72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_04990 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_04990  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  588  1e-167  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1329  hypothetical protein  43.71 
 
 		 315 aa  199  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6497  protein of unknown function DUF606  49.01 
 
 		 330 aa  199  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1366  protein of unknown function DUF606  42.19 
 
 		 333 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000130527 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0819  hypothetical protein  50.69 
 
 		 316 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0874  hypothetical protein  51.99 
 
 		 314 aa  173  2.9999999999999996e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2602  hypothetical protein  40.73 
 
 		 333 aa  142  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189409  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3818  hypothetical protein  31.15 
 
 		 323 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3740  hypothetical protein  31.15 
 
 		 323 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3751  putative inner membrane protein  31.15 
 
 		 323 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3920  putative inner membrane protein  31.15 
 
 		 323 aa  125  9e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.324261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3861  hypothetical protein  31.15 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1082  hypothetical protein  31.67 
 
 		 321 aa  122  8e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1512  protein of unknown function DUF606  38.27 
 
 		 365 aa  116  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.777644  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  26.72 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  25.55 
 
 		 297 aa  75.9  0.0000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12580  hypothetical protein  31.79 
 
 		 335 aa  72.4  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.616981 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0656  hypothetical protein  24.48 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.473315  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0641  hypothetical protein  24.48 
 
 		 309 aa  69.7  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  34.27 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  36.03 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  34.75 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  25.95 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  36.3 
 
 		 146 aa  58.9  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  36.11 
 
 		 147 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  40.44 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  37.24 
 
 		 146 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  35.92 
 
 		 156 aa  53.9  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  35.92 
 
 		 156 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1093  hypothetical protein  30.07 
 
 		 144 aa  51.2  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.962371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1092  hypothetical protein  33.33 
 
 		 163 aa  50.4  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  34.75 
 
 		 174 aa  49.7  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  29.5 
 
 		 148 aa  49.3  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2954  hypothetical protein  30.83 
 
 		 149 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2829  hypothetical protein  30.83 
 
 		 149 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  28.26 
 
 		 148 aa  48.9  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1547  protein of unknown function DUF606  30.83 
 
 		 149 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0320  hypothetical protein  33.58 
 
 		 146 aa  48.9  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2811  hypothetical protein  30.83 
 
 		 149 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.989638  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2578  protein of unknown function DUF606  31.06 
 
 		 144 aa  48.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0102  hypothetical protein  28.67 
 
 		 143 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  34.19 
 
 		 178 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0048  hypothetical protein  31.09 
 
 		 154 aa  47  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0915956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  35.04 
 
 		 170 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4730  protein of unknown function DUF606  33.05 
 
 		 147 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  0.0111323 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6155  hypothetical protein  31.88 
 
 		 148 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1920  hypothetical protein  32.88 
 
 		 147 aa  45.8  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  28.37 
 
 		 148 aa  45.8  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5534  hypothetical protein  36.44 
 
 		 149 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0822  hypothetical protein  28.81 
 
 		 160 aa  45.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  32.86 
 
 		 172 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0056  hypothetical protein  30 
 
 		 148 aa  45.4  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.99034  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  34.71 
 
 		 144 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63650  hypothetical protein  36.44 
 
 		 149 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0150824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1161  hypothetical protein  30.71 
 
 		 164 aa  45.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.275769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0091  hypothetical protein  30.14 
 
 		 148 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  31.72 
 
 		 178 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2345  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  44.3  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785933  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2577  protein of unknown function DUF606  28.81 
 
 		 183 aa  44.3  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  30.28 
 
 		 147 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0823  hypothetical protein  29.77 
 
 		 142 aa  43.5  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1329  hypothetical protein  29.66 
 
 		 154 aa  43.1  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.886868 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4918  hypothetical protein  31.76 
 
 		 177 aa  43.1  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2955  hypothetical protein  27.27 
 
 		 144 aa  43.1  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  30.99 
 
 		 184 aa  42.7  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  29.71 
 
 		 146 aa  42.7  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0792  hypothetical protein  26.51 
 
 		 305 aa  42.7  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.846156  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0371  hypothetical protein  35.11 
 
 		 153 aa  42.7  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0200  hypothetical protein  29.82 
 
 		 153 aa  42.4  0.009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0049  hypothetical protein  27.27 
 
 		 144 aa  42.7  0.009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0539536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1328  hypothetical protein  27.27 
 
 		 144 aa  42.4  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.880561 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  26.24 
 
 		 151 aa  42.4  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>