More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1605 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1605  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 471 aa  955    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0092  aldehyde dehydrogenase  63.09 
 
 		 467 aa  626  1e-178  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204667  normal  0.62822 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4370  aldehyde dehydrogenase  64.01 
 
 		 467 aa  612  9.999999999999999e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3845  putative aldehyde dehydrogenase family protein  64.01 
 
 		 470 aa  604  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0438  aldehyde dehydrogenase  58.37 
 
 		 467 aa  552  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1710  betaine-aldehyde dehydrogenase  59.7 
 
 		 467 aa  553  1e-156  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2065  aldehyde dehydrogenase  56.34 
 
 		 472 aa  535  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5135  aldehyde dehydrogenase  53.22 
 
 		 467 aa  529  1e-149  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.450877  normal  0.542224 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0153  betaine-aldehyde dehydrogenase  51.5 
 
 		 470 aa  519  1e-146  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.397476  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1459  aldehyde dehydrogenase  55.7 
 
 		 472 aa  505  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0779486  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1692  aldehyde dehydrogenase  53.65 
 
 		 467 aa  508  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.295608  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0704  betaine-aldehyde dehydrogenase  53.43 
 
 		 469 aa  488  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0298725  normal  0.676503 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7686  NAD-dependent succinate aldehyde dehydrogenase  49.78 
 
 		 475 aa  473  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3240  aldehyde dehydrogenase  50.97 
 
 		 535 aa  472  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.5112  normal  0.0278699 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4457  Aldehyde Dehydrogenase  52.15 
 
 		 468 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399001  normal  0.0106481 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1155  aldehyde dehydrogenase family protein  50.64 
 
 		 468 aa  458  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5544  aldehyde dehydrogenase  47.95 
 
 		 486 aa  457  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1834  aldehyde dehydrogenase  47.97 
 
 		 469 aa  454  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.235892  normal  0.722777 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3135  aldehyde dehydrogenase  47.79 
 
 		 463 aa  448  1e-125  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2494  Betaine-aldehyde dehydrogenase  50.54 
 
 		 468 aa  449  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000289704  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2985  Aldehyde Dehydrogenase  51.66 
 
 		 473 aa  444  1e-123  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.837677  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3432  Aldehyde Dehydrogenase  49.35 
 
 		 474 aa  444  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5515  aldehyde dehydrogenase  49.34 
 
 		 479 aa  442  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1024  aldehyde dehydrogenase  47.74 
 
 		 471 aa  434  1e-120  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.736803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1425  aldehyde dehydrogenase  48.25 
 
 		 484 aa  426  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.317101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3297  aldehyde dehydrogenase  48.37 
 
 		 468 aa  420  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09198  conserved hypothetical protein  44.14 
 
 		 503 aa  405  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2503  aldehyde dehydrogenase  48.33 
 
 		 477 aa  407  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.494171  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3589  aldehyde dehydrogenase  46.37 
 
 		 475 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.927653  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1257  Aldehyde Dehydrogenase  47.74 
 
 		 478 aa  404  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0777577  normal  0.0130742 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03573  conserved hypothetical protein  43.66 
 
 		 446 aa  397  1e-109  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0358938  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03205  aldehyde dehydrogenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G02830)  42.4 
 
 		 473 aa  395  1e-108  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.31244  normal  0.0342555 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3186  aldehyde dehydrogenase  41.63 
 
 		 452 aa  385  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00740  conserved hypothetical protein  40.52 
 
 		 479 aa  384  1e-105  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.91401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3511  aldehyde dehydrogenase  46.94 
 
 		 469 aa  385  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3616  Aldehyde Dehydrogenase  49.09 
 
 		 469 aa  377  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1915  Aldehyde Dehydrogenase  50 
 
 		 477 aa  360  3e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00249538  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0503  aldehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  40.84 
 
 		 476 aa  360  3e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2710  Aldehyde Dehydrogenase  44.42 
 
 		 467 aa  350  3e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.516106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4688  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.04 
 
 		 500 aa  349  7e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5624  aldehyde dehydrogenase  42.8 
 
 		 486 aa  348  9e-95  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.276827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1663  aldehyde dehydrogenase  42.58 
 
 		 486 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.131134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2239  aldehyde dehydrogenase  42.8 
 
 		 486 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0390454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1637  aldehyde dehydrogenase  42.58 
 
 		 486 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1610  aldehyde dehydrogenase  42.58 
 
 		 486 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0486  aldehyde dehydrogenase  42.8 
 
 		 486 aa  347  2e-94  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.577547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0667  aldehyde dehydrogenase  42.58 
 
