28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_12580 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_12580  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  617  1e-176  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.616981 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1366  protein of unknown function DUF606  33.11 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000130527 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6497  protein of unknown function DUF606  34.98 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1329  hypothetical protein  30.6 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2602  hypothetical protein  31.6 
 
 		 333 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189409  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1082  hypothetical protein  33.01 
 
 		 321 aa  77.8  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0819  hypothetical protein  32.76 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3740  hypothetical protein  32.2 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3920  putative inner membrane protein  32.2 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.324261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3751  putative inner membrane protein  30.3 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3818  hypothetical protein  32.2 
 
 		 323 aa  73.6  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3861  hypothetical protein  30.3 
 
 		 322 aa  73.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0874  hypothetical protein  32.53 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04990  hypothetical protein  31.79 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  29.91 
 
 		 151 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5701  hypothetical protein  27.08 
 
 		 145 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1299  hypothetical protein  27.01 
 
 		 386 aa  51.6  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  35.4 
 
 		 146 aa  50.4  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6653  protein of unknown function DUF606  27.59 
 
 		 144 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.508565  normal  0.0277102 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1137  hypothetical protein  34.86 
 
 		 149 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.206431  normal  0.232987 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0539  protein of unknown function DUF606  31.03 
 
 		 147 aa  46.6  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.907326  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  33.62 
 
 		 149 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0792  hypothetical protein  24.88 
 
 		 305 aa  43.9  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.846156  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3798  hypothetical protein  27.94 
 
 		 153 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000122889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1512  protein of unknown function DUF606  29.25 
 
 		 365 aa  43.1  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.777644  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0048  hypothetical protein  29.92 
 
 		 154 aa  43.1  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0915956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  31.08 
 
 		 147 aa  42.7  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0371  hypothetical protein  28.03 
 
 		 153 aa  42.7  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>