More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_13340 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_13340  glycine cleavage system H protein  100 
 
 		 127 aa  254  3e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0960  glycine cleavage system H protein  63.49 
 
 		 130 aa  160  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0536  glycine cleavage system H protein  60 
 
 		 127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3846  glycine cleavage system H protein  58.27 
 
 		 129 aa  150  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0766  glycine cleavage system H protein  60.5 
 
 		 127 aa  150  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0046  glycine cleavage system H protein  59.17 
 
 		 122 aa  150  8e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.517546  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2352  glycine cleavage system H protein  59.35 
 
 		 126 aa  147  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0122881  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0142  glycine cleavage system protein H  52.8 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.207968  normal  0.345489 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3323  glycine cleavage system protein H  53.17 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1755  glycine cleavage system protein H  56.91 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.311333  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1719  glycine cleavage system H protein  51.59 
 
 		 130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.891721 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2383  glycine cleavage system H protein  61.29 
 
 		 126 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6247  glycine cleavage system H protein  61.16 
 
 		 127 aa  144  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.150459  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0095  glycine cleavage system H protein  60.16 
 
 		 123 aa  144  5e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2758  glycine cleavage system protein H  52.76 
 
 		 130 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02736  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0429973  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0788  glycine cleavage system H protein  50.39 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.471951  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4998  glycine cleavage system protein H  57.26 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4195  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3036  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.197625  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3325  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1915  glycine cleavage system H protein  64.42 
 
 		 124 aa  143  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014329 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3289  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02699  hypothetical protein  50.39 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0553776  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3391  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  0.844228 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3063  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3286  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3183  glycine cleavage system protein H  57.72 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000182392  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0805  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0782061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3212  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0254293  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3224  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 129 aa  142  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3324  glycine cleavage H-protein  50.4 
 
 		 155 aa  141  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2521  glycine cleavage system H protein  58.06 
 
 		 126 aa  141  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.00701703 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3231  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 129 aa  140  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.816191  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0158  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 126 aa  140  5e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2523  glycine cleavage system protein H  52.38 
 
 		 127 aa  140  8e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.85836  normal  0.122501 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0425  glycine cleavage system H protein  54.47 
 
 		 126 aa  139  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.283149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3831  glycine cleavage system protein H  51.97 
 
 		 128 aa  139  9e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.396771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0868  glycine cleavage system protein H  51.97 
 
 		 128 aa  139  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0864  glycine cleavage system protein H  51.97 
 
 		 128 aa  139  9e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.786548  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1693  glycine cleavage system protein H  52.85 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.418268  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2910  glycine cleavage system protein H  52 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0145  glycine cleavage system protein H  52 
 
 		 126 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11856  glycine cleavage system protein H  51.13 
 
 		 134 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.795989 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0144  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 126 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.87599 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12390  glycine cleavage system H protein  56.3 
 
 		 123 aa  137  3.9999999999999997e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00556536  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1191  glycine cleavage system protein H  49.6 
 
 		 130 aa  137  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3136  glycine cleavage system protein H  53.12 
 
 		 131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.323825  normal  0.0420611 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1244  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 128 aa  137  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14980  glycine cleavage system H protein  52.46 
 
 		 129 aa  137  4.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0575486  normal  0.572027 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0132  glycine cleavage system H protein  51.2 
 
 		 153 aa  137  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2715  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 128 aa  137  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1812  glycine cleavage system protein H  52 
 
 		 131 aa  137  7e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2621  glycine cleavage system protein H  51.2 
 
 		 128 aa  137  7e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233728  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0317  glycine cleavage system H protein  52.34 
 
 		 128 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5357  glycine cleavage system H protein  51.2 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3254  glycine cleavage system H protein  50.4 
 
 		 126 aa  135  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1540  glycine cleavage system H protein  55.65 
 
 		 133 aa  135  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186555  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2720  glycine cleavage system protein H  51.97 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0615009  normal  0.778842 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00862  glycine cleavage system protein H  53.54 
 
 		 129 aa  135  2e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1541  glycine cleavage system H protein  55.74 
 
 		 128 aa  135  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001692 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2046  glycine cleavage system protein H  48.44 
 
 		 129 aa  134  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00500  glycine cleavage system H protein  54.92 
 
 		 123 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.745408  normal  0.125042 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1543  glycine cleavage system H protein  50.4 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.532725  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3060  glycine cleavage system H protein  50.4 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2994  glycine cleavage system H protein  50.4 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3310  glycine cleavage system H protein  50.4 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0128  glycine cleavage system H protein  50.4 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3927  glycine cleavage system H protein  50.4 
 
 		 126 aa  134  4e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0419405  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3097  glycine cleavage system H protein  54.47 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.215874  normal  0.0104752 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3084  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 127 aa  134  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3591  glycine cleavage system protein H  51.18 
 
 		 129 aa  134  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.961592  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2933  glycine cleavage system protein H  49.61 
 
 		 127 aa  134  5e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00141908  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3127  glycine cleavage system H protein  54.03 
 
 		 126 aa  134  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3998  glycine cleavage system H protein  51.2 
 
 		 126 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3150  glycine cleavage system protein H  52.71 
 
 		 129 aa  134  6.0000000000000005e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000198497  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2714  glycine cleavage system H protein  56.1 
 
 		 128 aa  133  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0651249  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1467  glycine cleavage system protein H  52.42 
 
 		 126 aa  133  8e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0733861 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3436  glycine cleavage system protein H  48.8 
 
 		 135 aa  133  9e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0780  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3210  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0184338  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3330  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.277505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3500  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 129 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.497243  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4859  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000908449  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4700  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4716  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000916909  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1612  glycine cleavage system protein H  56.91 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.645617  normal  0.608002 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0618  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.475927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5228  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000143615  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0623  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0735032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5097  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4814  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 127 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00016491  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5135  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 127 aa  131  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00103553  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5130  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000365083  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3800  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3618  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5133  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 127 aa  131  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000135708  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3676  glycine cleavage system protein H  50.39 
 
 		 129 aa  131  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134478  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1698  glycine cleavage system H protein  51.2 
 
 		 126 aa  131  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3586  glycine cleavage system protein H  50.79 
 
 		 127 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000166607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>