34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3030 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_3030  hypothetical protein  100 
 
 		 175 aa  351  2e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.627552  normal  0.12237 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1625  hypothetical protein  52.33 
 
 		 171 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100987 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2602  hypothetical protein  47.02 
 
 		 170 aa  143  1e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2859  hypothetical protein  36.26 
 
 		 206 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.175879  normal  0.0114173 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2429  hypothetical protein  44.3 
 
 		 164 aa  112  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1594  hypothetical protein  38.99 
 
 		 212 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.869699  hitchhiker  0.000000510539 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2764  hypothetical protein  39.19 
 
 		 218 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.572683  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2784  hypothetical protein  37.42 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3092  hypothetical protein  40.27 
 
 		 197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2463  hypothetical protein  34.68 
 
 		 187 aa  105  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1404  hypothetical protein  39.18 
 
 		 197 aa  104  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000195716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1469  hypothetical protein  38.6 
 
 		 197 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1457  hypothetical protein  39.05 
 
 		 197 aa  101  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000911468 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2680  hypothetical protein  32.14 
 
 		 182 aa  96.7  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1526  hypothetical protein  36.36 
 
 		 169 aa  95.5  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02704  hypothetical protein  31.97 
 
 		 222 aa  79.7  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.55674  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1660  hypothetical protein  37.96 
 
 		 167 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3161  hypothetical protein  33.55 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0525  hypothetical protein  34.44 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2814  hypothetical protein  31.75 
 
 		 168 aa  66.2  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05145  hypothetical protein  30.56 
 
 		 158 aa  63.2  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001270  hypothetical protein  31.69 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.355888  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2915  hypothetical protein  36.36 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1105  hypothetical protein  30.52 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2769  hypothetical protein  36.52 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2171  hypothetical protein  30.26 
 
 		 179 aa  58.5  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.114551 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1947  hypothetical protein  35 
 
 		 155 aa  57.4  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3084  hypothetical protein  36.73 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.223372  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1203  hypothetical protein  29.75 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1745  hypothetical protein  29.82 
 
 		 238 aa  47.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1562  hypothetical protein  29.88 
 
 		 164 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5139  hypothetical protein  32.28 
 
 		 173 aa  44.3  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.977257 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3800  hypothetical protein  28.57 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.472138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2137  putative transmembrane protein  27.59 
 
 		 170 aa  42  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00280947 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>