More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1793 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1793  putative phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 231 aa  473  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2802  ABC transporter related  70.23 
 
 		 225 aa  304  7e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0232474  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3310  putative phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  54.78 
 
 		 236 aa  263  2e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2346  ABC transporter-related protein  60.65 
 
 		 221 aa  259  3e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0523662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1544  ABC transporter related  56.02 
 
 		 225 aa  248  4e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.75811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1748  ABC transporter related  55.56 
 
 		 276 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00373907  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1769  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  49.3 
 
 		 225 aa  223  2e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0632527  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1898  ABC transporter related  47.96 
 
 		 236 aa  221  8e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2484  ABC transporter related  53.4 
 
 		 225 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2744  ABC transporter related  44.84 
 
 		 233 aa  186  4e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.600258  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3493  ABC transporter related  42.33 
 
 		 226 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1447  ABC transporter related  41.9 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1497  ABC transporter related  38.68 
 
 		 222 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2784  ABC transporter related  34.85 
 
 		 242 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.197707 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1649  ABC transporter related protein  32.79 
 
 		 248 aa  126  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0694  ABC transporter  33.88 
 
 		 265 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.109577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0104  ATPase  31.85 
 
 		 244 aa  123  2e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0790  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.29 
 
 		 265 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1745  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  32.43 
 
 		 278 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.35608  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07291  putative phosphonate ABC transporter  33.05 
 
 		 244 aa  122  6e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.305194  hitchhiker  0.00460957 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12501  hypothetical protein  32.41 
 
 		 261 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20300  ATP-binding component of ABC phosphonate transporter  32.43 
 
 		 278 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.540657  normal  0.410183 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2890  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.52 
 
 		 274 aa  118  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0336941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07851  putative phosphonate ABC transporter  32.38 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00266674 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2247  ABC transporter  31.33 
 
 		 277 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.215489 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0839  ABC phophonates transporter, ATPase subunit PhnC  31.73 
 
 		 301 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0851593 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2555  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  32.13 
 
 		 277 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.205375  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0672  ATPase  32.11 
 
 		 246 aa  116  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1184  ATPase  36.41 
 
 		 225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.795417  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07271  putative phosphonate ABC transporter  32.11 
 
 		 246 aa  115  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0413071  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2916  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30 
 
 		 284 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178582  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1616  ABC transporter related  33.61 
 
 		 277 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07251  putative phosphonate ABC transporter  30.49 
 
 		 246 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2920  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  32.38 
 
 		 272 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5876  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  29.27 
 
 		 267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0829  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  29.84 
 
 		 280 aa  113  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3709  phosphonate ABC transporter ATP-binding  30.45 
 
 		 272 aa  112  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.144608 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3865  phosphonate ABC transporter ATP-binding  32.52 
 
 		 272 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4431  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.56 
 
 		 284 aa  112  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4201  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  33.74 
 
 		 273 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.171703  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2433  ABC transporter-like  33.33 
 
 		 265 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0814206  normal  0.123252 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4571  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  29.02 
 
 		 262 aa  111  8.000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03977  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  29.02 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3886  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  29.02 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3921  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  29.02 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4361  ABC transporter related  32.77 
 
 		 264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0829786  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07451  putative phosphonate ABC transporter  32.2 
 
 		 243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03938  hypothetical protein  29.02 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1683  ABC transporter related protein  30.65 
 
 		 269 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0377  ABC transporter related  29.3 
 
 		 261 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.308685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4346  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  29.02 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4659  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  29.02 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3820  phosphonate ABC transporter ATP-binding  33.33 
 
 		 270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.693168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4524  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.52 
 
 		 307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0130  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  30.61 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000163104  hitchhiker  0.00000028065 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0825  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.64 
 
 		 269 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  0.0442115 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0393  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  32.13 
 
 		 264 aa  109  3e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.385125 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5619  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  28.97 
 
 		 262 aa  108  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0866  ABC transporter related  33.05 
 
 		 264 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3963  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  33.06 
 
 		 284 aa  108  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.704771 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0309  phosphonate/organophosphate ester transporter subunit  27.45 
 
 		 262 aa  108  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.053951 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1322  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.3 
 
 		 269 aa  108  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.233307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4623  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.52 
 
 		 269 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.263735 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1927  phosphonate ABC transporter ATP-binding  32.39 
 
 		 287 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.75646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4117  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.33 
 
 		 282 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.914371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4084  phosphonate ABC transporter ATP-binding  32.51 
 
 		 274 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.620388  normal  0.0392209 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4432  phosphonate ABC transporter ATP-binding  31.18 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4668  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.15 
 
 		 300 aa  106  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.621423  decreased coverage  0.000827837 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6091  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  29.6 
 
 		 288 aa  106  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3350  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  31.73 
 
 		 307 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3338  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  31.73 
 
 		 307 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1293  ATPase  33.93 
 
 		 234 aa  106  3e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.484642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1594  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.43 
 
 		 261 aa  106  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3304  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  31.73 
 
 		 307 aa  106  4e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296205  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2593  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  31.73 
 
 		 307 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2407  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  31.73 
 
 		 307 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3919  ABC transporter related protein  31.63 
 
 		 275 aa  105  5e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1184  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  31.73 
 
 		 307 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0323  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  31.73 
 
 		 307 aa  105  5e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.558714  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0768  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.52 
 
 		 270 aa  105  6e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2187  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.43 
 
 		 275 aa  105  8e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3234  phosphonate ABC transporter ATP-binding  28.57 
 
 		 257 aa  104  9e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5858  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  32.11 
 
 		 269 aa  104  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0914  ATP-binding protein of phosphonate ABC transporter  30.86 
 
 		 275 aa  104  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.672205  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0278  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  31.09 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2156  phosphonate ABC transporter ATP-binding  31.85 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0335  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  32.24 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4787  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  28.69 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.334656  normal  0.0646281 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3516  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  29.8 
 
 		 261 aa  102  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21160  ABC transporter ATP-binding protein  30.7 
 
 		 267 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.511735  normal  0.707952 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2299  ABC phosphate/phosphonate transport system ATPase  29.88 
 
 		 259 aa  102  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3258  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.16 
 
 		 272 aa  102  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.617138  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1278  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.17 
 
 		 281 aa  102  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1825  ABC transporter related  31.43 
 
 		 275 aa  102  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.123024 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3242  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.17 
 
 		 279 aa  102  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980912  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3993  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.17 
 
 		 279 aa  102  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.642623  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14301  putative phosphonate ABC transporter  32.11 
 
 		 247 aa  101  8e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0185  phosphonate ABC transporter ATP-binding  29.1 
 
 		 293 aa  101  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.655901  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0181  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.95 
 
 		 252 aa  101  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2056  ABC transporter related  32.17 
 
 		 272 aa  101  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.128496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>