More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_4361 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4361  ABC transporter related  100 
 
 		 264 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0829786  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0825  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  87.02 
 
 		 269 aa  429  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  0.0442115 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0866  ABC transporter related  85.61 
 
 		 264 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2433  ABC transporter-like  68.3 
 
 		 265 aa  340  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0814206  normal  0.123252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1805  ABC transporter ATP-binding protein  66.79 
 
 		 267 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0694  ABC transporter  65.04 
 
 		 265 aa  329  3e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.109577  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0790  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  64.53 
 
 		 265 aa  324  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21160  ABC transporter ATP-binding protein  66.42 
 
 		 267 aa  310  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.511735  normal  0.707952 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3198  ABC transporter related  62.45 
 
 		 266 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.012913 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19780  Phosphonate ABC transporter, ATP binding component  64.04 
 
 		 266 aa  286  2e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211931  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3337  ABC transporter related  57.2 
 
 		 274 aa  262  3e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.373917 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1825  ABC transporter related  54.15 
 
 		 275 aa  258  5.0000000000000005e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.123024 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2013  ABC transporter related  57.94 
 
 		 277 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1690  ABC transporter related  57.94 
 
 		 277 aa  253  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1616  ABC transporter related  50.99 
 
 		 277 aa  235  6e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2056  ABC transporter related  49.8 
 
 		 272 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1722  ABC transporter-related protein  51.72 
 
 		 279 aa  218  8.999999999999998e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000201925 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2237  ABC transporter related  47.6 
 
 		 277 aa  210  2e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2784  ABC transporter related  45.49 
 
 		 242 aa  182  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.197707 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1594  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.06 
 
 		 261 aa  175  8e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0455  phosphonate ABC transporter ATPase  45.64 
 
 		 498 aa  171  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.874499  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1649  ABC transporter related protein  49.58 
 
 		 248 aa  169  5e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0484  ABC transporter related  45 
 
 		 499 aa  168  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.431216  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3516  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.98 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0489  ABC transporter-related protein  44.4 
 
 		 498 aa  164  9e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.878745  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2299  ABC phosphate/phosphonate transport system ATPase  40.91 
 
 		 259 aa  165  9e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0181  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.83 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3019  ABC transporter related  45.27 
 
 		 507 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1449  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.1 
 
 		 254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00372903  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2203  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  38.98 
 
 		 252 aa  161  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0365  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  40.35 
 
 		 252 aa  160  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3474  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  35.37 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3391  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  35.37 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.193005  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3749  phosphonate ABC transporter ATP-binding  35.37 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3703  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  35.37 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000015251 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3745  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  35.37 
 
 		 257 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3440  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  35.37 
 
 		 257 aa  158  7e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0335  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  36.09 
 
 		 246 aa  158  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3722  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  34.93 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156195  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4035  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.33 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.542235  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0215  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.33 
 
 		 273 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0775  phosphonate ABC transporter ATP-binding  38.58 
 
 		 309 aa  156  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal  0.944742 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0130  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  35.81 
 
 		 261 aa  156  3e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000163104  hitchhiker  0.00000028065 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3264  hypothetical protein  39.39 
 
 		 273 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.634787 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3256  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  40.82 
 
 		 266 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.485781  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0928  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.74 
 
 		 256 aa  155  7e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00101449  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0768  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.06 
 
 		 270 aa  155  7e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4117  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.21 
 
 		 282 aa  154  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.914371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2920  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.87 
 
 		 272 aa  153  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4994  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  40.26 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2677  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.77 
 
 		 260 aa  152  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0553597 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2339  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  33.62 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000337848  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3865  phosphonate ABC transporter ATP-binding  37.4 
 
 		 272 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1927  phosphonate ABC transporter ATP-binding  38.21 
 
 		 287 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.75646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4431  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.74 
 
 		 284 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2799  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  36.55 
 
 		 278 aa  152  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0894  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.41 
 
 		 275 aa  152  8e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.658454  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1345  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  36.55 
 
 		 278 aa  152  8e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0502345 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2878  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.55 
 
 		 278 aa  151  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2409  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  40.95 
 
 		 292 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3372  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.37 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014777  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl572  phosphonate ABC transporter ATP-binding component  32.61 
 
 		 249 aa  149  3e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0458  ABC type ATPase  40 
 
 		 272 aa  149  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.345895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0422  ABC type ATPase  40 
 
 		 272 aa  149  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.861299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12501  hypothetical protein  34.44 
 
 		 261 aa  149  5e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1319  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.82 
 
 		 278 aa  149  5e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2683  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.6 
 
 		 286 aa  149  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0052985  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1410  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.13 
 
 		 277 aa  149  6e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0829  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.27 
 
 		 280 aa  148  7e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0225  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.6 
 
 		 310 aa  148  7e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0278  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  33.96 
 
 		 279 aa  148  8e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2080  ABC transporter related  38.79 
 
 		 272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4432  phosphonate ABC transporter ATP-binding  36.55 
 
 		 271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6355  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  34.71 
 
 		 264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.424299  normal  0.5531 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1521  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  34.93 
 
 		 248 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  normal  0.0212059 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3862  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.84 
 
 		 282 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3963  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.66 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.704771 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3694  ABC phosphonate transporter ATP-binding protein  38.63 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0857  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.68 
 
 		 264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0840663  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29130  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  36.13 
 
 		 267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4201  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.96 
 
 		 273 aa  145  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.171703  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4084  phosphonate ABC transporter ATP-binding  36.47 
 
 		 274 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.620388  normal  0.0392209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5858  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  38.49 
 
 		 269 aa  145  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3820  phosphonate ABC transporter ATP-binding  36.69 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.693168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3993  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.57 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.642623  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1278  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.57 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3242  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.57 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980912  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3234  phosphonate ABC transporter ATP-binding  37.16 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3709  phosphonate ABC transporter ATP-binding  36.41 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.144608 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1231  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 		 265 aa  143  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.353455 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4177  ATPase  37.18 
 
 		 281 aa  142  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4668  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.6 
 
 		 300 aa  142  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.621423  decreased coverage  0.000827837 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2676  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.41 
 
 		 279 aa  142  6e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2995  phosphonate ABC transporter ATP-binding  39.41 
 
 		 279 aa  142  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.537941 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3794  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  35.27 
 
 		 225 aa  142  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.551084  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0133  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  33.76 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20300  ATP-binding component of ABC phosphonate transporter  40.76 
 
 		 278 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.540657  normal  0.410183 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0128  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  33.76 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4152  ABC transporter related  37.05 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2286  ABC transporter related  37.05 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>