48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0819 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0819  hypothetical protein  100 
 
 
316 aa  574  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0374787 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0874  hypothetical protein  90.03 
 
 
314 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6497  protein of unknown function DUF606  57.67 
 
 
330 aa  263  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1329  hypothetical protein  46.51 
 
 
315 aa  209  7e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04990  hypothetical protein  50.52 
 
 
318 aa  197  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1366  protein of unknown function DUF606  45.28 
 
 
333 aa  193  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000130527 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1082  hypothetical protein  37.5 
 
 
321 aa  165  8e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3751  putative inner membrane protein  36.81 
 
 
323 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3920  putative inner membrane protein  36.81 
 
 
323 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.324261  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3740  hypothetical protein  36.81 
 
 
323 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3818  hypothetical protein  36.81 
 
 
323 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3861  hypothetical protein  36.81 
 
 
322 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1512  protein of unknown function DUF606  43.31 
 
 
365 aa  150  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.777644  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2602  hypothetical protein  38.98 
 
 
333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189409  normal  0.971283 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12580  hypothetical protein  33.33 
 
 
335 aa  87  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.616981 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0276  hypothetical protein  25.94 
 
 
297 aa  65.5  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0196948  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0835  hypothetical protein  33.82 
 
 
317 aa  59.3  0.00000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2106  protein of unknown function DUF606  41.46 
 
 
147 aa  57.4  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0923123 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1919  hypothetical protein  25.87 
 
 
307 aa  56.6  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2509  protein of unknown function DUF606  36.76 
 
 
144 aa  53.5  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2001  hypothetical protein  24.29 
 
 
318 aa  53.1  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1299  hypothetical protein  21.43 
 
 
386 aa  52  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0036  hypothetical protein  34.48 
 
 
145 aa  51.6  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2916  hypothetical protein  31.25 
 
 
151 aa  50.4  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4141  hypothetical protein  36.09 
 
 
156 aa  49.3  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7394  hypothetical protein  36.09 
 
 
156 aa  49.3  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0620055  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3639  hypothetical protein  33.57 
 
 
174 aa  48.9  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1865  protein of unknown function DUF606  36.96 
 
 
144 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.522195 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3699  hypothetical protein  32.61 
 
 
146 aa  48.9  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3798  hypothetical protein  30.71 
 
 
153 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000122889  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3013  protein of unknown function DUF606  34.55 
 
 
146 aa  48.5  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.442084  normal  0.195062 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0371  hypothetical protein  30.5 
 
 
153 aa  46.6  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1547  protein of unknown function DUF606  33.87 
 
 
149 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1092  hypothetical protein  32.33 
 
 
163 aa  46.2  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0485  hypothetical protein  31.69 
 
 
178 aa  46.2  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.482808  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2829  hypothetical protein  33.33 
 
 
149 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0378  protein of unknown function DUF606  28.29 
 
 
147 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0012  protein of unknown function DUF606  32.65 
 
 
151 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4070  hypothetical protein  33.63 
 
 
145 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000215234  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2577  protein of unknown function DUF606  32.82 
 
 
183 aa  45.4  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0736  hypothetical protein  35.29 
 
 
149 aa  45.1  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.300113  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2811  hypothetical protein  33.33 
 
 
149 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.989638  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2954  hypothetical protein  33.33 
 
 
149 aa  45.1  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0533653 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0641  hypothetical protein  22.63 
 
 
309 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0656  hypothetical protein  22.63 
 
 
309 aa  44.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.473315  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2679  hypothetical protein  32.43 
 
 
145 aa  43.1  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0822  hypothetical protein  32 
 
 
160 aa  42.7  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0048  hypothetical protein  32.77 
 
 
154 aa  42.4  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0915956  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>