107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2829 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_2829  hypothetical protein  100 
 
 
149 aa  298  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2954  hypothetical protein  99.33 
 
 
149 aa  295  2e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2811  hypothetical protein  97.99 
 
 
149 aa  291  2e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.989638  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1547  protein of unknown function DUF606  97.99 
 
 
149 aa  291  2e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2577  protein of unknown function DUF606  78.38 
 
 
183 aa  237  2.9999999999999997e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1092  hypothetical protein  79.87 
 
 
163 aa  236  6.999999999999999e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1329  hypothetical protein  74.32 
 
 
154 aa  228  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.886868 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0048  hypothetical protein  74.5 
 
 
154 aa  223  7e-58  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0915956  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3765  hypothetical protein  63.91 
 
 
151 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0822  hypothetical protein  57.35 
 
 
160 aa  149  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  41.01 
 
 
144 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2955  hypothetical protein  36.11 
 
 
144 aa  94  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2830  hypothetical protein  35.42 
 
 
144 aa  92.8  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0202  protein of unknown function DUF606  36.51 
 
 
142 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1546  protein of unknown function DUF606  34.72 
 
 
144 aa  91.3  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1093  hypothetical protein  34.75 
 
 
144 aa  90.9  5e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.962371  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2578  protein of unknown function DUF606  35.43 
 
 
144 aa  86.3  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1459  protein of unknown function DUF606  36.24 
 
 
149 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2952  protein of unknown function DUF606  31.72 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3766  hypothetical protein  36.43 
 
 
162 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  32.37 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0049  hypothetical protein  30.5 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0539536  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2636  hypothetical protein  31.58 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000297964  normal  0.681431 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  31.75 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  29.66 
 
 
148 aa  69.7  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1328  hypothetical protein  30.5 
 
 
144 aa  69.3  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.880561 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20760  hypothetical protein  30.08 
 
 
147 aa  68.2  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000416993  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  31.62 
 
 
145 aa  67  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21090  hypothetical protein  35.48 
 
 
151 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.577572  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0823  hypothetical protein  34.17 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0091  hypothetical protein  30.94 
 
 
148 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2679  hypothetical protein  31.62 
 
 
145 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  30.14 
 
 
172 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0056  hypothetical protein  31.5 
 
 
148 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.99034  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  31.62 
 
 
318 aa  60.8  0.000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  26.03 
 
 
151 aa  60.5  0.000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0102  hypothetical protein  28.24 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  30.28 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  32.26 
 
 
146 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  31.85 
 
 
149 aa  57  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1161  hypothetical protein  30.66 
 
 
164 aa  56.6  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.275769  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1140  hypothetical protein  30.77 
 
 
147 aa  56.6  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1162  hypothetical protein  35.9 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  27.01 
 
 
307 aa  54.7  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  34.35 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  33.09 
 
 
178 aa  54.3  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1800  hypothetical protein  33.06 
 
 
151 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  27.59 
 
 
147 aa  53.9  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0198  protein of unknown function DUF606  28.37 
 
 
148 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  33.04 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  30.5 
 
 
317 aa  52.4  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1669  protein of unknown function DUF606  33.01 
 
 
178 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304547  normal  0.52087 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0520  protein of unknown function DUF606  25.47 
 
 
138 aa  51.6  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000146462  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  33.08 
 
 
184 aa  51.2  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  30.28 
 
 
174 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  29.69 
 
 
151 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6155  hypothetical protein  27.08 
 
 
148 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3039  protein of unknown function DUF606  26.89 
 
 
147 aa  50.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  31.3 
 
 
156 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2936  hypothetical protein  28.57 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5534  hypothetical protein  30.99 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2619  hypothetical protein  27.73 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1692  hypothetical protein  27.52 
 
 
147 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.191428 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1394  hypothetical protein  31.07 
 
 
170 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.492463  hitchhiker  0.00247418 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63650  hypothetical protein  30.28 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0150824  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  30.53 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3818  hypothetical protein  27.74 
 
 
323 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3861  hypothetical protein  27.74 
 
 
322 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3740  hypothetical protein  27.74 
 
 
323 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3751  putative inner membrane protein  27.74 
 
 
323 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3920  putative inner membrane protein  27.74 
 
 
323 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.324261  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1082  hypothetical protein  28.76 
 
 
321 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  29.93 
 
 
146 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0252  hypothetical protein  25.17 
 
 
147 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1974  hypothetical protein  28.15 
 
 
176 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04990  hypothetical protein  29.51 
 
 
318 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0641  hypothetical protein  30.16 
 
 
309 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0656  hypothetical protein  30.16 
 
 
309 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.473315  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  27.34 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0792  hypothetical protein  25.58 
 
 
305 aa  44.3  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.846156  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2381  protein of unknown function DUF606  24.31 
 
 
146 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4040  protein of unknown function DUF606  26.21 
 
 
148 aa  44.7  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000995458 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  22.31 
 
 
297 aa  43.9  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2345  hypothetical protein  30.47 
 
 
152 aa  43.9  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.785933  normal  0.151538 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1317  hypothetical protein  23.65 
 
 
162 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2211  hypothetical protein  25.93 
 
 
141 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.309526  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  27.91 
 
 
172 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  27.05 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3901  protein of unknown function DUF606  29.32 
 
 
147 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.936435  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  30.77 
 
 
172 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1952  hypothetical protein  28.91 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00709257  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3609  hypothetical protein  29.32 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4539  hypothetical protein  32.79 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.194485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4999  protein of unknown function DUF606  32.79 
 
 
147 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0370  hypothetical protein  28.75 
 
 
163 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1268  hypothetical protein  27.74 
 
 
147 aa  41.6  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3609  hypothetical protein  26.89 
 
 
176 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.448392  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2131  protein of unknown function DUF606  28.18 
 
 
158 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3799  hypothetical protein  28.75 
 
 
163 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000162069  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0418  protein of unknown function DUF606  24.14 
 
 
146 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.47239 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>