97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0517 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0517  BLUF  100 
 
 		 141 aa  288  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.870314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0523  BLUF domain protein  53.9 
 
 		 147 aa  146  8e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0494  BLUF  48.23 
 
 		 147 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.303595  normal  0.0369715 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3848  BLUF domain protein  43.17 
 
 		 148 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4401  BLUF domain protein  40.3 
 
 		 148 aa  103  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.272942 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4031  BLUF domain-containing protein  47.27 
 
 		 148 aa  103  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.154116 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4513  BLUF domain protein  40.31 
 
 		 162 aa  101  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.336016 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4411  BLUF domain-containing protein  38.97 
 
 		 309 aa  100  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.611644  normal  0.129702 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4761  BLUF domain protein  42.03 
 
 		 157 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1828  BLUF domain-containing protein  51.58 
 
 		 296 aa  97.1  8e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.366569  normal  0.9646 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2030  BLUF  32.59 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.138441 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0527  BLUF domain protein  36.17 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2025  BLUF domain-containing protein  39.39 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.283548  normal  0.388774 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0809  BLUF domain protein  43.3 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.31456  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0880  BLUF domain-containing protein  41.24 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0920849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0114  BLUF domain-containing protein  34.74 
 
 		 150 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3630  BLUF domain-containing protein  41.41 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.92115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2545  BLUF domain-containing protein  35.79 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4576  BLUF domain-containing protein  39.18 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18468  hitchhiker  0.00682829 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1302  BLUF  40.21 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0870  sensors of blue-light using FAD  44.16 
 
 		 140 aa  70.1  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.355285 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3321  BLUF  44.74 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.674737  normal  0.172306 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3364  BLUF domain protein  33.68 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0397  BLUF domain-containing protein  45.33 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.160765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4786  BLUF domain protein  33.68 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1075  hypothetical protein  42.27 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4118  BLUF domain protein  40.21 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2569  BLUF domain-containing protein  42.11 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0866661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0913  BLUF domain-containing protein  39.18 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.434617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3670  BLUF  39.78 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1625  hypothetical protein  33.98 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0491426  hitchhiker  0.00895829 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4662  BLUF domain-containing protein  33.33 
 
 		 164 aa  64.7  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.553573 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2579  BLUF domain-containing protein  38.04 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1829  BLUF domain-containing protein  43.04 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0371971 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3045  BLUF domain-containing protein  37.93 
 
 		 448 aa  62.8  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4153  BLUF domain protein  31 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.928162  normal  0.124619 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0764  BLUF domain-containing protein  32.26 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3989  hypothetical protein  40.4 
 
 		 147 aa  63.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.693018  normal  0.0712703 
 
 
-
 
NC_013735  Slin_7029  BLUF domain protein  26.62 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3039  BLUF domain protein  44.74 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.923464 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2811  BLUF domain-containing protein  29.85 
 
 		 189 aa  62  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3075  BLUF domain-containing protein  38.64 
 
 		 168 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.269213  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2544  BLUF domain-containing protein  40.48 
 
 		 160 aa  62  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00348968  normal  0.0337221 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3629  expression activator-related protein  37.25 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0406  BLUF domain-containing protein  38.95 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1233  BLUF domain protein  34.95 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0171481  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0216  BLUF domain-containing protein  36.96 
 
 		 450 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2641  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.26 
 
 		 1118 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.604832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1565  AppA, antirepressor of ppsR, sensor of blue light  36.96 
 
 		 450 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.935845  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0567  BLUF domain-containing protein  35.48 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237581 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2562  BLUF  42.67 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.631295  normal  0.747633 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4017  BLUF domain-containing protein  32.26 
 
 		 373 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.402107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2027  BLUF domain-containing protein  35.64 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0367  hypothetical protein  36.78 
 
 		 210 aa  57  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4104  hypothetical protein  38.57 
 
 		 135 aa  57  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.973455 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2753  BLUF domain-containing protein  35.9 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1911  BLUF domain protein  34.71 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1261  BLUF blue-light receptor  38.46 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0367  BLUF domain-containing protein  41.43 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2921  BLUF domain-containing protein  38.46 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0408  hypothetical protein  38.16 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3406  BLUF  33.33 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0323377  normal  0.220156 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2250  hypothetical protein  29 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.108306 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0797  BLUF domain-containing protein  37.66 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.162381  normal  0.119166 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4105  BLUF domain-containing protein  32.43 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0996  BLUF domain protein  33.71 
 
 		 134 aa  52  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282429  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1430  BLUF domain protein  35.14 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4183  BLUF domain-containing protein  33.33 
 
 		 155 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4060  blue-light receptor BLUF domain-containing protein  34.21 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3094  BLUF domain-containing protein  30.97 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0238281 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1867  hypothetical protein  31.58 
 
 		 196 aa  50.8  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000117301  normal  0.0395598 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0370  BLUF domain protein  35.71 
 
 		 135 aa  50.4  0.000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.943321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3663  BLUF domain protein  35.62 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2309  BLUF domain protein  28.71 
 
 		 155 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00710063  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0912  BLUF domain protein  31.03 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.548422 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0888  BLUF domain protein  29.89 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0990729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5542  BLUF domain-containing protein  28 
 
 		 155 aa  48.1  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.283955  normal  0.0880043 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1670  BLUF domain-containing protein  33.78 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0949  BLUF domain-containing protein  31.03 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0428449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4395  BLUF domain-containing protein  33.02 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.977421  normal  0.849262 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0285  BLUF  37.65 
 
 		 141 aa  47.4  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.947427  normal  0.358648 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2780  BLUF  28.1 
 
 		 164 aa  47  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.648384 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1378  BLUF domain-containing protein  32.43 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3097  BLUF domain-containing protein  34.62 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0735979 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4041  BLUF domain-containing protein  34.15 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790188 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1741  BLUF domain protein  31.33 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.114564 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00175  hypothetical protein ycgF  32.47 
 
 		 390 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0667  sensors of blue-light using FAD  32.1 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532054  normal  0.462757 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1259  BLUF/cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  36.23 
 
 		 403 aa  41.2  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0577088  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1303  BLUF/cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  36.23 
 
 		 403 aa  41.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01146  hypothetical protein  36.23 
 
 		 403 aa  41.2  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1986  BLUF/cyclic diguanylate phosphodiesterase domain-containing protein  36.23 
 
 		 403 aa  41.6  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.758889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2463  diguanylate phosphodiesterase  36.23 
 
 		 403 aa  41.2  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.537462  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2484  diguanylate phosphodiesterase  36.23 
 
 		 403 aa  41.2  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01138  predicted FAD-binding phosphodiesterase  36.23 
 
 		 403 aa  41.2  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0531  BLUF domain-containing protein  35.62 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0811942  normal  0.285805 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1330  hypothetical protein  37.74 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.24136  hitchhiker  0.00281182 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>