More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2056 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2056  ABC transporter related  100 
 
 		 272 aa  525  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2237  ABC transporter related  71.22 
 
 		 277 aa  352  4e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1616  ABC transporter related  66.79 
 
 		 277 aa  349  2e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1722  ABC transporter-related protein  70.8 
 
 		 279 aa  319  3e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000201925 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0694  ABC transporter  53.63 
 
 		 265 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.109577  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0790  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52 
 
 		 265 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1805  ABC transporter ATP-binding protein  52.61 
 
 		 267 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2433  ABC transporter-like  53.22 
 
 		 265 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0814206  normal  0.123252 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3198  ABC transporter related  53.54 
 
 		 266 aa  226  4e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.012913 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21160  ABC transporter ATP-binding protein  54.22 
 
 		 267 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.511735  normal  0.707952 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4361  ABC transporter related  49.6 
 
 		 264 aa  221  7e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0829786  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0866  ABC transporter related  50.8 
 
 		 264 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0825  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  52.02 
 
 		 269 aa  219  6e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  0.0442115 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3337  ABC transporter related  52 
 
 		 274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.373917 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1825  ABC transporter related  52.59 
 
 		 275 aa  210  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.123024 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2013  ABC transporter related  50.19 
 
 		 277 aa  203  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1690  ABC transporter related  50.19 
 
 		 277 aa  202  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19780  Phosphonate ABC transporter, ATP binding component  54.31 
 
 		 266 aa  193  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211931  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2784  ABC transporter related  47.58 
 
 		 242 aa  174  9.999999999999999e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.197707 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3264  hypothetical protein  41.05 
 
 		 273 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.634787 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1927  phosphonate ABC transporter ATP-binding  37.55 
 
 		 287 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.75646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3865  phosphonate ABC transporter ATP-binding  36.14 
 
 		 272 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0335  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  32.26 
 
 		 246 aa  150  3e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2916  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.8 
 
 		 284 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178582  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2203  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  35.74 
 
 		 252 aa  146  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0128  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  33.07 
 
 		 257 aa  145  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0133  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  33.07 
 
 		 257 aa  145  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3019  ABC transporter related  45.18 
 
 		 507 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0829  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.71 
 
 		 280 aa  144  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6091  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.99 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0484  ABC transporter related  43.81 
 
 		 499 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.431216  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2299  ABC phosphate/phosphonate transport system ATPase  35.48 
 
 		 259 aa  143  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2964  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.82 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0185  phosphonate ABC transporter ATP-binding  36.17 
 
 		 293 aa  143  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2010  phosphonates import ATP-binding protein  36.14 
 
 		 265 aa  142  4e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.194756  normal  0.0179512 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4177  ATPase  36.76 
 
 		 281 aa  142  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2339  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.14 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000337848  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3516  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  33.07 
 
 		 261 aa  142  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4994  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.6 
 
 		 260 aa  142  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463894  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3440  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  33.98 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1649  ABC transporter related protein  44.25 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0775  phosphonate ABC transporter ATP-binding  35.9 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal  0.944742 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0130  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  31.64 
 
 		 261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000163104  hitchhiker  0.00000028065 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl572  phosphonate ABC transporter ATP-binding component  32.19 
 
 		 249 aa  140  3e-32  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3391  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  33.98 
 
 		 257 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.193005  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0455  phosphonate ABC transporter ATPase  43.17 
 
 		 498 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.874499  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0489  ABC transporter-related protein  43.61 
 
 		 498 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.878745  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3745  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  33.98 
 
 		 257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0181  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.14 
 
 		 252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1000  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  32.26 
 
 		 261 aa  139  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1745  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  39.33 
 
 		 278 aa  139  6e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.35608  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3722  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  33.59 
 
 		 257 aa  138  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156195  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3474  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  33.59 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3749  phosphonate ABC transporter ATP-binding  33.59 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3703  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  33.59 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000015251 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3963  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.9 
 
 		 284 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.704771 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1594  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.48 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2920  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.17 
 
 		 272 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4575  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.82 
 
 		 281 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2285  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  31.98 
 
 		 257 aa  135  8e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000778372  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20300  ATP-binding component of ABC phosphonate transporter  38.91 
 
 		 278 aa  135  8e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.540657  normal  0.410183 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1449  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  32.51 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00372903  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0857  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  33.19 
 
 		 264 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0840663  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3820  phosphonate ABC transporter ATP-binding  36.64 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.693168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3694  ABC phosphonate transporter ATP-binding protein  34.35 
 
 		 274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3256  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.99 
 
 		 266 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.485781  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4035  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.25 
 
 		 273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.542235  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0215  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.25 
 
 		 273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5619  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  37.07 
 
 		 262 aa  133  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2080  ABC transporter related  34.35 
 
 		 272 aa  132  5e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3886  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.4 
 
 		 262 aa  132  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0768  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.64 
 
 		 270 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3372  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.36 
 
 		 257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014777  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0365  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.4 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2367  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.39 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4571  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  35.98 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03977  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  35.98 
 
 		 262 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4659  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  35.98 
 
 		 262 aa  130  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4346  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  35.98 
 
 		 262 aa  130  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2187  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.15 
 
 		 275 aa  130  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03938  hypothetical protein  35.98 
 
 		 262 aa  130  3e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4432  phosphonate ABC transporter ATP-binding  37.5 
 
 		 271 aa  129  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2683  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.74 
 
 		 286 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0052985  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3921  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  36.25 
 
 		 262 aa  129  6e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0839  ABC phophonates transporter, ATPase subunit PhnC  37.45 
 
 		 301 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0851593 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3234  phosphonate ABC transporter ATP-binding  35.86 
 
 		 257 aa  129  6e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2247  ABC transporter  36.48 
 
 		 277 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5858  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  36.93 
 
 		 269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12501  hypothetical protein  31.99 
 
 		 261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2890  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.99 
 
 		 274 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0336941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0597  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.05 
 
 		 270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00266956 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1319  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.31 
 
 		 278 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4084  phosphonate ABC transporter ATP-binding  37.29 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.620388  normal  0.0392209 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2555  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  35.74 
 
 		 277 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.205375  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1322  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.64 
 
 		 269 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0309  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  36.07 
 
 		 262 aa  126  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.053951 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4524  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.29 
 
 		 307 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29130  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  31.76 
 
 		 267 aa  125  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3794  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  35.27 
 
 		 225 aa  125  7e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.551084  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0225  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.87 
 
 		 310 aa  125  7e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>