54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1270 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1270  BLUF domain-containing protein  100 
 
 		 216 aa  447  1e-125  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.173296  normal  0.770292 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0567  BLUF domain-containing protein  40.37 
 
 		 209 aa  124  1e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237581 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0408  hypothetical protein  35.95 
 
 		 210 aa  119  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0367  hypothetical protein  34.3 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1867  hypothetical protein  28.36 
 
 		 196 aa  77.8  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000117301  normal  0.0395598 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0809  BLUF domain protein  32 
 
 		 140 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.31456  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0764  BLUF domain-containing protein  36.22 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4118  BLUF domain protein  28.81 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1302  BLUF  28.81 
 
 		 140 aa  61.2  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3630  BLUF domain-containing protein  29.41 
 
 		 140 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1075  hypothetical protein  27.12 
 
 		 142 aa  60.5  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0880  BLUF domain-containing protein  33 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0920849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1625  hypothetical protein  29.94 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0491426  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0367  BLUF domain-containing protein  34.02 
 
 		 135 aa  57.4  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0870  sensors of blue-light using FAD  28.81 
 
 		 140 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.355285 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0913  BLUF domain-containing protein  33 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.434617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3075  BLUF domain-containing protein  34.41 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.269213  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1829  BLUF domain-containing protein  30.61 
 
 		 141 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0371971 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4105  BLUF domain-containing protein  25.48 
 
 		 156 aa  53.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1670  BLUF domain-containing protein  27.97 
 
 		 148 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3989  hypothetical protein  30 
 
 		 147 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.693018  normal  0.0712703 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1378  BLUF domain-containing protein  32.98 
 
 		 133 aa  52.4  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2309  BLUF domain protein  28.26 
 
 		 155 aa  52  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00710063  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2753  BLUF domain-containing protein  32.32 
 
 		 142 aa  52.4  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2780  BLUF  32.67 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.648384 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4183  BLUF domain-containing protein  34.04 
 
 		 155 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4041  BLUF domain-containing protein  36 
 
 		 137 aa  50.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4662  BLUF domain-containing protein  32.97 
 
 		 164 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1911  BLUF domain protein  30.65 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0531  BLUF domain-containing protein  30.3 
 
 		 134 aa  48.9  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0811942  normal  0.285805 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2544  BLUF domain-containing protein  33.33 
 
 		 160 aa  48.9  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00348968  normal  0.0337221 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3094  BLUF domain-containing protein  33.98 
 
 		 157 aa  48.1  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0238281 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3670  BLUF  29.79 
 
 		 147 aa  47.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1233  BLUF domain protein  29.9 
 
 		 143 aa  46.6  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0171481  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2579  BLUF domain-containing protein  29.17 
 
 		 141 aa  46.6  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0397  BLUF domain-containing protein  25.66 
 
 		 143 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.160765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4153  BLUF domain protein  31.25 
 
 		 145 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.928162  normal  0.124619 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0370  BLUF domain protein  28.87 
 
 		 135 aa  45.8  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.943321 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3629  expression activator-related protein  31.91 
 
 		 140 aa  45.4  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2569  BLUF domain-containing protein  27.62 
 
 		 134 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0866661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4060  blue-light receptor BLUF domain-containing protein  33.33 
 
 		 134 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2562  BLUF  25.96 
 
 		 131 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.631295  normal  0.747633 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3406  BLUF  22.73 
 
 		 225 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0323377  normal  0.220156 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4104  hypothetical protein  29.57 
 
 		 135 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.973455 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3848  BLUF domain protein  30.93 
 
 		 148 aa  42.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1430  BLUF domain protein  24.14 
 
 		 144 aa  42.7  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0523  BLUF domain protein  27.18 
 
 		 147 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1261  BLUF blue-light receptor  27.42 
 
 		 140 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2921  BLUF domain-containing protein  27.42 
 
 		 140 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2030  BLUF  26.17 
 
 		 150 aa  42  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.138441 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2545  BLUF domain-containing protein  27.66 
 
 		 150 aa  41.6  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2811  BLUF domain-containing protein  23.13 
 
 		 189 aa  41.6  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3039  BLUF domain protein  24.3 
 
 		 135 aa  41.6  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.923464 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0494  BLUF  31 
 
 		 147 aa  41.6  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.303595  normal  0.0369715 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>