More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1649 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_1649  ABC transporter related protein  100 
 
 		 248 aa  464  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2784  ABC transporter related  70.54 
 
 		 242 aa  323  1e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.197707 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0694  ABC transporter  48.16 
 
 		 265 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.109577  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0790  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.28 
 
 		 265 aa  203  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1825  ABC transporter related  46.91 
 
 		 275 aa  188  5.999999999999999e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.123024 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1690  ABC transporter related  50 
 
 		 277 aa  186  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1805  ABC transporter ATP-binding protein  48.13 
 
 		 267 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2013  ABC transporter related  49.6 
 
 		 277 aa  184  8e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4361  ABC transporter related  49.58 
 
 		 264 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0829786  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0866  ABC transporter related  48.33 
 
 		 264 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0825  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  48.15 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  0.0442115 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19780  Phosphonate ABC transporter, ATP binding component  47.93 
 
 		 266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211931  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3908  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.91 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.480865 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3859  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.91 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5858  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  43.98 
 
 		 269 aa  176  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289421  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2299  ABC phosphate/phosphonate transport system ATPase  43.67 
 
 		 259 aa  175  5e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2433  ABC transporter-like  48.26 
 
 		 265 aa  175  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0814206  normal  0.123252 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3337  ABC transporter related  47.33 
 
 		 274 aa  175  8e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.373917 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3516  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.78 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0768  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.74 
 
 		 270 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21160  ABC transporter ATP-binding protein  48.55 
 
 		 267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.511735  normal  0.707952 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4432  phosphonate ABC transporter ATP-binding  43.85 
 
 		 271 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3198  ABC transporter related  46.09 
 
 		 266 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.012913 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3820  phosphonate ABC transporter ATP-binding  41.49 
 
 		 270 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.693168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14301  putative phosphonate ABC transporter  40.87 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2890  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.34 
 
 		 274 aa  166  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0336941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4084  phosphonate ABC transporter ATP-binding  42.28 
 
 		 274 aa  166  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.620388  normal  0.0392209 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0857  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 		 264 aa  166  4e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0840663  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1322  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.27 
 
 		 269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5876  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.62 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4960  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  41.49 
 
 		 269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3324  ATPase  39.41 
 
 		 275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0928  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.12 
 
 		 256 aa  160  1e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00101449  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1594  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.55 
 
 		 261 aa  160  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4994  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.26 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4152  ABC transporter related  39.09 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3865  phosphonate ABC transporter ATP-binding  40.33 
 
 		 272 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2677  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.04 
 
 		 260 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0553597 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2286  ABC transporter related  39.09 
 
 		 266 aa  160  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0225  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.39 
 
 		 310 aa  159  4e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2878  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.93 
 
 		 278 aa  158  6e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2920  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  40.91 
 
 		 272 aa  158  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2799  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  35.93 
 
 		 278 aa  158  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1927  phosphonate ABC transporter ATP-binding  40.16 
 
 		 287 aa  158  7e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.75646  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1345  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  35.93 
 
 		 278 aa  158  7e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0502345 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2187  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.43 
 
 		 275 aa  158  9e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0455  phosphonate ABC transporter ATPase  46.69 
 
 		 498 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.874499  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1745  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  40.87 
 
 		 278 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.35608  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4431  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.84 
 
 		 284 aa  157  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1231  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.99 
 
 		 265 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.353455 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4177  ATPase  42 
 
 		 281 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0775  phosphonate ABC transporter ATP-binding  41.43 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal  0.944742 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29130  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  42.04 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3963  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.51 
 
 		 284 aa  156  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.704771 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2555  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  40.48 
 
 		 277 aa  156  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.205375  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2995  phosphonate ABC transporter ATP-binding  42.73 
 
 		 279 aa  156  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.537941 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2676  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.73 
 
 		 279 aa  156  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1420  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.3 
 
 		 273 aa  155  4e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2247  ABC transporter  40.08 
 
 		 277 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0130  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  36.36 
 
 		 261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000163104  hitchhiker  0.00000028065 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4201  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.04 
 
 		 273 aa  155  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.171703  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2409  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.26 
 
 		 292 aa  155  6e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl572  phosphonate ABC transporter ATP-binding component  33.9 
 
 		 249 aa  155  7e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0484  ABC transporter related  46.28 
 
 		 499 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.431216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20300  ATP-binding component of ABC phosphonate transporter  41.27 
 
 		 278 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.540657  normal  0.410183 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1319  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  40.26 
 
 		 278 aa  155  8e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3019  ABC transporter related  47.92 
 
 		 507 aa  154  9e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07851  putative phosphonate ABC transporter  37.6 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266674 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3709  phosphonate ABC transporter ATP-binding  37.04 
 
 		 272 aa  154  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.144608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6355  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  39.91 
 
 		 264 aa  153  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.424299  normal  0.5531 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3440  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  36.8 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2156  phosphonate ABC transporter ATP-binding  44.16 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0335  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  33.47 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3474  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  36.8 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3391  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  36.8 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.193005  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3749  phosphonate ABC transporter ATP-binding  36.8 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4117  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.45 
 
 		 282 aa  152  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.914371  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4575  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.42 
 
 		 281 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3703  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  36.8 
 
 		 257 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000015251 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12501  hypothetical protein  34.4 
 
 		 261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3745  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  36.8 
 
 		 257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0489  ABC transporter-related protein  46.28 
 
 		 498 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.878745  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2056  ABC transporter related  44 
 
 		 272 aa  152  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2203  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 		 252 aa  151  8e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0597  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.56 
 
 		 270 aa  151  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00266956 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4668  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.33 
 
 		 300 aa  150  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.621423  decreased coverage  0.000827837 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3264  hypothetical protein  40.69 
 
 		 273 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.634787 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3993  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.78 
 
 		 279 aa  150  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.642623  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1278  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.78 
 
 		 281 aa  151  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3242  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.78 
 
 		 279 aa  150  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980912  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3722  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156195  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1000  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.34 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6364  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  38.11 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0620834  normal  0.857375 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2964  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  40.24 
 
 		 296 aa  150  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3862  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.15 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1410  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.66 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2339  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.62 
 
 		 257 aa  149  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000337848  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2683  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.14 
 
 		 286 aa  149  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0052985  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6091  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.84 
 
 		 288 aa  149  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0278  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  37.76 
 
 		 279 aa  149  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>