137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0056 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0056  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  281  2.0000000000000002e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.99034  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0091  hypothetical protein  66.22 
 
 
148 aa  189  8e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0198  protein of unknown function DUF606  57.43 
 
 
148 aa  159  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0102  hypothetical protein  56.43 
 
 
143 aa  145  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20760  hypothetical protein  50.71 
 
 
147 aa  138  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000416993  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1140  hypothetical protein  51.03 
 
 
147 aa  138  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3039  protein of unknown function DUF606  43.24 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  37.69 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  37.59 
 
 
146 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  37.31 
 
 
145 aa  79.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0202  protein of unknown function DUF606  34.33 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  28.38 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  32.09 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  36.69 
 
 
172 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  32.88 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  36.76 
 
 
174 aa  63.9  0.0000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2829  hypothetical protein  31.62 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2954  hypothetical protein  31.85 
 
 
149 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1547  protein of unknown function DUF606  31.82 
 
 
149 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  39.47 
 
 
170 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  32.06 
 
 
149 aa  60.5  0.000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  39.47 
 
 
178 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  35.77 
 
 
184 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2811  hypothetical protein  31.11 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.989638  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  32.59 
 
 
148 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2636  hypothetical protein  34.33 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000297964  normal  0.681431 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2693  hypothetical protein  34.07 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.320662  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2679  hypothetical protein  34.46 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1952  hypothetical protein  29.5 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00709257  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2936  hypothetical protein  30.77 
 
 
143 aa  56.2  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  33.07 
 
 
172 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  34.65 
 
 
172 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2577  protein of unknown function DUF606  29.03 
 
 
183 aa  56.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0048  hypothetical protein  30.65 
 
 
154 aa  55.5  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0915956  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  29.29 
 
 
318 aa  56.2  0.0000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1092  hypothetical protein  32 
 
 
163 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1299  hypothetical protein  29.6 
 
 
386 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2619  hypothetical protein  30 
 
 
143 aa  55.1  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0371  hypothetical protein  34.58 
 
 
153 aa  55.1  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1329  hypothetical protein  30.65 
 
 
154 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.886868 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  26.98 
 
 
147 aa  54.7  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  30.5 
 
 
151 aa  54.3  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3798  hypothetical protein  34.58 
 
 
153 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000122889  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0822  hypothetical protein  31.62 
 
 
160 aa  54.3  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5701  hypothetical protein  31.47 
 
 
145 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3765  hypothetical protein  32 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  30.77 
 
 
148 aa  52.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  31.01 
 
 
163 aa  53.1  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3163  hypothetical protein  29.92 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.539939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3229  membrane-spanning protein  29.13 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000183039  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2418  hypothetical protein  27.48 
 
 
141 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0326  hypothetical protein  36.36 
 
 
144 aa  52  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.649286  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3239  hypothetical protein  37.8 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  0.141274 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3471  hypothetical protein  29.13 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3482  hypothetical protein  29.13 
 
 
140 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0187664  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3256  hypothetical protein  29.13 
 
 
140 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0243517  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3166  membrane-spanning protein  29.13 
 
 
140 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.590312  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3511  hypothetical protein  29.13 
 
 
140 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2345  hypothetical protein  32.59 
 
 
152 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785933  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  28 
 
 
151 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  30.83 
 
 
156 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  33.81 
 
 
146 aa  51.6  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2211  hypothetical protein  30 
 
 
141 aa  51.6  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.309526  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  32.64 
 
 
148 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  30.83 
 
 
156 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1268  hypothetical protein  31.51 
 
 
147 aa  51.2  0.000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6145  hypothetical protein  29.86 
 
 
148 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3455  hypothetical protein  29.13 
 
 
140 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.229376  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  33.1 
 
 
146 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1920  hypothetical protein  31.25 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.370754  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2367  hypothetical protein  28.12 
 
 
141 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4918  hypothetical protein  28.99 
 
 
177 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0108975 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1317  hypothetical protein  30.94 
 
 
162 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2119  hypothetical protein  31.71 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.519776  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0761  hypothetical protein  30.5 
 
 
151 aa  49.7  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1793  hypothetical protein  28.35 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0823  hypothetical protein  29.66 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2965  hypothetical protein  27.48 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.108015  normal  0.0601681 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  28.26 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1459  protein of unknown function DUF606  35.94 
 
 
149 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  34.15 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3609  hypothetical protein  31.37 
 
 
176 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4220  hypothetical protein  35.71 
 
 
315 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.285237 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0867  protein of unknown function DUF606  25 
 
 
144 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3463  hypothetical protein  27.56 
 
 
140 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0977859  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0200  hypothetical protein  38.75 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0370  hypothetical protein  29.01 
 
 
163 aa  47.4  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6653  protein of unknown function DUF606  32.85 
 
 
144 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.508565  normal  0.0277102 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  25.53 
 
 
147 aa  47.4  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3164  hypothetical protein  33.93 
 
 
154 aa  47.8  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.392436  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0641  hypothetical protein  36.9 
 
 
309 aa  47  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0656  hypothetical protein  36.9 
 
 
309 aa  47  0.00008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.473315  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  30.28 
 
 
144 aa  47  0.00009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  29.41 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0326  hypothetical protein  31.25 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.845681  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3456  hypothetical protein  34.55 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.131683  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2106  protein of unknown function DUF606  31.58 
 
 
147 aa  45.4  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0923123 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2963  hypothetical protein  29.01 
 
 
156 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.41688  normal  0.045431 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3033  hypothetical protein  27.69 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.17794  normal  0.759539 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3799  hypothetical protein  28.24 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000162069  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>