52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6497 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6497  protein of unknown function DUF606  100 
 
 		 330 aa  615  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0819  hypothetical protein  57.64 
 
 		 316 aa  237  2e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0874  hypothetical protein  57.76 
 
 		 314 aa  216  5e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1329  hypothetical protein  45.72 
 
 		 315 aa  205  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04990  hypothetical protein  48.61 
 
 		 318 aa  196  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1366  protein of unknown function DUF606  44.92 
 
 		 333 aa  189  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000130527 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1082  hypothetical protein  34.93 
 
 		 321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3920  putative inner membrane protein  34.59 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.324261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3740  hypothetical protein  34.59 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3818  hypothetical protein  34.59 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3751  putative inner membrane protein  34.59 
 
 		 323 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3861  hypothetical protein  34.59 
 
 		 322 aa  173  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1512  protein of unknown function DUF606  44.69 
 
 		 365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.777644  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2602  hypothetical protein  44.14 
 
 		 333 aa  132  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189409  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12580  hypothetical protein  34.85 
 
 		 335 aa  94.4  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.616981 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  29.24 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  25.55 
 
 		 307 aa  61.6  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  29.38 
 
 		 172 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  34.56 
 
 		 145 aa  57  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  27.4 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  29.05 
 
 		 148 aa  57  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  33.97 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  33.8 
 
 		 156 aa  55.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  38.13 
 
 		 149 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  33.8 
 
 		 156 aa  54.3  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  33.81 
 
 		 148 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  31.39 
 
 		 317 aa  54.3  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  28.1 
 
 		 147 aa  53.5  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  32.26 
 
 		 146 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  33.08 
 
 		 146 aa  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  30.28 
 
 		 184 aa  50.1  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  30.71 
 
 		 145 aa  49.7  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  21.01 
 
 		 297 aa  50.1  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  29.73 
 
 		 146 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  31.34 
 
 		 172 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3721  hypothetical protein  37.66 
 
 		 148 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.230408  normal  0.105166 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  31.29 
 
 		 178 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4323  hypothetical protein  38.96 
 
 		 163 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313057  normal  0.0982229 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  26.24 
 
 		 146 aa  48.5  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1974  hypothetical protein  32.64 
 
 		 176 aa  47.8  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2106  protein of unknown function DUF606  35.59 
 
 		 147 aa  47.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0923123 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  31.82 
 
 		 172 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5052  protein of unknown function DUF606  31.39 
 
 		 147 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.691333 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  30.21 
 
 		 151 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3609  hypothetical protein  36.49 
 
 		 176 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4539  hypothetical protein  30.66 
 
 		 147 aa  44.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.194485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3563  protein of unknown function DUF606  36.36 
 
 		 148 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.452592  normal  0.0941326 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2954  hypothetical protein  28.29 
 
 		 149 aa  43.9  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0326  hypothetical protein  32.58 
 
 		 132 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.845681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2829  hypothetical protein  28.29 
 
 		 149 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1547  protein of unknown function DUF606  28.29 
 
 		 149 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4999  protein of unknown function DUF606  29.93 
 
 		 147 aa  43.5  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>