92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4395 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4395  BLUF domain-containing protein  100 
 
 
133 aa  275  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.977421  normal  0.849262 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3097  BLUF domain-containing protein  49.51 
 
 
133 aa  107  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0735979 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0667  sensors of blue-light using FAD  38.89 
 
 
135 aa  86.3  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.462757 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4041  BLUF domain-containing protein  41.32 
 
 
137 aa  86.3  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0531  BLUF domain-containing protein  38.28 
 
 
134 aa  82.8  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0811942  normal  0.285805 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0996  BLUF domain protein  32.31 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282429  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1670  BLUF domain-containing protein  36.27 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1741  BLUF domain protein  35.71 
 
 
142 aa  69.3  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.114564 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3629  expression activator-related protein  35.05 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4513  BLUF domain protein  37.14 
 
 
162 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.336016 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2200  hypothetical protein  36.84 
 
 
97 aa  63.5  0.0000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.537433 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4060  blue-light receptor BLUF domain-containing protein  31.62 
 
 
134 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2264  hypothetical protein  42.47 
 
 
141 aa  62  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.349132  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4017  BLUF domain-containing protein  39.13 
 
 
373 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.402107  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1430  BLUF domain protein  33.07 
 
 
144 aa  61.6  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4401  BLUF domain protein  36.54 
 
 
148 aa  60.5  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.272942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0523  BLUF domain protein  38.54 
 
 
147 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1828  BLUF domain-containing protein  34 
 
 
296 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366569  normal  0.9646 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4031  BLUF domain-containing protein  35.58 
 
 
148 aa  59.3  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.154116 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2569  BLUF domain-containing protein  39.78 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0866661  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4104  hypothetical protein  34.69 
 
 
135 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.973455 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2641  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.47 
 
 
1118 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.604832  normal 
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7029  BLUF domain protein  31.4 
 
 
137 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3321  BLUF  34.44 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.674737  normal  0.172306 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00175  hypothetical protein ycgF  31.96 
 
 
390 aa  58.2  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1303  BLUF/cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  32.61 
 
 
403 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1259  BLUF/cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  32.61 
 
 
403 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577088  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2463  diguanylate phosphodiesterase  32.61 
 
 
403 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.537462  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0397  BLUF domain-containing protein  38.78 
 
 
143 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.160765  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2484  diguanylate phosphodiesterase  32.61 
 
 
403 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2025  BLUF domain-containing protein  41.43 
 
 
169 aa  57.4  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.283548  normal  0.388774 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01138  predicted FAD-binding phosphodiesterase  32.61 
 
 
403 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01146  hypothetical protein  32.61 
 
 
403 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1986  BLUF/cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  32.61 
 
 
403 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.758889  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2030  BLUF  38.96 
 
 
150 aa  57.4  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.138441 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4118  BLUF domain protein  36.17 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0913  BLUF domain-containing protein  34.78 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.434617  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2921  BLUF domain-containing protein  31.5 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2811  BLUF domain-containing protein  38.96 
 
 
189 aa  55.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1261  BLUF blue-light receptor  31.5 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1565  AppA, antirepressor of ppsR, sensor of blue light  32.73 
 
 
450 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.935845  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0870  sensors of blue-light using FAD  37.66 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.355285 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3045  BLUF domain-containing protein  33.64 
 
 
448 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1233  BLUF domain protein  32.46 
 
 
143 aa  55.1  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0171481  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1075  hypothetical protein  33.33 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0216  BLUF domain-containing protein  31.82 
 
 
450 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2544  BLUF domain-containing protein  35.53 
 
 
160 aa  54.3  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00348968  normal  0.0337221 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0797  BLUF domain-containing protein  31.03 
 
 
139 aa  54.3  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.162381  normal  0.119166 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0367  hypothetical protein  30.48 
 
 
210 aa  53.9  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0408  hypothetical protein  33.71 
 
 
210 aa  53.9  0.0000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4761  BLUF domain protein  33 
 
 
157 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3406  BLUF  30.3 
 
 
225 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0323377  normal  0.220156 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1867  hypothetical protein  32.29 
 
 
196 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000117301  normal  0.0395598 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0880  BLUF domain-containing protein  35.87 
 
 
140 aa  53.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0920849  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1829  BLUF domain-containing protein  35.35 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0371971 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4105  BLUF domain-containing protein  29.03 
 
 
156 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3989  hypothetical protein  34.78 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.693018  normal  0.0712703 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3848  BLUF domain protein  36.25 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0809  BLUF domain protein  37.18 
 
 
140 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.31456  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0406  BLUF domain-containing protein  30.23 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3670  BLUF  32.61 
 
 
147 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3663  BLUF domain protein  30.11 
 
 
142 aa  51.6  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3630  BLUF domain-containing protein  34.78 
 
 
140 aa  51.6  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92115  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4411  BLUF domain-containing protein  35.9 
 
 
309 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.611644  normal  0.129702 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2780  BLUF  29.09 
 
 
164 aa  51.6  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.648384 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4662  BLUF domain-containing protein  34.07 
 
 
164 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1302  BLUF  36.36 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1625  hypothetical protein  31.58 
 
 
169 aa  50.4  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0491426  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1378  BLUF domain-containing protein  29.67 
 
 
133 aa  50.4  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2579  BLUF domain-containing protein  39.44 
 
 
141 aa  50.4  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2753  BLUF domain-containing protein  30 
 
 
142 aa  50.4  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3094  BLUF domain-containing protein  31.11 
 
 
157 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0238281 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0567  BLUF domain-containing protein  38.36 
 
 
209 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237581 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2032  diguanylate phosphodiesterase  30.68 
 
 
406 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1911  BLUF domain protein  35.06 
 
 
196 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0527  BLUF domain protein  26.47 
 
 
150 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0367  BLUF domain-containing protein  29.21 
 
 
135 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4153  BLUF domain protein  29.59 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.928162  normal  0.124619 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0517  BLUF  33.02 
 
 
141 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.870314  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0764  BLUF domain-containing protein  28.57 
 
 
138 aa  47.4  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4576  BLUF domain-containing protein  35.29 
 
 
162 aa  47  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18468  hitchhiker  0.00682829 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0285  BLUF  32.22 
 
 
141 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.947427  normal  0.358648 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0494  BLUF  32.94 
 
 
147 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.303595  normal  0.0369715 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2027  BLUF domain-containing protein  33.6 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3075  BLUF domain-containing protein  33.01 
 
 
168 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.269213  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2545  BLUF domain-containing protein  30.53 
 
 
150 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3039  BLUF domain protein  30.95 
 
 
135 aa  44.7  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.923464 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0114  BLUF domain-containing protein  28.87 
 
 
150 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3364  BLUF domain protein  32.47 
 
 
150 aa  42.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4786  BLUF domain protein  32.47 
 
 
150 aa  42.7  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0370  BLUF domain protein  36.73 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.943321 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2562  BLUF  30 
 
 
131 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.631295  normal  0.747633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>