49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1082 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1082  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  637    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3751  putative inner membrane protein  93.46 
 
 		 323 aa  600  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3740  hypothetical protein  93.77 
 
 		 323 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3920  putative inner membrane protein  93.77 
 
 		 323 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.324261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3861  hypothetical protein  93.46 
 
 		 322 aa  600  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3818  hypothetical protein  93.77 
 
 		 323 aa  603  1.0000000000000001e-171  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1329  hypothetical protein  37.58 
 
 		 315 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1366  protein of unknown function DUF606  36.86 
 
 		 333 aa  172  5.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000130527 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6497  protein of unknown function DUF606  34.55 
 
 		 330 aa  152  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0819  hypothetical protein  37.41 
 
 		 316 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0874  hypothetical protein  37.84 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04990  hypothetical protein  31.8 
 
 		 318 aa  108  9.000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1512  protein of unknown function DUF606  30.84 
 
 		 365 aa  75.1  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.777644  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2602  hypothetical protein  30 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189409  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12580  hypothetical protein  33.01 
 
 		 335 aa  69.3  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.616981 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  29.03 
 
 		 317 aa  68.6  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  25.5 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1161  hypothetical protein  25.52 
 
 		 164 aa  53.9  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.275769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1299  hypothetical protein  24.46 
 
 		 386 aa  53.9  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  22.26 
 
 		 297 aa  52.8  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  29.49 
 
 		 156 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  29.49 
 
 		 156 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  27.39 
 
 		 307 aa  52  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  27.03 
 
 		 149 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  30.77 
 
 		 146 aa  50.8  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2825  hypothetical protein  28.57 
 
 		 172 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0792  hypothetical protein  30.14 
 
 		 305 aa  50.4  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.846156  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1923  protein of unknown function DUF606  29.51 
 
 		 147 aa  49.3  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000281356  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  24.32 
 
 		 147 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2106  protein of unknown function DUF606  26.89 
 
 		 147 aa  48.5  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0923123 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2829  hypothetical protein  28.76 
 
 		 149 aa  47.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4730  protein of unknown function DUF606  24.65 
 
 		 147 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.666012  normal  0.0111323 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2954  hypothetical protein  28.76 
 
 		 149 aa  47.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1547  protein of unknown function DUF606  28.76 
 
 		 149 aa  47  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2811  hypothetical protein  28.76 
 
 		 149 aa  47.4  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.989638  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0200  hypothetical protein  29.41 
 
 		 153 aa  47.4  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  24.67 
 
 		 178 aa  46.6  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  29.93 
 
 		 144 aa  47  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4583  protein of unknown function DUF606  28.45 
 
 		 148 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal  0.0675209 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4213  hypothetical protein  28.45 
 
 		 148 aa  45.8  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.187648  normal  0.19224 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0814  protein of unknown function DUF606  27.15 
 
 		 148 aa  45.1  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0268  hypothetical protein  26.35 
 
 		 146 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3434  protein of unknown function DUF606  27.27 
 
 		 148 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2306  hypothetical protein  27.01 
 
 		 172 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.385132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5246  hypothetical protein  28.66 
 
 		 184 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.197347 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1974  hypothetical protein  28.1 
 
 		 176 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3106  hypothetical protein  26.67 
 
 		 172 aa  43.1  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  25 
 
 		 144 aa  42.7  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  24.82 
 
 		 151 aa  42.4  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>