More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3234 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008043  TM1040_3234  phosphonate ABC transporter ATP-binding  100 
 
 
257 aa  520  1e-147  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0597  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  57.61 
 
 
270 aa  301  9e-81  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00266956 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3264  hypothetical protein  58.44 
 
 
273 aa  298  5e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.634787 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1231  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  56.79 
 
 
265 aa  297  9e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.353455 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2367  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  54.92 
 
 
277 aa  291  5e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3963  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  55.56 
 
 
284 aa  286  2e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.704771 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4575  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  55.56 
 
 
281 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0857  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  53.09 
 
 
264 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0840663  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2010  phosphonates import ATP-binding protein  55.14 
 
 
265 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.194756  normal  0.0179512 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1927  phosphonate ABC transporter ATP-binding  55.56 
 
 
287 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.75646  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3258  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  58.85 
 
 
272 aa  278  5e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.617138  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0248  phosphonate ABC transporter ATP-binding  52.76 
 
 
272 aa  267  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202594  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1000  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  48.77 
 
 
261 aa  265  4e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3865  phosphonate ABC transporter ATP-binding  53.5 
 
 
272 aa  265  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3324  ATPase  45.77 
 
 
275 aa  242  6e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0225  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  47.06 
 
 
310 aa  239  2.9999999999999997e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0130  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  43.44 
 
 
261 aa  225  7e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000163104  hitchhiker  0.00000028065 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0128  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.95 
 
 
257 aa  222  4e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0133  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.95 
 
 
257 aa  222  4e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0928  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  42.74 
 
 
256 aa  221  6e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00101449  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2339  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.97 
 
 
257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000337848  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1594  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.21 
 
 
261 aa  219  3e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2203  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  44.49 
 
 
252 aa  219  3.9999999999999997e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2285  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 
257 aa  218  7e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000778372  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3709  phosphonate ABC transporter ATP-binding  47.11 
 
 
272 aa  217  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.144608 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3516  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.98 
 
 
261 aa  217  2e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0768  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  45.73 
 
 
270 aa  216  4e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3256  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.9 
 
 
266 aa  215  7e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.485781  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1278  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.66 
 
 
281 aa  215  7e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3993  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.66 
 
 
279 aa  214  8e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.642623  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3242  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.66 
 
 
279 aa  214  8e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980912  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2299  ABC phosphate/phosphonate transport system ATPase  45.23 
 
 
259 aa  214  9e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3440  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  42.34 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3391  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  42 
 
 
257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.193005  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5858  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  46.15 
 
 
269 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289421  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4994  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.26 
 
 
260 aa  213  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463894  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3722  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  42.34 
 
 
257 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156195  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5876  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  46.09 
 
 
267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3745  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3474  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  42.86 
 
 
257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3749  phosphonate ABC transporter ATP-binding  42.86 
 
 
257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3703  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
257 aa  212  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000015251 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2187  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  45.73 
 
 
275 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2409  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.8 
 
 
292 aa  212  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3820  phosphonate ABC transporter ATP-binding  41.67 
 
 
270 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.693168  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4431  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.63 
 
 
284 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319208  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4084  phosphonate ABC transporter ATP-binding  43.59 
 
 
274 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.620388  normal  0.0392209 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4432  phosphonate ABC transporter ATP-binding  43.8 
 
 
271 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3862  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  45.04 
 
 
282 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0458  ABC type ATPase  43.82 
 
 
272 aa  206  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.345895  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0422  ABC type ATPase  43.82 
 
 
272 aa  206  2e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.861299  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1322  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.8 
 
 
269 aa  207  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233307  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2677  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.63 
 
 
260 aa  206  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0553597 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11301  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  43.62 
 
 
257 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0500512 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0335  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  40.08 
 
 
246 aa  206  3e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2920  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.8 
 
 
272 aa  205  6e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4117  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  44.03 
 
 
282 aa  205  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.914371  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4668  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.62 
 
 
300 aa  205  7e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.621423  decreased coverage  0.000827837 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1097  ATPase  42.39 
 
 
254 aa  205  7e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6364  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  39.76 
 
 
275 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0620834  normal  0.857375 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4035  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.41 
 
 
273 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.542235  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0215  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.41 
 
 
273 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1449  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.03 
 
 
254 aa  202  3e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00372903  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6355  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  39.92 
 
 
264 aa  202  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.424299  normal  0.5531 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29130  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  42.98 
 
 
267 aa  202  5e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0278  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  43.57 
 
 
279 aa  202  6e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3372  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.58 
 
 
257 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014777  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0181  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  40.82 
 
 
252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4787  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.15 
 
 
272 aa  199  1.9999999999999998e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334656  normal  0.0646281 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3794  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  44.86 
 
 
225 aa  199  5e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.551084  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4201  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.56 
 
 
273 aa  198  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.171703  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4152  ABC transporter related  41.46 
 
 
266 aa  198  6e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2286  ABC transporter related  41.46 
 
 
266 aa  198  6e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4960  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  42.51 
 
 
269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1420  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.56 
 
 
273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1321  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.03 
 
 
271 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12501  hypothetical protein  41.98 
 
 
261 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0914  ATP-binding protein of phosphonate ABC transporter  42.62 
 
 
275 aa  193  2e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.672205  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2156  phosphonate ABC transporter ATP-binding  44.72 
 
 
253 aa  193  2e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2676  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.56 
 
 
279 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2995  phosphonate ABC transporter ATP-binding  41.56 
 
 
279 aa  193  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.537941 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2799  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  39.76 
 
 
278 aa  192  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1345  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  39.76 
 
 
278 aa  192  3e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0502345 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2878  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.76 
 
 
278 aa  192  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0365  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.15 
 
 
252 aa  192  5e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1521  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  42.86 
 
 
248 aa  192  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  normal  0.0212059 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2905  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  46.06 
 
 
273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.217934  normal  0.0141495 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3859  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  40.82 
 
 
267 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3908  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  40.82 
 
 
267 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.480865 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17520  ABC transporter  39.09 
 
 
257 aa  188  9e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.363771  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1410  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  40.49 
 
 
277 aa  186  3e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0894  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.13 
 
 
275 aa  186  3e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.658454  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3726  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  55.63 
 
 
168 aa  185  6e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0309  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  37.6 
 
 
262 aa  185  6e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.053951 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1230  ABC transporter related  39.44 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3694  ABC phosphonate transporter ATP-binding protein  37.7 
 
 
274 aa  182  4.0000000000000006e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl572  phosphonate ABC transporter ATP-binding component  35.48 
 
 
249 aa  181  8.000000000000001e-45  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2683  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  40.32 
 
 
286 aa  181  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0052985  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0829  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.72 
 
 
280 aa  181  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0839  ABC phophonates transporter, ATPase subunit PhnC  40 
 
 
301 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0851593 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>