More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2433 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2433  ABC transporter-like  100 
 
 		 265 aa  526  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0814206  normal  0.123252 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0790  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  73.21 
 
 		 265 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0694  ABC transporter  69.92 
 
 		 265 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.109577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4361  ABC transporter related  68.3 
 
 		 264 aa  358  4e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0829786  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0866  ABC transporter related  69.06 
 
 		 264 aa  341  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3198  ABC transporter related  68.05 
 
 		 266 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.012913 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1805  ABC transporter ATP-binding protein  65.54 
 
 		 267 aa  339  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0825  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  69.2 
 
 		 269 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  0.0442115 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21160  ABC transporter ATP-binding protein  65.92 
 
 		 267 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.511735  normal  0.707952 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19780  Phosphonate ABC transporter, ATP binding component  67.67 
 
 		 266 aa  307  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211931  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1825  ABC transporter related  59.4 
 
 		 275 aa  295  5e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.123024 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3337  ABC transporter related  58.94 
 
 		 274 aa  272  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.373917 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2013  ABC transporter related  59.36 
 
 		 277 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1690  ABC transporter related  59.36 
 
 		 277 aa  271  7e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2056  ABC transporter related  53.02 
 
 		 272 aa  237  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1616  ABC transporter related  52.59 
 
 		 277 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1722  ABC transporter-related protein  53.71 
 
 		 279 aa  228  8e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000201925 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2237  ABC transporter related  50.42 
 
 		 277 aa  216  2e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2784  ABC transporter related  47.19 
 
 		 242 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.197707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1649  ABC transporter related protein  48.26 
 
 		 248 aa  175  6e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2299  ABC phosphate/phosphonate transport system ATPase  40.08 
 
 		 259 aa  175  8e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0130  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  36.93 
 
 		 261 aa  171  9e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000163104  hitchhiker  0.00000028065 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1449  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.15 
 
 		 254 aa  170  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00372903  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0335  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  38.72 
 
 		 246 aa  170  3e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0484  ABC transporter related  45.22 
 
 		 499 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.431216  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0455  phosphonate ABC transporter ATPase  45.61 
 
 		 498 aa  167  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.874499  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3256  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.31 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.485781  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0489  ABC transporter-related protein  45.18 
 
 		 498 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.878745  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3865  phosphonate ABC transporter ATP-binding  38 
 
 		 272 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2203  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  37.7 
 
 		 252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4994  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.4 
 
 		 260 aa  162  8.000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0829  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.08 
 
 		 280 aa  158  7e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0181  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.48 
 
 		 252 aa  157  1e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29130  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl572  phosphonate ABC transporter ATP-binding component  34.75 
 
 		 249 aa  156  3e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3019  ABC transporter related  44.59 
 
 		 507 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2677  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.2 
 
 		 260 aa  155  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0553597 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0215  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.59 
 
 		 273 aa  155  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4035  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.59 
 
 		 273 aa  155  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.542235  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0365  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.79 
 
 		 252 aa  154  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1927  phosphonate ABC transporter ATP-binding  35.51 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.75646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3516  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.07 
 
 		 261 aa  152  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6355  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  38.39 
 
 		 264 aa  152  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.424299  normal  0.5531 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0775  phosphonate ABC transporter ATP-binding  40 
 
 		 309 aa  152  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal  0.944742 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1319  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.6 
 
 		 278 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0928  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.96 
 
 		 256 aa  151  8.999999999999999e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00101449  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1745  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  43.22 
 
 		 278 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.35608  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6091  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.6 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20300  ATP-binding component of ABC phosphonate transporter  43.22 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.540657  normal  0.410183 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2367  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.06 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0458  ABC type ATPase  39.48 
 
 		 272 aa  150  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.345895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0422  ABC type ATPase  39.48 
 
 		 272 aa  150  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.861299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3963  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.44 
 
 		 284 aa  149  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.704771 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2878  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.62 
 
 		 278 aa  149  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2799  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  35.62 
 
 		 278 aa  148  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1345  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  35.62 
 
 		 278 aa  148  7e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0502345 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0133  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.33 
 
 		 257 aa  148  7e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0128  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.33 
 
 		 257 aa  148  7e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2964  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.4 
 
 		 296 aa  148  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245669  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3440  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  33.19 
 
 		 257 aa  148  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12501  hypothetical protein  34.29 
 
 		 261 aa  148  9e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3391  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  33.19 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.193005  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4177  ATPase  38.89 
 
 		 281 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3745  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  33.19 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3234  phosphonate ABC transporter ATP-binding  36.36 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2285  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  34.33 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000778372  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3264  hypothetical protein  37.02 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.634787 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3474  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  33.19 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3749  phosphonate ABC transporter ATP-binding  33.19 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2339  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  33.19 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000337848  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3703  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  33.19 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000015251 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2676  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.01 
 
 		 279 aa  146  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2683  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.97 
 
 		 286 aa  146  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0052985  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2995  phosphonate ABC transporter ATP-binding  37.01 
 
 		 279 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.537941 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2916  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.1 
 
 		 284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178582  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1410  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.91 
 
 		 277 aa  145  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3722  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  32.76 
 
 		 257 aa  145  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156195  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4201  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.5 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.171703  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1594  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.68 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0857  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  32.93 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0840663  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3694  ABC phosphonate transporter ATP-binding protein  34.6 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2286  ABC transporter related  38.14 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2187  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.6 
 
 		 275 aa  143  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4152  ABC transporter related  38.14 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2080  ABC transporter related  36.02 
 
 		 272 aa  142  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5876  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  40.43 
 
 		 267 aa  142  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0914  ATP-binding protein of phosphonate ABC transporter  36.26 
 
 		 275 aa  142  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.672205  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4575  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.29 
 
 		 281 aa  142  7e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4960  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  39.58 
 
 		 269 aa  142  8e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2920  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.11 
 
 		 272 aa  141  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0768  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.47 
 
 		 270 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2555  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  40.25 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.205375  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2247  ABC transporter  40 
 
 		 277 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2593  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  37.2 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2407  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  37.2 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3350  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  37.2 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2409  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.94 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3304  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  37.2 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296205  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3338  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  37.2 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0323  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  37.2 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.558714  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>