.49 
 
 		 140 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0367  hypothetical protein  26.95 
 
 		 210 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4060  blue-light receptor BLUF domain-containing protein  37.04 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0367  BLUF domain-containing protein  31.33 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1828  BLUF domain-containing protein  32.81 
 
 		 296 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366569  normal  0.9646 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0370  BLUF domain protein  30.12 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.943321 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4017  BLUF domain-containing protein  37.5 
 
 		 373 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.402107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4105  BLUF domain-containing protein  21.57 
 
 		 156 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4513  BLUF domain protein  31.65 
 
 		 162 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.336016 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3630  BLUF domain-containing protein  37.84 
 
 		 140 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4411  BLUF domain-containing protein  32.18 
 
 		 309 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.611644  normal  0.129702 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2641  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.95 
 
 		 1118 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.604832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0408  hypothetical protein  30.26 
 
 		 210 aa  41.6  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00175  hypothetical protein ycgF  28.57 
 
 		 390 aa  40.4  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0949  BLUF domain-containing protein  31.17 
 
 		 155 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0428449 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1261  BLUF blue-light receptor  30.12 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4662  BLUF domain-containing protein  29.27 
 
 		 164 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0912  BLUF domain protein  31.17 
 
 		 155 aa  40.4  0.008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.548422 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2921  BLUF domain-containing protein  30.12 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>