31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1922 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1922  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 93 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0282739 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3015  putative prophage repressor  38.33 
 
 		 227 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2878  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 322 aa  48.5  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00252317  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2304  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2300  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2296  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.488898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2292  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.625502 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1025  helix-turn-helix domain-containing protein  36.36 
 
 		 130 aa  44.3  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00102853  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0012  Cro/CI family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  42.31 
 
 		 205 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1881  DNA-binding protein  38 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5468  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 174 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.624713 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0918  XRE family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 229 aa  42.4  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000791351  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2391  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 		 247 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.274459 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0956  DNA-binding protein  30 
 
 		 92 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187553  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1529  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.17746 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0944  DNA-binding protein transcriptional regulator  30 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000485883  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0776  helix-turn-helix domain-containing protein  32.76 
 
 		 123 aa  41.2  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000212762  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2785  helix-turn-helix domain-containing protein  34.38 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1103  hypothetical protein  30 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23911e-56 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1350  DNA-binding protein  34.48 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3572  transcriptional regulator, XRE family  39.58 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.405573  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2728  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 189 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1022  DNA-binding protein  30 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000116919  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0945  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 149 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000414379  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0514  DNA-binding protein  35.85 
 
 		 328 aa  40.8  0.007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00329657 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1063  hypothetical protein  30 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0001043  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1716  Cro/CI family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 197 aa  40.4  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.229171  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0092  XRE family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 210 aa  40.4  0.009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0045  PbsX family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 117 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.108741  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  44.19 
 
 		 133 aa  40  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000203467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>