101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_0809 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0809  BLUF domain protein  100 
 
 
140 aa  288  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.31456  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0880  BLUF domain-containing protein  99.29 
 
 
140 aa  286  9e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0920849  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0870  sensors of blue-light using FAD  84.29 
 
 
140 aa  252  1.0000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.355285 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3630  BLUF domain-containing protein  82.73 
 
 
140 aa  243  6e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92115  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1302  BLUF  80 
 
 
140 aa  241  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4118  BLUF domain protein  80.58 
 
 
140 aa  239  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0913  BLUF domain-containing protein  80 
 
 
140 aa  237  4e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.434617  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1075  hypothetical protein  69.5 
 
 
142 aa  207  3e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1829  BLUF domain-containing protein  62.86 
 
 
141 aa  187  4e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0371971 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3670  BLUF  55.71 
 
 
147 aa  160  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3989  hypothetical protein  53.57 
 
 
147 aa  141  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.693018  normal  0.0712703 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1330  hypothetical protein  68.04 
 
 
142 aa  140  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24136  hitchhiker  0.00281182 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1233  BLUF domain protein  41.41 
 
 
143 aa  103  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0171481  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1670  BLUF domain-containing protein  33.08 
 
 
148 aa  92.8  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4153  BLUF domain protein  36.11 
 
 
145 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.928162  normal  0.124619 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0764  BLUF domain-containing protein  38.46 
 
 
138 aa  90.5  6e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2753  BLUF domain-containing protein  36.22 
 
 
142 aa  90.1  8e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1625  hypothetical protein  37.19 
 
 
169 aa  85.9  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0491426  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3075  BLUF domain-containing protein  41.03 
 
 
168 aa  81.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.269213  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0567  BLUF domain-containing protein  40 
 
 
209 aa  80.9  0.000000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237581 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1828  BLUF domain-containing protein  36.09 
 
 
296 aa  80.1  0.000000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366569  normal  0.9646 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2641  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  44.09 
 
 
1118 aa  79.3  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.604832  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3406  BLUF  40.22 
 
 
225 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0323377  normal  0.220156 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0216  BLUF domain-containing protein  50 
 
 
450 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1565  AppA, antirepressor of ppsR, sensor of blue light  48.57 
 
 
450 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.935845  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1867  hypothetical protein  36 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000117301  normal  0.0395598 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0517  BLUF  43.3 
 
 
141 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.870314  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1911  BLUF domain protein  35.25 
 
 
196 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1261  BLUF blue-light receptor  44.44 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2921  BLUF domain-containing protein  44 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4761  BLUF domain protein  38.78 
 
 
157 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2579  BLUF domain-containing protein  40.37 
 
 
141 aa  73.9  0.0000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3848  BLUF domain protein  43.88 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0367  hypothetical protein  41.94 
 
 
210 aa  73.9  0.0000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0523  BLUF domain protein  36.78 
 
 
147 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0494  BLUF  37.38 
 
 
147 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.303595  normal  0.0369715 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0408  hypothetical protein  40.86 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2544  BLUF domain-containing protein  42 
 
 
160 aa  73.2  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00348968  normal  0.0337221 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4411  BLUF domain-containing protein  33.33 
 
 
309 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.611644  normal  0.129702 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4104  hypothetical protein  40.66 
 
 
135 aa  71.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.973455 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4513  BLUF domain protein  41.84 
 
 
162 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.336016 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1378  BLUF domain-containing protein  34.4 
 
 
133 aa  70.5  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3094  BLUF domain-containing protein  36.73 
 
 
157 aa  70.1  0.000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0238281 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4031  BLUF domain-containing protein  41.84 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.154116 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4401  BLUF domain protein  41.84 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.272942 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0527  BLUF domain protein  31.62 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2030  BLUF  31.25 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.138441 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0367  BLUF domain-containing protein  43.96 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4060  blue-light receptor BLUF domain-containing protein  38.3 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0397  BLUF domain-containing protein  36.61 
 
 
143 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.160765  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00175  hypothetical protein ycgF  38.04 
 
 
390 aa  67.4  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0797  BLUF domain-containing protein  35.48 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.162381  normal  0.119166 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4576  BLUF domain-containing protein  32.35 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18468  hitchhiker  0.00682829 
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7029  BLUF domain protein  46.15 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4105  BLUF domain-containing protein  28.46 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4017  BLUF domain-containing protein  38.54 
 
 
373 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.402107  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3045  BLUF domain-containing protein  51.43 
 
 
448 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0370  BLUF domain protein  41.76 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.943321 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1270  BLUF domain-containing protein  32 
 
 
216 aa  63.5  0.0000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.173296  normal  0.770292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2569  BLUF domain-containing protein  40.91 
 
 
134 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0866661  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2309  BLUF domain protein  37.36 
 
 
155 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00710063  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2545  BLUF domain-containing protein  30.66 
 
 
150 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3321  BLUF  37.78 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.674737  normal  0.172306 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3663  BLUF domain protein  39.33 
 
 
142 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0114  BLUF domain-containing protein  34.02 
 
 
150 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3039  BLUF domain protein  35.56 
 
 
135 aa  61.2  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.923464 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2811  BLUF domain-containing protein  30.95 
 
 
189 aa  60.5  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0531  BLUF domain-containing protein  33 
 
 
134 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0811942  normal  0.285805 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3097  BLUF domain-containing protein  37.63 
 
 
133 aa  60.1  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0735979 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2562  BLUF  32.22 
 
 
131 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.631295  normal  0.747633 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4183  BLUF domain-containing protein  34.44 
 
 
155 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3364  BLUF domain protein  34.02 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4786  BLUF domain protein  34.02 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0996  BLUF domain protein  36.25 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282429  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1986  BLUF/cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  34.02 
 
 
403 aa  57.4  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.758889  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01138  predicted FAD-binding phosphodiesterase  34.02 
 
 
403 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2484  diguanylate phosphodiesterase  34.02 
 
 
403 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1259  BLUF/cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  34.02 
 
 
403 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577088  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1303  BLUF/cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  34.02 
 
 
403 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2463  diguanylate phosphodiesterase  34.02 
 
 
403 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.537462  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01146  hypothetical protein  34.02 
 
 
403 aa  57.4  0.00000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2025  BLUF domain-containing protein  33.68 
 
 
169 aa  57  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.283548  normal  0.388774 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0406  BLUF domain-containing protein  32.35 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2200  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  55.5  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.537433 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0667  sensors of blue-light using FAD  35.96 
 
 
135 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.462757 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2027  BLUF domain-containing protein  35.96 
 
 
144 aa  54.3  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0949  BLUF domain-containing protein  32.22 
 
 
155 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0428449 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0912  BLUF domain protein  32.22 
 
 
155 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.548422 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0888  BLUF domain protein  32.22 
 
 
155 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0990729  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3629  expression activator-related protein  36.56 
 
 
140 aa  53.5  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2780  BLUF  32.58 
 
 
164 aa  53.5  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.648384 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4395  BLUF domain-containing protein  37.18 
 
 
133 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.977421  normal  0.849262 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2032  diguanylate phosphodiesterase  29.93 
 
 
406 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1741  BLUF domain protein  33.72 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.114564 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0285  BLUF  35.16 
 
 
141 aa  51.2  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.947427  normal  0.358648 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5542  BLUF domain-containing protein  32.22 
 
 
155 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.283955  normal  0.0880043 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4662  BLUF domain-containing protein  31.58 
 
 
164 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4041  BLUF domain-containing protein  33.71 
 
 
137 aa  47  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1430  BLUF domain protein  28.74 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2250  hypothetical protein  24.09 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.108306 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>