298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0127 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_0127  glutathione S-transferase domain-containing protein  100 
 
 
217 aa  441  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0148  glutathione S-transferase domain-containing protein  73.73 
 
 
216 aa  329  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.959935  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0027  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.91 
 
 
215 aa  254  7e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0450096  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4049  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.91 
 
 
215 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0089  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.99 
 
 
215 aa  252  3e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3840  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.45 
 
 
215 aa  252  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3933  glutathione S-transferase domain-containing protein  59.45 
 
 
215 aa  251  6e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4390  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.6 
 
 
215 aa  246  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4215  Glutathione S-transferase domain protein  57.6 
 
 
215 aa  246  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4254  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.6 
 
 
215 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0126  glutathione S-transferase domain-containing protein  57.14 
 
 
215 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4697  glutathione S-transferase  59.45 
 
 
215 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3548  glutathione S-transferase  55.1 
 
 
217 aa  201  6e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4063  glutathione S-transferase domain-containing protein  46.95 
 
 
233 aa  190  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0803873  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6889  putative glutathione S-transferase  39.55 
 
 
391 aa  128  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0839725  normal  0.0391413 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5077  Glutathione S-transferase domain protein  32.67 
 
 
211 aa  111  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2295  Glutathione S-transferase domain protein  36.26 
 
 
228 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.902832 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2062  Glutathione S-transferase domain  36.05 
 
 
228 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3436  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.04 
 
 
215 aa  105  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.226272  normal  0.877498 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3477  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.9 
 
 
217 aa  95.1  7e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1953  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.5 
 
 
224 aa  92.4  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428029  normal  0.0851297 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2930  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.56 
 
 
217 aa  92  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000195248  hitchhiker  0.000964394 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3314  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.14 
 
 
248 aa  89.4  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.443514  normal  0.158342 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0183  glutathione S-transferase-like protein  34.71 
 
 
219 aa  89  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.220885 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3491  glutathione S-transferase  31.03 
 
 
217 aa  88.6  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3446  putative glutathione S-transferase  33.14 
 
 
219 aa  88.6  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4798  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.12 
 
 
219 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.427555  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5354  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.14 
 
 
219 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5471  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.53 
 
 
219 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.375006 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5390  glutathione S-transferase-like  33.53 
 
 
219 aa  87  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.602647  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4813  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.14 
 
 
219 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488854  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1768  glutathione S-transferase, putative  29.82 
 
 
219 aa  86.3  3e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00268696  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0827  putative glutathione S-transferase  29.82 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000433785  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1576  putative glutathione S-transferase  29.82 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00035479  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1033  Glutathione S-transferase domain  29.82 
 
 
219 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.372971 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0044  putative glutathione S-transferase  29.82 
 
 
303 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123051  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0951  putative glutathione S-transferase  29.82 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000550052  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2204  glutathione S-transferase-like protein  29.82 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000939621  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0858  putative glutathione S-transferase  29.82 
 
 
303 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.211682  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3110  putative glutathione S-transferase  31.58 
 
 
218 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.000803235  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0009  glutathione S-transferase-like protein  33.53 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.607663  normal  0.0509198 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3839  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.99 
 
 
226 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595735  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2570  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.29 
 
 
228 aa  79.7  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00976958 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5453  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.31 
 
 
217 aa  78.2  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0448477 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1312  putative glutathione S-transferase  29.82 
 
 
246 aa  74.7  0.0000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.503911  normal  0.626751 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2818  Glutathione S-transferase domain protein  27.33 
 
 
219 aa  71.2  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2825  glutathione S-transferase-like  33.92 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0647  glutathione S-transferase domain-containing protein  25 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.474841  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3308  glutathione S-transferase  31.89 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5294  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.14 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.95189  normal  0.556954 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2116  glutathione S-transferase-like protein  28.57 
 
 
203 aa  63.9  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.489753  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2555  Glutathione S-transferase domain protein  29.27 
 
 
202 aa  62  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1792  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.83 
 
 
205 aa  62.4  0.000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.617616  normal  0.072822 
 
 
-
 
NC_004310  BR0839  glutathione S-transferase family protein  30.72 
 
 
215 aa  62  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0275  glutathione S-transferase-like  29.61 
 
 
221 aa  62  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0888177 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0500  Glutathione S-transferase domain  29.57 
 
 
222 aa  61.6  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0342057 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2873  Glutathione S-transferase domain  30.23 
 
 
260 aa  61.6  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2965  Glutathione S-transferase domain  29.27 
 
 
202 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2778  Glutathione S-transferase domain protein  28.16 
 
 
261 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2557  glutathione S-transferase-like protein  27.66 
 
 
205 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.630075 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0214  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.36 
 
 
230 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.163491  normal  0.307378 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2887  glutathione S-transferase-like  26.9 
 
 
226 aa  61.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.862789  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3954  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.19 
 
 
205 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.251267 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3090  glutathione S-transferase  29.32 
 
 
203 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.840634  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2386  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.53 
 
 
230 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.10495  normal  0.984704 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2856  Glutathione S-transferase domain protein  29.27 
 
 
203 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.438523 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3541  Glutathione S-transferase domain  29.76 
 
 
203 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468115  normal  0.06049 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2385  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.52 
 
 
216 aa  60.5  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.167846  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2663  Glutathione S-transferase domain  26.53 
 
 
230 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.657394  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0417  stringent starvation protein A, SspA  29.76 
 
 
203 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2740  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.76 
 
 
203 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3227  glutathione S-transferase-like protein  29.32 
 
 
203 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2760  glutathione S-transferase-like  28.4 
 
 
215 aa  60.5  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3203  Glutathione S-transferase domain  29.27 
 
 
203 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.802093 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0069  Glutathione S-transferase domain protein  23.33 
 
 
218 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2343  Glutathione S-transferase domain  26.53 
 
 
230 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  0.656048 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3542  glutathione S-transferase  29.76 
 
 
203 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.412867 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0371  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.76 
 
 
203 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  0.452731 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2663  glutathione S-transferase-like  29.76 
 
 
203 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.763542  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0423  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.76 
 
 
203 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102515  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0362  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.76 
 
 
203 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0609511  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3133  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.21 
 
 
230 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.05587  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0444  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.76 
 
 
203 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0347  glutathione S-transferase domain-containing protein  29.76 
 
 
203 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0846  glutathione S-transferase  28.82 
 
 
202 aa  59.3  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.289081  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5554  glutathione S-transferase-like protein  32.08 
 
 
218 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.170335 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2250  glutathione S-transferase-like protein  32.7 
 
 
218 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2226  glutathione S-transferase-like protein  31.65 
 
 
218 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1614  glutathione S-transferase-like  31.65 
 
 
218 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2926  putative transcription modulator protein  28.78 
 
 
203 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1808  stringent starvation protein A  29.27 
 
 
203 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2695  stringent starvation protein A  29.27 
 
 
203 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2745  stringent starvation protein A  29.27 
 
 
203 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3672  stringent starvation protein A  29.27 
 
 
203 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.381091  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1144  glutathione S-transferase  32.07 
 
 
241 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2805  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.07 
 
 
225 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383982  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2974  stringent starvation protein A  29.27 
 
 
203 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.904673  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0831  glutathione S-transferase family protein  30.12 
 
 
294 aa  57.8  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3259  stringent starvation protein A  29.27 
 
 
203 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3647  stringent starvation protein A  29.27 
 
 
203 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.48548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>