More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2784 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2784  ABC transporter related  100 
 
 
242 aa  464  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.197707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1649  ABC transporter related protein  70.54 
 
 
248 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0790  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  47.08 
 
 
265 aa  204  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0694  ABC transporter  46.25 
 
 
265 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.109577  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1690  ABC transporter related  50.41 
 
 
277 aa  193  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2013  ABC transporter related  50.41 
 
 
277 aa  193  2e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.697342  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1805  ABC transporter ATP-binding protein  48.5 
 
 
267 aa  191  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1825  ABC transporter related  45.61 
 
 
275 aa  190  1e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.123024 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3198  ABC transporter related  49.13 
 
 
266 aa  184  8e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.012913 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19780  Phosphonate ABC transporter, ATP binding component  49.38 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211931  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21160  ABC transporter ATP-binding protein  48.95 
 
 
267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.511735  normal  0.707952 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3337  ABC transporter related  48.05 
 
 
274 aa  183  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.373917 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4361  ABC transporter related  45.49 
 
 
264 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0829786  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0825  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.64 
 
 
269 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  0.0442115 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3019  ABC transporter related  51.65 
 
 
507 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2433  ABC transporter-like  47.19 
 
 
265 aa  178  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0814206  normal  0.123252 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0866  ABC transporter related  45.8 
 
 
264 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4994  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.24 
 
 
260 aa  176  3e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463894  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0455  phosphonate ABC transporter ATPase  50.21 
 
 
498 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.874499  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0484  ABC transporter related  49.79 
 
 
499 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.431216  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2056  ABC transporter related  47.35 
 
 
272 aa  173  1.9999999999999998e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0857  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  40.87 
 
 
264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0840663  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3908  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  40.16 
 
 
267 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.480865 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0768  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.25 
 
 
270 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3859  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  40.16 
 
 
267 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0489  ABC transporter-related protein  49.79 
 
 
498 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.878745  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2299  ABC phosphate/phosphonate transport system ATPase  42.61 
 
 
259 aa  169  4e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3516  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.75 
 
 
261 aa  168  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0130  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  38.53 
 
 
261 aa  167  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000163104  hitchhiker  0.00000028065 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1594  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  40.6 
 
 
261 aa  167  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3820  phosphonate ABC transporter ATP-binding  42.98 
 
 
270 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.693168  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2890  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.31 
 
 
274 aa  167  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0336941  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2964  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.04 
 
 
296 aa  167  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.245669  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1927  phosphonate ABC transporter ATP-binding  41.08 
 
 
287 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.75646  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1616  ABC transporter related  42.21 
 
 
277 aa  165  6.9999999999999995e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3963  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  40.42 
 
 
284 aa  164  8e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.704771 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0775  phosphonate ABC transporter ATP-binding  45.11 
 
 
309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.831408  normal  0.944742 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2916  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.46 
 
 
284 aa  163  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178582  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1449  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.53 
 
 
254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00372903  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4084  phosphonate ABC transporter ATP-binding  42.24 
 
 
274 aa  162  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.620388  normal  0.0392209 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4575  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.74 
 
 
281 aa  162  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl572  phosphonate ABC transporter ATP-binding component  36.86 
 
 
249 aa  162  4.0000000000000004e-39  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4177  ATPase  41.81 
 
 
281 aa  162  6e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0829  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.75 
 
 
280 aa  161  7e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1745  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  41.18 
 
 
278 aa  161  9e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.35608  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6355  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 
264 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.424299  normal  0.5531 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20300  ATP-binding component of ABC phosphonate transporter  41.18 
 
 
278 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.540657  normal  0.410183 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0335  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  36.96 
 
 
246 aa  160  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2203  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  43.38 
 
 
252 aa  161  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5619  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  39.83 
 
 
262 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1722  ABC transporter-related protein  45.58 
 
 
279 aa  159  3e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000201925 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2555  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  40.41 
 
 
277 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.205375  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2247  ABC transporter  40 
 
 
277 aa  159  5e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3324  ATPase  39.15 
 
 
275 aa  159  5e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1322  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.08 
 
 
269 aa  158  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233307  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0181  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  40.87 
 
 
252 aa  158  9e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03977  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  39.41 
 
 
262 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03938  hypothetical protein  39.41 
 
 
262 aa  157  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4432  phosphonate ABC transporter ATP-binding  41.87 
 
 
271 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3921  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  39.41 
 
 
262 aa  157  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0309  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  39.92 
 
 
262 aa  156  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.053951 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4346  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  39.41 
 
 
262 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4571  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  39.41 
 
 
262 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4659  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  39.41 
 
 
262 aa  157  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3865  phosphonate ABC transporter ATP-binding  40 
 
 
272 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1000  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.63 
 
 
261 aa  156  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0185  phosphonate ABC transporter ATP-binding  40.68 
 
 
293 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5876  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  43.64 
 
 
267 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3886  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.98 
 
 
262 aa  155  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5858  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  39.17 
 
 
269 aa  155  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289421  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4960  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  41.85 
 
 
269 aa  155  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2010  phosphonates import ATP-binding protein  40.43 
 
 
265 aa  154  8e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.194756  normal  0.0179512 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6091  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  39.24 
 
 
288 aa  154  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29130  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  41.84 
 
 
267 aa  154  9e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2237  ABC transporter related  43.36 
 
 
277 aa  154  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0393  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.02 
 
 
264 aa  154  1e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.385125 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4623  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.6 
 
 
269 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.263735 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14301  putative phosphonate ABC transporter  42.15 
 
 
247 aa  153  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3862  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.39 
 
 
282 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4201  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  42.4 
 
 
273 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.171703  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1184  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  41.95 
 
 
307 aa  151  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0928  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.29 
 
 
256 aa  151  7e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00101449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2407  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  41.95 
 
 
307 aa  151  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2593  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  41.95 
 
 
307 aa  151  7e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0323  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  41.95 
 
 
307 aa  151  7e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.558714  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3304  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  41.95 
 
 
307 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296205  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4524  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.95 
 
 
307 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3350  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  41.95 
 
 
307 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2920  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  41.28 
 
 
272 aa  151  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4035  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.75 
 
 
273 aa  150  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.542235  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0215  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.75 
 
 
273 aa  150  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3338  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  41.95 
 
 
307 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2367  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.67 
 
 
277 aa  150  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0839  ABC phophonates transporter, ATPase subunit PhnC  42.19 
 
 
301 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0851593 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2156  phosphonate ABC transporter ATP-binding  42.73 
 
 
253 aa  149  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1231  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.26 
 
 
265 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.353455 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6364  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  37.93 
 
 
275 aa  149  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0620834  normal  0.857375 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2995  phosphonate ABC transporter ATP-binding  38.49 
 
 
279 aa  149  5e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.537941 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2676  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  38.49 
 
 
279 aa  149  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2339  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  36.05 
 
 
257 aa  148  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000337848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>