More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2013 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2013  ABC transporter related  100 
 
 
277 aa  535  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1690  ABC transporter related  99.28 
 
 
277 aa  531  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3337  ABC transporter related  74.71 
 
 
274 aa  358  4e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.373917 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1825  ABC transporter related  68.09 
 
 
275 aa  330  1e-89  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.123024 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1805  ABC transporter ATP-binding protein  65.34 
 
 
267 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21160  ABC transporter ATP-binding protein  66.27 
 
 
267 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.511735  normal  0.707952 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0790  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  60.16 
 
 
265 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0694  ABC transporter  55.88 
 
 
265 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.109577  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3198  ABC transporter related  60.39 
 
 
266 aa  268  7e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.012913 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2433  ABC transporter-like  59.36 
 
 
265 aa  263  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0814206  normal  0.123252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4361  ABC transporter related  57.25 
 
 
264 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0829786  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0866  ABC transporter related  56.77 
 
 
264 aa  251  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0825  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  56.13 
 
 
269 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  0.0442115 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19780  Phosphonate ABC transporter, ATP binding component  55.8 
 
 
266 aa  238  5.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211931  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1616  ABC transporter related  51.09 
 
 
277 aa  229  4e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2237  ABC transporter related  51.74 
 
 
277 aa  220  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1722  ABC transporter-related protein  50.19 
 
 
279 aa  212  7e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000201925 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2056  ABC transporter related  52.32 
 
 
272 aa  200  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2784  ABC transporter related  50.41 
 
 
242 aa  193  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.197707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1649  ABC transporter related protein  49.6 
 
 
248 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0130  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  37.1 
 
 
261 aa  170  3e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000163104  hitchhiker  0.00000028065 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0128  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.29 
 
 
257 aa  167  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0133  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.29 
 
 
257 aa  167  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2285  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  36.29 
 
 
257 aa  162  6e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000778372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0455  phosphonate ABC transporter ATPase  46.78 
 
 
498 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.874499  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0484  ABC transporter related  46.78 
 
 
499 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.431216  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3256  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.53 
 
 
266 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.485781  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0489  ABC transporter-related protein  46.78 
 
 
498 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.878745  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3865  phosphonate ABC transporter ATP-binding  37.84 
 
 
272 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29130  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  39.34 
 
 
267 aa  155  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0335  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  33.86 
 
 
246 aa  155  7e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl572  phosphonate ABC transporter ATP-binding component  33.73 
 
 
249 aa  155  1e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3516  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.06 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3019  ABC transporter related  45.8 
 
 
507 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4994  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.12 
 
 
260 aa  152  7e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463894  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3474  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  34.68 
 
 
257 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3749  phosphonate ABC transporter ATP-binding  34.68 
 
 
257 aa  150  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1594  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.66 
 
 
261 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2995  phosphonate ABC transporter ATP-binding  39.05 
 
 
279 aa  150  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.537941 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2676  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.05 
 
 
279 aa  150  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3703  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  34.68 
 
 
257 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000015251 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3440  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  34.68 
 
 
257 aa  149  4e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2299  ABC phosphate/phosphonate transport system ATPase  38.27 
 
 
259 aa  149  4e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3391  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  34.68 
 
 
257 aa  149  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.193005  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3745  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  34.68 
 
 
257 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0928  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.89 
 
 
256 aa  149  7e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00101449  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3963  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.44 
 
 
284 aa  149  7e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.704771 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3264  hypothetical protein  37.85 
 
 
273 aa  148  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.634787 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1927  phosphonate ABC transporter ATP-binding  35.77 
 
 
287 aa  148  8e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.75646  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4177  ATPase  36.5 
 
 
281 aa  148  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3722  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  34.27 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156195  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2339  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  33.07 
 
 
257 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000337848  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0829  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.69 
 
 
280 aa  145  9e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0914  ATP-binding protein of phosphonate ABC transporter  37.78 
 
 
275 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.672205  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2677  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.45 
 
 
260 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0553597 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3372  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.68 
 
 
257 aa  143  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014777  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2890  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.59 
 
 
274 aa  143  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0336941  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1319  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.06 
 
 
278 aa  143  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2683  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.56 
 
 
286 aa  143  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0052985  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1345  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  34.98 
 
 
278 aa  143  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0502345 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2799  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 
278 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2878  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.98 
 
 
278 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2916  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.21 
 
 
284 aa  142  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178582  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2203  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  39.56 
 
 
252 aa  142  6e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2367  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.48 
 
 
277 aa  142  7e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1449  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.09 
 
 
254 aa  142  8e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00372903  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0775  phosphonate ABC transporter ATP-binding  34.96 
 
 
309 aa  142  9e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal  0.944742 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0225  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.53 
 
 
310 aa  141  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0181  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.29 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6364  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  37.13 
 
 
275 aa  140  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0620834  normal  0.857375 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0768  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.48 
 
 
270 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4575  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.59 
 
 
281 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2247  ABC transporter  39.11 
 
 
277 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0597  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.24 
 
 
270 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00266956 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4084  phosphonate ABC transporter ATP-binding  34.75 
 
 
274 aa  139  7e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.620388  normal  0.0392209 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1521  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  34.85 
 
 
248 aa  139  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115947  normal  0.0212059 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2964  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.85 
 
 
296 aa  138  7.999999999999999e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245669  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1420  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.61 
 
 
273 aa  138  7.999999999999999e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5876  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.53 
 
 
267 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4035  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.47 
 
 
273 aa  138  8.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.542235  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0215  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.47 
 
 
273 aa  138  8.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1000  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  33.87 
 
 
261 aa  137  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0894  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.72 
 
 
275 aa  138  1e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.658454  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2409  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.38 
 
 
292 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1231  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.29 
 
 
265 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.353455 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2010  phosphonates import ATP-binding protein  37.55 
 
 
265 aa  137  1e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.194756  normal  0.0179512 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0422  ABC type ATPase  37.05 
 
 
272 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.861299  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0458  ABC type ATPase  37.05 
 
 
272 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.345895  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1321  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.67 
 
 
271 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.918864 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2080  ABC transporter related  33.6 
 
 
272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0826  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  35.5 
 
 
250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.954796  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6091  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.36 
 
 
288 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2555  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  39.11 
 
 
277 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.205375  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3859  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.65 
 
 
267 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3908  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.65 
 
 
267 aa  135  5e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.480865 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3820  phosphonate ABC transporter ATP-binding  35.48 
 
 
270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.693168  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0857  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.17 
 
 
264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0840663  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5858  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  34.68 
 
 
269 aa  135  7.000000000000001e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289421  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6355  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  35.77 
 
 
264 aa  135  8e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.424299  normal  0.5531 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1745  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  39 
 
 
278 aa  135  9e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.35608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>