64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1546 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1546  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  343  8.999999999999999e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  27.27 
 
 		 394 aa  51.2  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1320  SMC domain protein  32.39 
 
 		 422 aa  50.8  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  29.06 
 
 		 393 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  34.02 
 
 		 399 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2281  ATPase  39.22 
 
 		 390 aa  48.1  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  46.15 
 
 		 388 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  33.04 
 
 		 390 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  33.04 
 
 		 390 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1541  hypothetical protein  41.82 
 
 		 131 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0141757 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  30.7 
 
 		 398 aa  46.6  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  46.67 
 
 		 385 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  33.04 
 
 		 390 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  33.78 
 
 		 395 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1514  ATPase-like protein  41.82 
 
 		 131 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2706  hypothetical protein  33.78 
 
 		 395 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  30.26 
 
 		 390 aa  44.3  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  38.64 
 
 		 367 aa  44.3  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  46.51 
 
 		 395 aa  44.3  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08280  predicted ATPase  41.86 
 
 		 392 aa  44.3  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0509 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  38.64 
 
 		 367 aa  44.3  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  44.23 
 
 		 388 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  38 
 
 		 412 aa  43.9  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  44.44 
 
 		 388 aa  43.9  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5019  ATPase, RecF-like protein  44.19 
 
 		 388 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2255  ATPase, RecF-like  44.19 
 
 		 393 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  43.4 
 
 		 392 aa  43.5  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  44.19 
 
 		 390 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  44.44 
 
 		 385 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  33.33 
 
 		 392 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1910  ATPase-like protein  33.33 
 
 		 391 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00358131 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  44.19 
 
 		 390 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4732  hypothetical protein  28.17 
 
 		 387 aa  42.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6192  ATPase-like  33.33 
 
 		 391 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  24.07 
 
 		 394 aa  42.4  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1887  ATPase-like protein  33.33 
 
 		 391 aa  42.4  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  44.19 
 
 		 388 aa  42  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  33.9 
 
 		 410 aa  41.6  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6253  ATPase, RecF-like protein  40 
 
 		 393 aa  41.6  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.131288 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54090  hypothetical protein  29.82 
 
 		 387 aa  41.6  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3194  ATPase-like protein  30.26 
 
 		 387 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794504  normal  0.0937144 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2525  hypothetical protein  30.26 
 
 		 387 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.125523  normal  0.711801 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  41.51 
 
 		 436 aa  41.2  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  41.51 
 
 		 392 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  41.51 
 
 		 436 aa  41.2  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  41.51 
 
 		 436 aa  41.2  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  41.51 
 
 		 392 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  41.51 
 
 		 392 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  41.51 
 
 		 436 aa  41.2  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2001  SMC domain-containing protein  30.26 
 
 		 387 aa  41.2  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  44.19 
 
 		 390 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  44.19 
 
 		 390 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  41.86 
 
 		 390 aa  41.2  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  44.19 
 
 		 390 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  37.29 
 
 		 410 aa  41.2  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2354  hypothetical protein  39.58 
 
 		 565 aa  40.8  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  41.86 
 
 		 390 aa  41.2  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  44.19 
 
 		 390 aa  41.2  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3224  ATP-dependent OLD family endonuclease  45.65 
 
 		 615 aa  40.8  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2931  hypothetical protein  24.11 
 
 		 382 aa  40.8  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1824  ATPase-like protein  31.67 
 
 		 391 aa  40.4  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.248078  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1796  ATPase-like protein  31.67 
 
 		 391 aa  40.4  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47820  hypothetical protein  28.85 
 
 		 395 aa  40.4  0.01  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.088572  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  28.81 
 
 		 385 aa  40.4  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.261126 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>