More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0790 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0790  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  100 
 
 
265 aa  524  1e-148  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0694  ABC transporter  90.57 
 
 
265 aa  474  1e-133  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.109577  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2433  ABC transporter-like  73.21 
 
 
265 aa  364  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0814206  normal  0.123252 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3198  ABC transporter related  67.29 
 
 
266 aa  328  8e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.012913 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4361  ABC transporter related  64.53 
 
 
264 aa  324  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0829786  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1805  ABC transporter ATP-binding protein  64.04 
 
 
267 aa  320  9.999999999999999e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0825  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  65.78 
 
 
269 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  0.0442115 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0866  ABC transporter related  64.91 
 
 
264 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21160  ABC transporter ATP-binding protein  64.04 
 
 
267 aa  308  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.511735  normal  0.707952 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19780  Phosphonate ABC transporter, ATP binding component  65.41 
 
 
266 aa  298  7e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211931  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1825  ABC transporter related  59.76 
 
 
275 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.123024 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3337  ABC transporter related  58.7 
 
 
274 aa  275  4e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.373917 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2013  ABC transporter related  60.16 
 
 
277 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1690  ABC transporter related  60.16 
 
 
277 aa  272  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1722  ABC transporter-related protein  53.39 
 
 
279 aa  240  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000201925 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1616  ABC transporter related  51.81 
 
 
277 aa  231  8.000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2056  ABC transporter related  52.42 
 
 
272 aa  228  8e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2237  ABC transporter related  51 
 
 
277 aa  224  1e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2784  ABC transporter related  47.08 
 
 
242 aa  204  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.197707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1649  ABC transporter related protein  46.28 
 
 
248 aa  189  5.999999999999999e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3865  phosphonate ABC transporter ATP-binding  39.68 
 
 
272 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4035  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.39 
 
 
273 aa  167  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.542235  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0215  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.39 
 
 
273 aa  167  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2299  ABC phosphate/phosphonate transport system ATPase  38.04 
 
 
259 aa  166  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0130  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  37.3 
 
 
261 aa  163  3e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000163104  hitchhiker  0.00000028065 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0484  ABC transporter related  45.06 
 
 
499 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.431216  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0455  phosphonate ABC transporter ATPase  46.09 
 
 
498 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.874499  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0489  ABC transporter-related protein  45.58 
 
 
498 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.878745  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1927  phosphonate ABC transporter ATP-binding  36.78 
 
 
287 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.75646  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4994  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.4 
 
 
260 aa  160  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463894  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0458  ABC type ATPase  39.68 
 
 
272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.345895  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0422  ABC type ATPase  39.68 
 
 
272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.861299  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0928  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.72 
 
 
256 aa  154  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00101449  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3256  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.33 
 
 
266 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.485781  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0335  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  36.89 
 
 
246 aa  154  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0181  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  40.26 
 
 
252 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3516  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.89 
 
 
261 aa  153  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1449  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.7 
 
 
254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00372903  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3963  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.63 
 
 
284 aa  150  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.704771 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3264  hypothetical protein  38.3 
 
 
273 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.634787 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12501  hypothetical protein  33.85 
 
 
261 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1594  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.07 
 
 
261 aa  149  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3019  ABC transporter related  42.17 
 
 
507 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29130  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  35.95 
 
 
267 aa  146  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3234  phosphonate ABC transporter ATP-binding  35.54 
 
 
257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2683  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.75 
 
 
286 aa  145  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0052985  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2367  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.94 
 
 
277 aa  145  7.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2203  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  36.55 
 
 
252 aa  145  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1319  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.06 
 
 
278 aa  143  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4201  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.2 
 
 
273 aa  142  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.171703  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1410  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.2 
 
 
277 aa  142  8e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0133  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.19 
 
 
257 aa  141  9e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0128  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.19 
 
 
257 aa  141  9e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2010  phosphonates import ATP-binding protein  34.69 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.194756  normal  0.0179512 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2676  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.3 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2995  phosphonate ABC transporter ATP-binding  37.3 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.537941 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3993  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.84 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.642623  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1278  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.84 
 
 
281 aa  140  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3242  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.84 
 
 
279 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980912  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl572  phosphonate ABC transporter ATP-binding component  33.76 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4960  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  38.27 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0829  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.04 
 
 
280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0768  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.61 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2799  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  35.32 
 
 
278 aa  139  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2878  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.32 
 
 
278 aa  140  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0730  ABC transporter, ATP-binding protein  31.43 
 
 
249 aa  139  3e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1345  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  35.32 
 
 
278 aa  139  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0502345 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2920  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.43 
 
 
272 aa  139  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5876  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.25 
 
 
267 aa  139  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2285  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  35.19 
 
 
257 aa  139  3.9999999999999997e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000778372  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1000  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  33.2 
 
 
261 aa  138  8.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0857  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  33.48 
 
 
264 aa  138  8.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0840663  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0225  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.61 
 
 
310 aa  138  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6355  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  34.03 
 
 
264 aa  137  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.424299  normal  0.5531 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3820  phosphonate ABC transporter ATP-binding  38.5 
 
 
270 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.693168  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0365  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.86 
 
 
252 aa  137  2e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2339  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.19 
 
 
257 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000337848  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2409  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  37.11 
 
 
292 aa  136  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2555  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  37.36 
 
 
277 aa  136  4e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.205375  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2677  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.54 
 
 
260 aa  136  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0553597 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2247  ABC transporter  38.55 
 
 
277 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3694  ABC phosphonate transporter ATP-binding protein  33.46 
 
 
274 aa  135  6.0000000000000005e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3745  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  32.93 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3474  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  32.93 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3440  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3749  phosphonate ABC transporter ATP-binding  32.93 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4084  phosphonate ABC transporter ATP-binding  35.77 
 
 
274 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.620388  normal  0.0392209 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3703  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  32.93 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000015251 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3258  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.51 
 
 
272 aa  133  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.617138  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3391  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
257 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.193005  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0672  ATPase  31.17 
 
 
246 aa  133  3.9999999999999996e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0914  ATP-binding protein of phosphonate ABC transporter  38.06 
 
 
275 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.672205  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07271  putative phosphonate ABC transporter  31.98 
 
 
246 aa  132  5e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0413071  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3722  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  32.91 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156195  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0839  ABC phophonates transporter, ATPase subunit PhnC  36.14 
 
 
301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0851593 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0775  phosphonate ABC transporter ATP-binding  35.04 
 
 
309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal  0.944742 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2187  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.87 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0894  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.48 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.658454  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1420  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.18 
 
 
273 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2156  phosphonate ABC transporter ATP-binding  37.45 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.440278 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>