32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2021 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2021  hypothetical protein  100 
 
 
62 aa  128  3e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1675  T4 family peptidase  59.68 
 
 
325 aa  92.8  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.135147  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1410  T4 family peptidase  59.68 
 
 
325 aa  92.8  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.568813  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0482  peptidase S58 DmpA  56.6 
 
 
316 aa  72.4  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000526803  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1077  peptidase S58 DmpA  45.16 
 
 
328 aa  68.2  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.234138  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2221  peptidase S58 DmpA  43.33 
 
 
361 aa  67  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000010872  hitchhiker  4.545e-18 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0168  peptidase S58 DmpA  44.64 
 
 
319 aa  63.9  0.0000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2004  peptidase S58 DmpA  43.33 
 
 
334 aa  62.4  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00577301  hitchhiker  0.0000000124631 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3050  peptidase S58 DmpA  42.62 
 
 
363 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.578156  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0349  hypothetical protein  42.62 
 
 
368 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0317  hypothetical protein  42.62 
 
 
368 aa  56.6  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2797  peptidase S58 DmpA  36.36 
 
 
331 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.913427 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3246  peptidase S58, DmpA  35.59 
 
 
322 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2943  peptidase S58 DmpA  37.1 
 
 
323 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.141829 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4655  peptidase S58 DmpA  37.1 
 
 
347 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.505511 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1091  peptidase S58 DmpA  33.33 
 
 
328 aa  43.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0087  peptidase S58 DmpA  34.48 
 
 
313 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1456  peptidase S58 DmpA  35.42 
 
 
300 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.749732  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3851  peptidase S58, DmpA  53.33 
 
 
340 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3189  peptidase S58 DmpA  33.33 
 
 
339 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11365  hydrolase  57.14 
 
 
344 aa  42.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000003196  normal  0.48244 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3837  peptidase S58, DmpA  53.33 
 
 
340 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.449487  normal  0.0858293 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3925  peptidase S58, DmpA  53.33 
 
 
340 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3677  peptidase S58 DmpA  29.85 
 
 
350 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2605  peptidase S58, DmpA  32.76 
 
 
337 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.754306  normal  0.47844 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1962  peptidase S58 DmpA  60.71 
 
 
352 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3716  peptidase S58 DmpA  33.87 
 
 
329 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00511947 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1959  peptidase S58, DmpA  30.65 
 
 
306 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0895566  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0198  peptidase S58 DmpA  37.04 
 
 
287 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2660  peptidase S58 DmpA  35.09 
 
 
322 aa  40.8  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3228  peptidase S58, DmpA  35.59 
 
 
318 aa  40.8  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2683  peptidase S58 DmpA  33.33 
 
 
342 aa  40  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.283416 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>