More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0104 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007335  PMN2A_0104  ATPase  100 
 
 
244 aa  483  1e-135  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07291  putative phosphonate ABC transporter  97.95 
 
 
244 aa  474  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.305194  hitchhiker  0.00460957 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07851  putative phosphonate ABC transporter  52.05 
 
 
245 aa  252  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00266674 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14301  putative phosphonate ABC transporter  46.31 
 
 
247 aa  223  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1184  ATPase  43.81 
 
 
225 aa  212  4.9999999999999996e-54  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.795417  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07451  putative phosphonate ABC transporter  50.22 
 
 
243 aa  211  9e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1293  ATPase  42.21 
 
 
234 aa  201  8e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.484642  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07271  putative phosphonate ABC transporter  45.27 
 
 
246 aa  201  8e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0413071  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07251  putative phosphonate ABC transporter  45.27 
 
 
246 aa  199  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0672  ATPase  44.03 
 
 
246 aa  192  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1649  ABC transporter related protein  32.16 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0181  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  32.03 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0484  ABC transporter related  32.77 
 
 
499 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.431216  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2784  ABC transporter related  32.13 
 
 
242 aa  131  9e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.197707 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0455  phosphonate ABC transporter ATPase  31.88 
 
 
498 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.874499  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0489  ABC transporter-related protein  32.61 
 
 
498 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.878745  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3337  ABC transporter related  32.53 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.373917 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0928  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.55 
 
 
256 aa  129  6e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00101449  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2203  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  32.55 
 
 
252 aa  128  8.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2299  ABC phosphate/phosphonate transport system ATPase  34.42 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0790  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.93 
 
 
265 aa  125  7e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2080  ABC transporter related  34.53 
 
 
272 aa  125  8.000000000000001e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0130  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  31.58 
 
 
261 aa  125  8.000000000000001e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000163104  hitchhiker  0.00000028065 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0694  ABC transporter  32.93 
 
 
265 aa  125  9e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.109577  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3019  ABC transporter related  31.3 
 
 
507 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1793  putative phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  31.85 
 
 
231 aa  123  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.360055  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3198  ABC transporter related  32.91 
 
 
266 aa  123  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.012913 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0914  ATP-binding protein of phosphonate ABC transporter  33.91 
 
 
275 aa  122  4e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.672205  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3908  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.87 
 
 
267 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.480865 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0215  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.49 
 
 
273 aa  122  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2433  ABC transporter-like  32.17 
 
 
265 aa  122  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0814206  normal  0.123252 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4035  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.49 
 
 
273 aa  122  5e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.542235  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3859  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.87 
 
 
267 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12501  hypothetical protein  37.71 
 
 
261 aa  122  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1097  ATPase  34.5 
 
 
254 aa  121  8e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3264  hypothetical protein  31.58 
 
 
273 aa  121  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.634787 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1927  phosphonate ABC transporter ATP-binding  33.62 
 
 
287 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.75646  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5876  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.47 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2367  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  33.48 
 
 
277 aa  119  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3242  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.5 
 
 
279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.980912  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1449  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.58 
 
 
254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00372903  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3993  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.5 
 
 
279 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.642623  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0335  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  34.19 
 
 
246 aa  119  3.9999999999999996e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4668  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  27.02 
 
 
300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.621423  decreased coverage  0.000827837 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2676  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  33.74 
 
 
279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2995  phosphonate ABC transporter ATP-binding  33.74 
 
 
279 aa  119  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.537941 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1278  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.5 
 
 
281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3310  putative phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  32.5 
 
 
236 aa  118  7e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4994  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  35.32 
 
 
260 aa  118  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463894  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1805  ABC transporter ATP-binding protein  33.04 
 
 
267 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2339  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  31.73 
 
 
257 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000337848  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3440  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl572  phosphonate ABC transporter ATP-binding component  34.85 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3963  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  32.76 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.704771 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1594  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.71 
 
 
261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4575  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.54 
 
 
281 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3256  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  29.82 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.485781  normal  0.200264 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0866  ABC transporter related  32.39 
 
 
264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3694  ABC phosphonate transporter ATP-binding protein  32.86 
 
 
274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0825  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.02 
 
 
269 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.86825  normal  0.0442115 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6364  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  29.63 
 
 
275 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0620834  normal  0.857375 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1231  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.76 
 
 
265 aa  116  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.353455 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4361  ABC transporter related  31.33 
 
 
264 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0829786  normal  0.697939 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3304  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  32.2 
 
 
307 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.296205  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3745  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3338  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  32.2 
 
 
307 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.107305  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3391  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
257 aa  115  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.193005  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3350  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  32.2 
 
 
307 aa  115  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3474  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 
257 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3749  phosphonate ABC transporter ATP-binding  33.33 
 
 
257 aa  115  6e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3703  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
257 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000015251 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4152  ABC transporter related  31.47 
 
 
266 aa  115  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2286  ABC transporter related  31.47 
 
 
266 aa  115  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2346  ABC transporter-related protein  29.44 
 
 
221 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0523662  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3722  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  33.76 
 
 
257 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156195  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21160  ABC transporter ATP-binding protein  33.04 
 
 
267 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.511735  normal  0.707952 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4431  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  29.61 
 
 
284 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.319208  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0458  ABC type ATPase  28.46 
 
 
272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.345895  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2407  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  32.2 
 
 
307 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1184  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  32.2 
 
 
307 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2593  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  32.2 
 
 
307 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0323  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  32.2 
 
 
307 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.558714  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0829  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.93 
 
 
280 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0422  ABC type ATPase  28.46 
 
 
272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.861299  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3516  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  29.72 
 
 
261 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1544  ABC transporter related  30.47 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.75811  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2187  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  29.54 
 
 
275 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4117  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  29.18 
 
 
282 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.914371  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19780  Phosphonate ABC transporter, ATP binding component  33.19 
 
 
266 aa  113  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.211931  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4960  phosphonate ABC transporter ATPase subunit  33.33 
 
 
269 aa  112  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0894  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  30.31 
 
 
275 aa  112  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.658454  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0597  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  32.63 
 
 
270 aa  112  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00266956 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1059  hypothetical protein  34.75 
 
 
245 aa  112  6e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1345  phosphonate ABC transporter ATP-binding protein  32.54 
 
 
278 aa  112  7.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0502345 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  30.08 
 
 
235 aa  112  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2799  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  32.54 
 
 
278 aa  112  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0365  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.5 
 
 
252 aa  112  7.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2878  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  32.54 
 
 
278 aa  112  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11301  ABC-type phosphate/phosphonate transport system, ATPase component  33.07 
 
 
257 aa  111  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0500512 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0758  ABC transporter related  32.42 
 
 
237 aa  111  9e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0209945  normal  0.958202 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>