More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3337 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3337  ABC transporter related  100 
 
 		 274 aa  531  1e-150  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.373917 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1690  ABC transporter related  74.71 
 
 		 277 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2013  ABC transporter related  74.71 
 
 		 277 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1825  ABC transporter related  71.14 
 
 		 275 aa  331  9e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.123024 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1805  ABC transporter ATP-binding protein  64.62 
 
 		 267 aa  308  6.999999999999999e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21160  ABC transporter ATP-binding protein  64.23 
 
 		 267 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.511735  normal  0.707952 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0694  ABC transporter  58.17 
 
 		 265 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.109577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3198  ABC transporter related  61.96 
 
 		 266 aa  285  7e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.012913 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0790  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  58.7 
 
 		 265 aa  276  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2433  ABC transporter-like  58.94 
 
 		 265 aa  263  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0814206  normal  0.123252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4361  ABC transporter related  57.2 
 
 		 264 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0829786  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0866  ABC transporter related  56.69 
 
 		 264 aa  254  8e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0825  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  56.13 
 
 		 269 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  0.0442115 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19780  Phosphonate ABC transporter, ATP binding component  60.98 
 
 		 266 aa  246  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211931  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1616  ABC transporter related  52.99 
 
 		 277 aa  227  2e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1722  ABC transporter-related protein  51.39 
 
 		 279 aa  216  4e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000201925 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2237  ABC transporter related  49.1 
 
 		 277 aa  216  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2056  ABC transporter related  54.39 
 
 		 272 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2784  ABC transporter related  48.05 
 
 		 242 aa  182  5.0000000000000004e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.197707 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0489  ABC transporter-related protein  50.88 
 
 		 498 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.878745  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0455  phosphonate ABC transporter ATPase  50.44 
 
 		 498 aa  179  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.874499  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0484  ABC transporter related  48.35 
 
 		 499 aa  178  7e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.431216  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0130  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  38.02 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000163104  hitchhiker  0.00000028065 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0128  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.4 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0133  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.4 
 
 		 257 aa  169  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3865  phosphonate ABC transporter ATP-binding  43.46 
 
 		 272 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1649  ABC transporter related protein  47.33 
 
 		 248 aa  165  8e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3019  ABC transporter related  49.12 
 
 		 507 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2285  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  35.6 
 
 		 257 aa  162  8.000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000778372  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0857  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.99 
 
 		 264 aa  159  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0840663  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1594  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.11 
 
 		 261 aa  159  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3516  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.89 
 
 		 261 aa  159  7e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2299  ABC phosphate/phosphonate transport system ATPase  41.91 
 
 		 259 aa  158  7e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3264  hypothetical protein  39.75 
 
 		 273 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.634787 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0335  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  35.39 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3703  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  35.95 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000015251 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3474  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  35.95 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3749  phosphonate ABC transporter ATP-binding  35.95 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3391  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 		 257 aa  156  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.193005  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3745  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 		 257 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0775  phosphonate ABC transporter ATP-binding  37.5 
 
 		 309 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal  0.944742 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3440  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 		 257 aa  155  6e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1449  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.71 
 
 		 254 aa  155  8e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00372903  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3256  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  40.32 
 
 		 266 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.485781  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3722  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  36.44 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156195  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0458  ABC type ATPase  38.52 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.345895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0422  ABC type ATPase  38.52 
 
 		 272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.861299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4994  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.78 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1745  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  43.33 
 
 		 278 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.35608  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3258  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.26 
 
 		 272 aa  152  5e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.617138  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4177  ATPase  38.46 
 
 		 281 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2916  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.13 
 
 		 284 aa  151  8.999999999999999e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178582  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1000  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.43 
 
 		 261 aa  151  8.999999999999999e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2964  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  40.59 
 
 		 296 aa  151  8.999999999999999e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245669  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6091  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.45 
 
 		 288 aa  151  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0181  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.94 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2676  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.08 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2995  phosphonate ABC transporter ATP-binding  39.08 
 
 		 279 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.537941 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20300  ATP-binding component of ABC phosphonate transporter  43.75 
 
 		 278 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.540657  normal  0.410183 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2339  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.54 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000337848  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0225  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.21 
 
 		 310 aa  150  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1420  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.5 
 
 		 273 aa  148  7e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl572  phosphonate ABC transporter ATP-binding component  34.6 
 
 		 249 aa  148  8e-35  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3372  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.36 
 
 		 257 aa  148  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014777  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0597  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.92 
 
 		 270 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00266956 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2890  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.99 
 
 		 274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0336941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4575  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.42 
 
 		 281 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2555  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  40.24 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.205375  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5876  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.27 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1231  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.18 
 
 		 265 aa  147  3e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.353455 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2367  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.64 
 
 		 277 aa  146  3e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0768  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.98 
 
 		 270 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1927  phosphonate ABC transporter ATP-binding  36.26 
 
 		 287 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.75646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4035  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.88 
 
 		 273 aa  145  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.542235  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0215  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.88 
 
 		 273 aa  145  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2247  ABC transporter  41.88 
 
 		 277 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0248  phosphonate ABC transporter ATP-binding  38.28 
 
 		 272 aa  145  6e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.202594  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0914  ATP-binding protein of phosphonate ABC transporter  38.26 
 
 		 275 aa  145  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.672205  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0365  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.43 
 
 		 252 aa  145  8.000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3820  phosphonate ABC transporter ATP-binding  39.75 
 
 		 270 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.693168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3242  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.26 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980912  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3963  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.51 
 
 		 284 aa  144  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.704771 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4960  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  41.85 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1521  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  37.97 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  normal  0.0212059 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3993  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.26 
 
 		 279 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.642623  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1278  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.26 
 
 		 281 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0928  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.77 
 
 		 256 aa  143  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00101449  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2203  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  39.56 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2080  ABC transporter related  33.85 
 
 		 272 aa  144  2e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4084  phosphonate ABC transporter ATP-binding  39.33 
 
 		 274 aa  143  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.620388  normal  0.0392209 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2677  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.21 
 
 		 260 aa  143  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0553597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6364  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 		 275 aa  142  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0620834  normal  0.857375 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1184  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  38.8 
 
 		 307 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3338  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  38.8 
 
 		 307 aa  141  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0323  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  38.8 
 
 		 307 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.558714  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2407  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  38.8 
 
 		 307 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3350  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  38.8 
 
 		 307 aa  141  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2593  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  38.8 
 
 		 307 aa  141  9e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3304  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  38.8 
 
 		 307 aa  141  9e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296205  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4152  ABC transporter related  36.07 
 
 		 266 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>