More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0866 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0866  ABC transporter related  100 
 
 		 264 aa  517  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0825  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  94.3 
 
 		 269 aa  471  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  0.0442115 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4361  ABC transporter related  85.61 
 
 		 264 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0829786  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2433  ABC transporter-like  69.06 
 
 		 265 aa  342  5e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0814206  normal  0.123252 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0694  ABC transporter  63.77 
 
 		 265 aa  331  8e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.109577  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0790  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  64.91 
 
 		 265 aa  329  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1805  ABC transporter ATP-binding protein  65.93 
 
 		 267 aa  326  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21160  ABC transporter ATP-binding protein  65.56 
 
 		 267 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.511735  normal  0.707952 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3198  ABC transporter related  62.41 
 
 		 266 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.012913 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19780  Phosphonate ABC transporter, ATP binding component  62.45 
 
 		 266 aa  278  4e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211931  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3337  ABC transporter related  56.69 
 
 		 274 aa  265  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.373917 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1825  ABC transporter related  54.88 
 
 		 275 aa  263  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.123024 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2013  ABC transporter related  56.49 
 
 		 277 aa  257  2e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1690  ABC transporter related  56.49 
 
 		 277 aa  255  4e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1616  ABC transporter related  51.61 
 
 		 277 aa  239  4e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2056  ABC transporter related  50.8 
 
 		 272 aa  229  5e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1722  ABC transporter-related protein  51 
 
 		 279 aa  228  9e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000201925 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2237  ABC transporter related  49 
 
 		 277 aa  216  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2784  ABC transporter related  45.8 
 
 		 242 aa  192  6e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.197707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1649  ABC transporter related protein  48.33 
 
 		 248 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1594  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  40.77 
 
 		 261 aa  172  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0455  phosphonate ABC transporter ATPase  45.23 
 
 		 498 aa  171  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.874499  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0484  ABC transporter related  45.23 
 
 		 499 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.431216  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0489  ABC transporter-related protein  44.4 
 
 		 498 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.878745  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0181  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.41 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3516  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.89 
 
 		 261 aa  166  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0335  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  36.96 
 
 		 246 aa  166  4e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3865  phosphonate ABC transporter ATP-binding  38.93 
 
 		 272 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1449  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.67 
 
 		 254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00372903  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3019  ABC transporter related  44.21 
 
 		 507 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2299  ABC phosphate/phosphonate transport system ATPase  38.1 
 
 		 259 aa  160  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2203  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  38.82 
 
 		 252 aa  159  6e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1927  phosphonate ABC transporter ATP-binding  36.97 
 
 		 287 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.75646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0130  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  36.4 
 
 		 261 aa  155  5.0000000000000005e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000163104  hitchhiker  0.00000028065 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3264  hypothetical protein  37.8 
 
 		 273 aa  155  7e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.634787 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2683  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.26 
 
 		 286 aa  155  8e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0052985  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0928  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.32 
 
 		 256 aa  155  9e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00101449  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0829  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.09 
 
 		 280 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3474  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  34.5 
 
 		 257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3749  phosphonate ABC transporter ATP-binding  34.5 
 
 		 257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3703  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  34.5 
 
 		 257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000015251 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3391  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  34.35 
 
 		 257 aa  152  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.193005  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3745  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  34.5 
 
 		 257 aa  152  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3256  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.62 
 
 		 266 aa  151  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.485781  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4035  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.35 
 
 		 273 aa  151  8e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.542235  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0215  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.35 
 
 		 273 aa  151  8e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3440  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  34.35 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3963  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.23 
 
 		 284 aa  150  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.704771 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3722  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  34.06 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156195  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0225  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.29 
 
 		 310 aa  150  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0775  phosphonate ABC transporter ATP-binding  38.46 
 
 		 309 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal  0.944742 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2920  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.62 
 
 		 272 aa  149  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2878  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.87 
 
 		 278 aa  149  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2799  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  34.87 
 
 		 278 aa  149  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4994  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.69 
 
 		 260 aa  149  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1345  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  34.87 
 
 		 278 aa  149  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0502345 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2409  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.81 
 
 		 292 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0857  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.5 
 
 		 264 aa  148  7e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0840663  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0894  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.98 
 
 		 275 aa  148  7e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.658454  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2676  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.19 
 
 		 279 aa  148  8e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2995  phosphonate ABC transporter ATP-binding  38.19 
 
 		 279 aa  148  8e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.537941 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1410  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.97 
 
 		 277 aa  148  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1319  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.77 
 
 		 278 aa  148  8e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12501  hypothetical protein  33.07 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0365  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.72 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3694  ABC phosphonate transporter ATP-binding protein  35.22 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1231  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.86 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.353455 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2677  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.73 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0553597 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2339  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  33.19 
 
 		 257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000337848  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl572  phosphonate ABC transporter ATP-binding component  31.3 
 
 		 249 aa  145  5e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4117  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.15 
 
 		 282 aa  145  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.914371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0278  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  33.58 
 
 		 279 aa  145  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2367  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.15 
 
 		 277 aa  145  7.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4152  ABC transporter related  37.5 
 
 		 266 aa  145  9e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4960  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  42.06 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2286  ABC transporter related  37.5 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1745  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  40.34 
 
 		 278 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.35608  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3993  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.13 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.642623  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1278  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.13 
 
 		 281 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3242  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.13 
 
 		 279 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980912  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0422  ABC type ATPase  38.66 
 
 		 272 aa  143  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.861299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0458  ABC type ATPase  38.66 
 
 		 272 aa  143  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.345895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3372  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.35 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014777  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29130  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  34.02 
 
 		 267 aa  142  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4177  ATPase  36.32 
 
 		 281 aa  142  6e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1000  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.68 
 
 		 261 aa  141  8e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20300  ATP-binding component of ABC phosphonate transporter  40.34 
 
 		 278 aa  141  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.540657  normal  0.410183 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3859  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.24 
 
 		 267 aa  141  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1521  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 		 248 aa  141  9e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  normal  0.0212059 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3908  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.24 
 
 		 267 aa  141  9e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.480865 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4431  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  33.33 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0730  ABC transporter, ATP-binding protein  29.34 
 
 		 249 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0133  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.36 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0128  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.36 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2916  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.11 
 
 		 284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178582  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2555  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  37.01 
 
 		 277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.205375  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6355  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  32.92 
 
 		 264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.424299  normal  0.5531 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0914  ATP-binding protein of phosphonate ABC transporter  38.55 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.672205  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2080  ABC transporter related  35 
 
 		 272 aa  140  3e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2010  phosphonates import ATP-binding protein  36.75 
 
 		 265 aa  140  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.194756  normal  0.0179512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>