More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2802 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2802  ABC transporter related  100 
 
 		 225 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1793  putative phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  70.23 
 
 		 231 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1544  ABC transporter related  56.28 
 
 		 225 aa  257  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.75811  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3310  putative phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  54.11 
 
 		 236 aa  251  9.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2346  ABC transporter-related protein  56.42 
 
 		 221 aa  248  7e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0523662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1748  ABC transporter related  54.21 
 
 		 276 aa  246  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00373907  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1898  ABC transporter related  48.66 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1769  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  47.44 
 
 		 225 aa  211  9e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0632527  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2484  ABC transporter related  52.76 
 
 		 225 aa  207  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2744  ABC transporter related  48.89 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.600258  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1447  ABC transporter related  42.92 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1497  ABC transporter related  39.52 
 
 		 222 aa  151  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3493  ABC transporter related  40.87 
 
 		 226 aa  149  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2784  ABC transporter related  36.59 
 
 		 242 aa  128  7.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.197707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1649  ABC transporter related protein  33.2 
 
 		 248 aa  122  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0694  ABC transporter  34.54 
 
 		 265 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.109577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07851  putative phosphonate ABC transporter  32.64 
 
 		 245 aa  118  6e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266674 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0790  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.87 
 
 		 265 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1293  ATPase  34.84 
 
 		 234 aa  116  3e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.484642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07271  putative phosphonate ABC transporter  31.98 
 
 		 246 aa  115  5e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0413071  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07251  putative phosphonate ABC transporter  31.58 
 
 		 246 aa  115  6e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0829  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.89 
 
 		 280 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0104  ATPase  30.04 
 
 		 244 aa  112  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07291  putative phosphonate ABC transporter  29.18 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.305194  hitchhiker  0.00460957 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0672  ATPase  31.84 
 
 		 246 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2433  ABC transporter-like  33.33 
 
 		 265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0814206  normal  0.123252 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0377  ABC transporter related  32.05 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.308685  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0825  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.2 
 
 		 269 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  0.0442115 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4361  ABC transporter related  33.2 
 
 		 264 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0829786  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2916  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.73 
 
 		 284 aa  107  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178582  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12501  hypothetical protein  29.88 
 
 		 261 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0866  ABC transporter related  32.39 
 
 		 264 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1184  ATPase  34.56 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.795417  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0484  ABC transporter related  33.19 
 
 		 499 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.431216  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1745  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  32.94 
 
 		 278 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.35608  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0489  ABC transporter-related protein  33.19 
 
 		 498 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.878745  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0839  ABC phophonates transporter, ATPase subunit PhnC  29.84 
 
 		 301 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0851593 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0393  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.17 
 
 		 264 aa  106  3e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.385125 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1616  ABC transporter related  33.33 
 
 		 277 aa  105  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1594  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.78 
 
 		 261 aa  105  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4177  ATPase  30.99 
 
 		 281 aa  105  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1683  ABC transporter related protein  31.47 
 
 		 269 aa  103  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2890  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.4 
 
 		 274 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0336941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07451  putative phosphonate ABC transporter  30.36 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2013  ABC transporter related  33.05 
 
 		 277 aa  102  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0455  phosphonate ABC transporter ATPase  31.9 
 
 		 498 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.874499  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1690  ABC transporter related  33.19 
 
 		 277 aa  102  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0259  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  28.79 
 
 		 270 aa  102  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0745614 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0309  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  29.44 
 
 		 262 aa  102  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.053951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3198  ABC transporter related  29.84 
 
 		 266 aa  102  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.012913 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02560  ABC transporter  30.95 
 
 		 249 aa  101  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.092761  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3709  phosphonate ABC transporter ATP-binding  30.49 
 
 		 272 aa  101  8e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.144608 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2056  ABC transporter related  32.61 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21160  ABC transporter ATP-binding protein  31.71 
 
 		 267 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.511735  normal  0.707952 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2299  ABC phosphate/phosphonate transport system ATPase  28.81 
 
 		 259 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5876  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.93 
 
 		 267 aa  99.8  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0775  phosphonate ABC transporter ATP-binding  30.96 
 
 		 309 aa  99.4  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal  0.944742 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3516  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.35 
 
 		 261 aa  99.4  4e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2804  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  34.82 
 
 		 379 aa  99  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000395219  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3350  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  30.77 
 
 		 307 aa  99  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3338  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  30.77 
 
 		 307 aa  99  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3304  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  30.77 
 
 		 307 aa  99  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296205  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4346  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  30.83 
 
 		 262 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4659  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  30.83 
 
 		 262 aa  98.6  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1722  ABC transporter-related protein  31.74 
 
 		 279 aa  99  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000201925 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2964  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.33 
 
 		 296 aa  98.6  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1297  ABC transporter related  32.43 
 
 		 249 aa  98.6  7e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1555  sulphate transport system permease protein 1  32.63 
 
 		 357 aa  98.2  8e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.824545 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4431  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  29.84 
 
 		 284 aa  98.2  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1805  ABC transporter ATP-binding protein  31.05 
 
 		 267 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5619  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  30.83 
 
 		 262 aa  98.2  8e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03977  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  30.83 
 
 		 262 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0278  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  32.07 
 
 		 279 aa  98.2  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3019  ABC transporter related  30.9 
 
 		 507 aa  98.2  9e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6091  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.8 
 
 		 288 aa  98.2  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19780  Phosphonate ABC transporter, ATP binding component  32.4 
 
 		 266 aa  98.2  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211931  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03938  hypothetical protein  30.83 
 
 		 262 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3921  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  30.83 
 
 		 262 aa  98.2  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3886  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.62 
 
 		 262 aa  97.8  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4571  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  30.83 
 
 		 262 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0503  sulphate transport system permease protein 1  31.28 
 
 		 360 aa  97.4  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0730  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  29.44 
 
 		 354 aa  97.4  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4184  ABC transporter related protein  34.25 
 
 		 253 aa  97.8  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3919  ABC transporter related protein  34.27 
 
 		 275 aa  97.8  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1184  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  30.36 
 
 		 307 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2407  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  30.36 
 
 		 307 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0181  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.44 
 
 		 252 aa  97.1  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0323  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  30.36 
 
 		 307 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.558714  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4524  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.15 
 
 		 307 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2593  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  30.36 
 
 		 307 aa  97.1  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3258  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.56 
 
 		 272 aa  97.1  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.617138  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5273  histidine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.2 
 
 		 276 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4117  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  29.84 
 
 		 282 aa  96.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.914371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1027  ABC transporter related  34.04 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0179899 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14301  putative phosphonate ABC transporter  32 
 
 		 247 aa  96.3  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  30.83 
 
 		 375 aa  96.7  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3993  ABC transporter related  35.45 
 
 		 253 aa  96.7  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.564938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4831  ABC transporter  37.2 
 
 		 276 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.687398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0257  ABC transporter related  34.25 
 
 		 316 aa  95.9  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.784545  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4787  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.89 
 
 		 272 aa  96.3  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334656  normal  0.0646281 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>