 		 486 aa  347  3e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0569  aldehyde dehydrogenase  42.58 
 
 		 486 aa  347  3e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.710627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  41.6 
 
 		 485 aa  346  4e-94  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5502  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.62 
 
 		 500 aa  346  6e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3586  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.62 
 
 		 500 aa  346  6e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4781  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.62 
 
 		 500 aa  346  6e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4164  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.83 
 
 		 500 aa  345  7e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1201  betaine-aldehyde dehydrogenase  41.33 
 
 		 476 aa  345  8.999999999999999e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.18248  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5435  aldehyde dehydrogenase  42.77 
 
 		 504 aa  344  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.846738  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0744  Betaine-aldehyde dehydrogenase  40 
 
 		 496 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0933  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.17 
 
 		 500 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1307  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.32 
 
 		 476 aa  339  8e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.424355  normal  0.0731768 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0152  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  39.36 
 
 		 480 aa  337  1.9999999999999998e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1723  aldehyde dehydrogenase  43.45 
 
 		 459 aa  337  1.9999999999999998e-91  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0635196  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  41.43 
 
 		 494 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1760  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  43.05 
 
 		 461 aa  335  9e-91  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00253388  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5622  aldehyde dehydrogenase  38.32 
 
 		 488 aa  333  3e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.216133 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0566  Aldehyde Dehydrogenase  39.49 
 
 		 476 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.359165  normal  0.116957 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  41 
 
 		 494 aa  332  8e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4591  Betaine-aldehyde dehydrogenase  37.95 
 
 		 486 aa  332  1e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1537  phenylacetaldehyde dehydrogenase  40.21 
 
 		 573 aa  332  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1745  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.24 
 
 		 498 aa  331  2e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38450  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  40.75 
 
 		 486 aa  330  4e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5214  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.95 
 
 		 488 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  37.95 
 
 		 488 aa  329  6e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1044  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  38.98 
 
 		 474 aa  329  8e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.973178  normal  0.50904 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.07 
 
 		 496 aa  328  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4031  aldehyde dehydrogenase  37.39 
 
 		 493 aa  326  4.0000000000000003e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00301936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5886  Aldehyde Dehydrogenase  39.75 
 
 		 481 aa  326  5e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2413  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  39.01 
 
 		 481 aa  326  6e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4061  Aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  38.33 
 
 		 505 aa  325  1e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1201  phenylacetaldehyde dehydrogenase  39.58 
 
 		 500 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  38.19 
 
 		 490 aa  324  2e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1274  phenylacetaldehyde dehydrogenase  39.63 
 
 		 500 aa  324  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.226491  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2599  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  38.82 
 
 		 490 aa  324  2e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.225795  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3909  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  40.08 
 
 		 487 aa  323  4e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2466  phenylacetaldehyde dehydrogenase  39.38 
 
 		 500 aa  323  5e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1868  Retinal dehydrogenase  37.66 
 
 		 492 aa  323  6e-87  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  37.53 
 
 		 488 aa  323  6e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1147  betaine aldehyde dehydrogenase  39.66 
 
 		 488 aa  322  8e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.53 
 
 		 488 aa  322  8e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1365  phenylacetaldehyde dehydrogenase  39.17 
 
 		 500 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3372  phenylacetaldehyde dehydrogenase  37.74 
 
 		 494 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0348  phenylacetaldehyde dehydrogenase  39.17 
 
 		 500 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0943  phenylacetaldehyde dehydrogenase  39.17 
 
 		 500 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0371587  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0628  phenylacetaldehyde dehydrogenase  39.17 
 
 		 500 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.596423  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6908  aldehyde dehydrogenase  40.13 
 
 		 483 aa  321  1.9999999999999998e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.997054  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09034  aldehyde dehydrogenase ALDH (AFU_orthologue; AFUA_8G02310)  36.73 
 
 		 511 aa  320  3.9999999999999996e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.699324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29563  Aldehyde dehydrogenase  36.98 
 
 		 495 aa  320  5e-86  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.161421  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01689  aldehyde dehydrogenase family (Eurofung)  37.15 
 
 		 501 aa  319  6e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.259255 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4269  Aldehyde Dehydrogenase  36.85 
 
 		 496 aa  319  6e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3376  aldehyde dehydrogenase  37.11 
 
 		 488 aa  319  6e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.399948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0828  hypothetical protein  40.84 
 
 		 455 aa  319  7e-86  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3379  phenylacetaldehyde dehydrogenase  37.53 
 
 		 494 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>