99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4031 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4031  BLUF domain-containing protein  100 
 
 		 148 aa  301  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.154116 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4401  BLUF domain protein  98.65 
 
 		 148 aa  298  2e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.272942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4513  BLUF domain protein  91.11 
 
 		 162 aa  256  8e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.336016 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4411  BLUF domain-containing protein  59.72 
 
 		 309 aa  165  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.611644  normal  0.129702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0523  BLUF domain protein  53.15 
 
 		 147 aa  161  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0494  BLUF  50.34 
 
 		 147 aa  153  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.303595  normal  0.0369715 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1828  BLUF domain-containing protein  56.74 
 
 		 296 aa  146  7e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366569  normal  0.9646 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3848  BLUF domain protein  44.76 
 
 		 148 aa  130  9e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2030  BLUF  42.86 
 
 		 150 aa  124  6e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.138441 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4761  BLUF domain protein  41.61 
 
 		 157 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0517  BLUF  40.71 
 
 		 141 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.870314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1233  BLUF domain protein  38.93 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0171481  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4786  BLUF domain protein  35.92 
 
 		 150 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0114  BLUF domain-containing protein  34.97 
 
 		 150 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3364  BLUF domain protein  35.92 
 
 		 150 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4576  BLUF domain-containing protein  45.19 
 
 		 162 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18468  hitchhiker  0.00682829 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2545  BLUF domain-containing protein  38.83 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0527  BLUF domain protein  38.61 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3663  BLUF domain protein  45.12 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2562  BLUF  47.87 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.631295  normal  0.747633 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2569  BLUF domain-containing protein  38.1 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0866661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1670  BLUF domain-containing protein  34.17 
 
 		 148 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4104  hypothetical protein  38.61 
 
 		 135 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.973455 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4060  blue-light receptor BLUF domain-containing protein  39.56 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3321  BLUF  39.8 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.674737  normal  0.172306 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1075  hypothetical protein  36.59 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0406  BLUF domain-containing protein  40 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0397  BLUF domain-containing protein  39.8 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.160765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4118  BLUF domain protein  39.62 
 
 		 140 aa  72  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2811  BLUF domain-containing protein  39.05 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2544  BLUF domain-containing protein  45.98 
 
 		 160 aa  71.6  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00348968  normal  0.0337221 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2641  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.35 
 
 		 1118 aa  71.6  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.604832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2921  BLUF domain-containing protein  39.58 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0880  BLUF domain-containing protein  40.82 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0920849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1261  BLUF blue-light receptor  39 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1911  BLUF domain protein  47.37 
 
 		 196 aa  70.5  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0809  BLUF domain protein  41.84 
 
 		 140 aa  70.1  0.000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.31456  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3989  hypothetical protein  36.64 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.693018  normal  0.0712703 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4662  BLUF domain-containing protein  37.86 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2025  BLUF domain-containing protein  36.27 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.283548  normal  0.388774 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3039  BLUF domain protein  46.58 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.923464 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3630  BLUF domain-containing protein  39.8 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7029  BLUF domain protein  31.09 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3075  BLUF domain-containing protein  34.06 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.269213  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0764  BLUF domain-containing protein  30.37 
 
 		 138 aa  67  0.00000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0797  BLUF domain-containing protein  31.21 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.162381  normal  0.119166 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1302  BLUF  38.61 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1829  BLUF domain-containing protein  35.4 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0371971 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3670  BLUF  33.58 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1625  hypothetical protein  24.82 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0491426  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0367  BLUF domain-containing protein  35.51 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4153  BLUF domain protein  26.53 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.928162  normal  0.124619 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0285  BLUF  42.68 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.947427  normal  0.358648 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0870  sensors of blue-light using FAD  37.76 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.355285 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0913  BLUF domain-containing protein  38.78 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.434617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4017  BLUF domain-containing protein  36.08 
 
 		 373 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.402107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2753  BLUF domain-containing protein  28.47 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2579  BLUF domain-containing protein  35.48 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3045  BLUF domain-containing protein  41.18 
 
 		 448 aa  62  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3629  expression activator-related protein  38.1 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3406  BLUF  30.85 
 
 		 225 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0323377  normal  0.220156 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0216  BLUF domain-containing protein  38.82 
 
 		 450 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3094  BLUF domain-containing protein  38.14 
 
 		 157 aa  61.6  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0238281 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1565  AppA, antirepressor of ppsR, sensor of blue light  38.82 
 
 		 450 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.935845  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1430  BLUF domain protein  38.24 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2780  BLUF  38.67 
 
 		 164 aa  60.5  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.648384 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4395  BLUF domain-containing protein  35.58 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.977421  normal  0.849262 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2027  BLUF domain-containing protein  32.43 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0996  BLUF domain protein  33.33 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282429  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4183  BLUF domain-containing protein  30.56 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0667  sensors of blue-light using FAD  33.66 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.462757 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3097  BLUF domain-containing protein  33.98 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0735979 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4105  BLUF domain-containing protein  31.25 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0370  BLUF domain protein  31.13 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.943321 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1867  hypothetical protein  33.33 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000117301  normal  0.0395598 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0912  BLUF domain protein  26.39 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.548422 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0949  BLUF domain-containing protein  26.39 
 
 		 155 aa  53.5  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0428449 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1378  BLUF domain-containing protein  31.33 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00175  hypothetical protein ycgF  31.58 
 
 		 390 aa  52.4  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0567  BLUF domain-containing protein  32 
 
 		 209 aa  51.6  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237581 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0888  BLUF domain protein  25.69 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0990729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2309  BLUF domain protein  29.63 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00710063  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2484  diguanylate phosphodiesterase  34.41 
 
 		 403 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01146  hypothetical protein  34.41 
 
 		 403 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01138  predicted FAD-binding phosphodiesterase  34.41 
 
 		 403 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1259  BLUF/cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  34.41 
 
 		 403 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577088  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1303  BLUF/cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  34.41 
 
 		 403 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2463  diguanylate phosphodiesterase  34.41 
 
 		 403 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.537462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1986  BLUF/cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  34.41 
 
 		 403 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.758889  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2250  hypothetical protein  29.17 
 
 		 152 aa  50.4  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.108306 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0367  hypothetical protein  29.9 
 
 		 210 aa  50.4  0.000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4041  BLUF domain-containing protein  32.73 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0408  hypothetical protein  32.35 
 
 		 210 aa  49.7  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2032  diguanylate phosphodiesterase  32.43 
 
 		 406 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.252984 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1741  BLUF domain protein  37.78 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114564 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0531  BLUF domain-containing protein  31.73 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0811942  normal  0.285805 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2200  hypothetical protein  31.58 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.537433 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5542  BLUF domain-containing protein  27.66 
 
 		 155 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.283955  normal  0.0880043 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1330  hypothetical protein  27.78 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24136  hitchhiker  0.00281182 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>